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Qu'est-ce qu'une apomorphie ? Qu'est-ce qu'une plésiomorphie ? Quelqu'un peut-il confirmer ces définitions?

Qu'est-ce qu'une apomorphie ? Qu'est-ce qu'une plésiomorphie ? Quelqu'un peut-il confirmer ces définitions?


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Je veux connaître les définitions correctes des termes apomorphie et plésiomorphie. Malheureusement, il semble y avoir une variété de façons de définir ces termes en fonction de la langue que l'on utilise. Ainsi, il a été difficile de déterminer les définitions correctes. J'ai opté pour des définitions qui me semblent correctes et j'ai aussi des exemples. Je voudrais la confirmation de quelqu'un si je comprends correctement les définitions.

  • Apomorphie -- tout état de caractère ou trait nouveau pour une espèce et ses descendants. Une apomorphie se produit lorsqu'un taxon est sélectionné pour avoir un trait particulier. Exemple: au sein de la classe reptilia, le sous-ordre des serpentes (serpents) a une apomorphie car ses membres n'ont pas de pattes.
  • Plésiomorphie -- un trait évolutif ou un état de caractère qui est homologue au sein d'un taxon particulier mais n'est pas unique aux membres de ce groupe et ne peut donc pas être utilisé comme caractère de diagnostic pour le groupe. Exemple: au sein de la classe reptilia, les pattes sont une plésiomorphie pour ses membres.

Ma question:

Ces définitions et exemples sont-ils exacts ?


Cela sonne plutôt bien. Sur ce genre de choses, wikipédia est très fiable. Vous pouvez aussi regarder cette page très synthétique :

https://www.enotes.com/homework-help/distinguish-between-synapomorphy-apomorphy-304128


L'apomorphie peut simplement être définie comme trait dérivé ou état de caractère qui est distinct d'une espèce ou d'un groupe particulier dans un arbre phylogénétique jusqu'à ses descendants. L'exemple que vous citez est très bien.

La plésiomorphie est une ancestral ou des traits primitifs qui sont homologues à un certain groupe d'organismes mais non uniques aux autres membres du groupe, ne peuvent donc pas être utilisés comme caractère diagnostique pour le groupe.


Cinquante nuances de cladisme

Quinn (Biol Philos 32 : 581–598, 2017) a proposé sept définitions de « cladiste » et a discuté du contexte dans lequel elles sont utilisées en relation avec les débats historiques et actuels en systématique. En tant que membre de son taxon d'étude, j'offre quelques commentaires contextuels sur les couleurs, des éclaircissements sur les points de vue des « cladistes de modèle » concernant la monophylie, les ancêtres, la synapomorphie et d'autres concepts, une définition de « syncretiste » et quelques réflexions sur la cladistique et la philosophie dans le vingt-et-unième siècle.

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Examen de biologie

2. L'étape suivante entraîne une divergence dans les traits tels que
système d'accouplement ou utilisation de l'habitat, etc.

- Modèles trouvés soutenant l'hypothèse de dispersion et de colonisation

1. Les fréquences alléliques dans une population ne changeront pas génération après génération

Supposons une seule population isolée sans flux génétique

Évité si la population est infiniment grande

Augmente la fréquence des homozygotes
Diminue la fréquence des hétérozygotes

Ne conduit pas à l'adaptation

Pas la même chose que le mouvement saisonnier

Presque chassé en Amérique du Nord jusqu'à l'extinction, peu d'individus ont laissé la population reconstituée

En raison de l'effet fondateur, la diversité génétique est maintenant limitée

Moins de variation dans la diversité

Compression autour de la moyenne

Diminution des hétérozygotes (Aa)

Coupe le haut de la distribution des traits en augmentant la variance

Déplace la valeur moyenne du phénotype vers la gauche ou la droite

La forme physique augmente ou diminue constamment avec la valeur d'un trait

2. Déterminer l'ordre et la polarité des caractères

3. Coder les caractères et construire une matrice

4. Regroupement par synapomorphies (hypothèse phylogénétique)

5. Résoudre les problèmes possibles (parcimonie)

2) L'utilisation d'épices devrait être plus importante dans les climats chauds, où les aliments non réfrigérés se gâtent


Qu'est-ce qu'une apomorphie ? Qu'est-ce qu'une plésiomorphie ? Quelqu'un peut-il confirmer ces définitions? - La biologie

Le but de la systématique : La diversité des êtres vivants nous présente une variété apparemment infinie. La science de la systématique est vouée à l'identification et à l'ordonnancement de la diversité des êtres vivants.

Mais d'abord, d'où vient la diversité ?

Pas de ça !

  • Il ne reflète pas la prévalence de lignées ramifiées comme source de diversité évolutive.
  • Il reflète l'hypothèse évolutive précoce de Lamarck impliquant de multiples créations asynchrones de lignées qui évoluent le long d'une trajectoire fixe (slime -> vers -> insectes -> poissons -> reptiles -> mammifères -> humains.)
  • Il reflète l'ancien concept de la Scala Naturae ou Grande chaîne de l'être, proposé pour la première fois par Platon et adopté par les érudits de l'Antiquité classique et du Moyen Âge, qui classaient la matière des minéraux aux anges.

Heureusement la vraie vie est plus intéressante.
Lignées : Qu'est-ce qu'une lignée : = un groupe de métissage d'organismes se reproduisant sexuellement projetés à travers le temps.

  • Par métissage, je ne veux pas dire que tout le monde s'accouple avec tout le monde, mais qu'à long terme, il n'y a pas de barrière au flux génétique dans la population.
    • Les autres organismes qui ne contribuent pas aux gènes d'une lignée ne sont pas considérés comme membres. Il peut s'agir d'organismes qui ne se reproduisent tout simplement jamais (par exemple, les humains et les gorilles) ou d'organismes qui se reproduisent mais ne produisent pas de progéniture fertile. Les chevaux et les ânes peuvent être trompés par les humains et amenés à se croiser, produisant des mules stériles.
    • Notez que les limites d'une lignée peuvent être floues :
      Les mules sont généralement stériles, mais une fois dans la lune bleue, elles sont fertiles. La quantité de flux de gènes qui se produit entre les chevaux et les ânes de cette manière est négligeable, et nous les considérons comme des lignées distinctes.
    • Les aires de répartition de certaines espèces peuvent même se rencontrer dans de larges zones hybrides le long desquelles se produisent des croisements, produisant une progéniture hybride relativement inapte. Même ainsi, la zone hybride est généralement une barrière au flux de gènes entre les populations primaires. (Par exemple la zone hybride de la corneille noire et de la corneille à capuchon en Eurasie.

    Le premier arbre de l'évolution d'un carnet de Charles Darwin de victorianweb.org

    Spéciation

    • Si nous plaçons ici une barrière physique entre les membres de notre lignée, alors :
      • les individus d'un côté de la barrière seraient privés du matériel génétique de l'autre côté, ainsi les modifications survenues dans un groupe ne pourraient pas être transmises aux autres
      • Les populations des différents côtés de la barrière commenceraient à accumuler différents ensembles de modifications.
      • Ultimes, ils pourraient diverger morphologiquement au point que s'ils rétablissaient jamais le contact, les deux groupes seraient suffisamment dissemblables pour qu'ils ne puissent pas ou ne voudraient pas s'accoupler et produire une progéniture fertile. À ce stade, leur séparation aurait été rendue permanente.
        Spéciation allopatrique : Les membres d'une population sont géographiquement séparés soit par un événement de dispersion, soit par la création d'une barrière entre eux.
          une. Exemple d'anciennes : Bernaches du Canada et Nene ou oies hawaïennes.
          b. Exemple de ce dernier : De nombreux oiseaux chanteurs d'Amérique du Nord, p. le geai bleu (à droite) et le geai de Steller.
          une. Acheta : Dans l'est des États-Unis, il existe deux espèces de grillons gris qui dériveraient d'un ancêtre commun récent. Dans les deux cas, les juvéniles sont extrêmement vulnérables au froid. Leurs réponses à ce problème diffèrent. Une espèce s'accouple à l'automne, des œufs sont pondus qui hivernent et les adultes meurent. Les autres hivernent au stade adulte et s'accouplent au printemps. À l'automne suivant, les juvéniles grandissent et hivernent à l'état adulte. L'ancêtre commun vivait dans un climat plus chaud et s'accouplait toute l'année.
          b. Busycon (à droite) : L'apparition soudaine de la sinistralité (à droite) chez les escargots marins empêche l'accouplement entre les individus dextre et senestre.
        • Taxons terminaux : les organismes A, B et C aux extrémités des ramifications.
        • lignages évolutifs : Les segments de ligne du graphique.
        • Nœuds: points de branchement représentant des événements de division de lignage ou événements de spéciation. Ceux-ci représentent le dernier ancêtre commun des descendants représentés au-dessus.

        Notez que dans un cladogramme, peu importe que les choses apparaissent à gauche ou à droite. Ce qui compte, c'est la séquence des événements de branchement (c'est-à-dire ceux qui apparaissent en haut ou en bas). Dans la figure de droite, les cladogrammes 1 et 2 représentent exactement les mêmes relations, alors que le cladogramme 3 est différent.

        Noter: Les taxons dont les relations sont indiquées ci-dessus, A, B et C peuvent être des espèces individuelles ou ils peuvent, eux-mêmes, être des groupes taxonomiques dont les relations entre les membres pourraient être montrées avec son propre cladogramme.

        • Une hiérarchie de groupes imbriqués
        • Un principe d'organisation.

        Par exemple, dans nos vies, nous avons tous employé le système taxonomique dans lequel les animaux sont classés selon le principe d'organisation de leur utilité pour l'homme. En général, il y a peu d'ambiguïté.


        Problème : Les critères que nous utilisons pour classer les animaux selon ce système sont arbitraires et subjectifs. Par exemple:

        Un passionné de reptiles pourrait classer un python vert comme animal de compagnie, alors qu'une personne terrifiée par les serpents l'appellerait de la vermine, et un entrepreneur qui élève des reptiles pour le commerce des animaux le considérerait comme du bétail.

        Idéalement, nous aimerions avoir un principe d'organisation naturel et non arbitraire pour un système taxonomique que les scientifiques naturels peuvent utiliser. Un tel principe est fourni par le modèle d'évolution. Pour le comprendre, vous devez d'abord comprendre les conventions d'affichage graphique du modèle d'évolution.

        Le système taxonomique phylogénétique : Les groupes taxonomiques peuvent être nommés et définis en fonction de leur descendance d'un ancêtre commun. Le cladogramme de droite montre les relations réelles entre plusieurs grands groupes de vertébrés.

        À partir de ce cladogramme, les systématiciens ont nommé les groupes taxonomiques suivants :

        Dans ce dessin, nous avons dessiné des cercles autour des groupes qui pourraient être définis par les relations montrées sur ce cladogramme, et indiqué leurs noms. Normalement, on écrirait simplement les noms de groupe à côté du nœud du dernier ancêtre commun :

        • Une hiérarchie de groupes imbriqués, avec ceux qui descendent d'ancêtres communs plus récents étant imbriqués dans ceux qui descendent d'ancêtres plus éloignés. Par exemple, "Tetrapoda", l'ancêtre commun des vertébrés terrestres et de ses descendants, est niché dans "Choanata", l'ancêtre commun des vertébrés avec choanes et tous ses descendants.
        • Un principe organisateur, le modèle de ramification de l'évolution elle-même.

          * Mémorisez * cette définition : Un groupe monophylétique est un ancêtre et TOUS ses descendants.

        Remarque : Vous connaissez peut-être deux types de groupes non monophylétiques :

        Attention : Seuls les groupes monophylétiques reposent exclusivement sur des critères naturels et non arbitraires. Lorsque nous définissons un groupe paraphylétique, nous devons décider arbitrairement quels descendants exclure. Dans le cas des groupes polyphylétiques, nous devons décider quels ancêtres laisser de côté.

        Le système phylogénétique de taxonomie : Le principe organisateur de la biologie moderne est l'évolution (descente avec modification). En fin de compte, l'évolution implique que tous les êtres vivants descendent d'un seul ancêtre commun. L'histoire de ces lignées est leur phylogénie. (On sait déjà le dessiner). Ceci fournit le principe d'organisation utilisé par les systématiciens modernes. Il est hiérarchique car les groupes descendants d'ancêtres communs très récents peuvent être imbriqués dans des groupes descendants d'ancêtres communs éloignés.

        Analyse de caractère

        Une utilité évidente des cladogrammes est que nous pouvons cartographier les changements évolutifs sur eux. Au fur et à mesure que les lignées évoluent, les caractères de leurs membres changent. C'est à dire. ils vont des états ancestraux aux états dérivés.

        • Plésiomorphie: L'état de caractère ancestral - hérité d'ancêtres lointains. PAR EXEMPLE. Du point de vue des primates, avoir cinq doigts est une plésiomorphie. (Symplésiomorphies sont des "états ancestraux partagés".)
        • Apomorphies: Un état de caractère dérivé (évolué). PAR EXEMPLE. Du point de vue des Primates, avoir un pouce opposable est une apomorphie.
          • Synapomorphies: sont des "états dérivés partagés". PAR EXEMPLE. la présence d'un pouce opposable est une synapomorphie d'humains, de chimpanzés, de singes, de lémuriens et d'autres lignées de primates.
          • Autapomorphies: état de caractère dérivé unique. PAR EXEMPLE. La boîte crânienne agrandie des humains est une autapomorphie, non partagée avec d'autres animaux.

          L'histoire de la systématique phylogénétique (cladistique)

          Idéalement, nous aimerions avoir un principe d'organisation naturel et non arbitraire pour un système taxonomique que les scientifiques naturels peuvent utiliser. En effet, Darwin, dans l'Origine a noté que le système de taxonomie linnéen, basé sur la similitude générale, devrait être remplacé par un système basé sur la proximité d'ascendance commune. Hélas, sur le plan pratique, une telle entreprise était impossible jusqu'à l'invention des ordinateurs numériques.

            Taxonomie numérique (Phénétique) : Introduite par Robert Sokal et Peter Sneath à la fin des années 1950. Tentative de baser la classification sur la similitude seule, considérant l'arbre de l'évolution comme fondamentalement inconnaissable. Souvent appelé Phénétique. Les phénéticiens ont tendance à utiliser des mesures numériques continues dans des analyses statistiques multivariées pour identifier des groupes.

          Au milieu des années 1970, la cladistique avait éclipsé la phénétique. Dans les années 90, c'était l'école dominante de la pensée taxonomique. En Amérique du Nord, les années 1980 ont été l'ère grisante de la révolution taxonomique au cours de laquelle les révolutionnaires cladistiques d'institutions telles que l'Université de Californie à Berkeley et le Musée américain d'histoire naturelle ont façonné l'avenir de la systématique. Un document révélateur de cette époque est :

          Concepts clés de DeQueiroz 1988 :


          PERSONNAGES CONTRE LEURS JETONS

          Certains des problèmes décrits ci-dessus peuvent provenir du fait que des symboles comme « 0 » et « - » (comme signe « moins ») ont des associations connotatives avec des concepts tels que l'absence ou la perte, qui proviennent d'usages dans d'autres (c'est-à-dire non- contextes phylogénétiques). Un fil conducteur parmi ces problèmes est l'implication que « 0 » est traité comme étant intrinsèquement différent de tout état différent de zéro, peut-être même en remplacement de la primitivité. C'est peut-être le résultat de l'utilisation fréquente de « 0 » pour les états du taxon racine par convention. Il se peut que la convention soit parfois confondue (consciemment ou inconsciemment) avec une nécessité procédurale. Le but de l'examen de certains détails des algorithmes de comptage phylogénétique plus tôt était de souligner le fait que les jetons n'indiquent qu'une identité. Cela permet d'évaluer non seulement en quoi les procédures de notation ci-dessus sont problématiques, mais aussi comment nous choisissons parmi d'autres moyens de traiter ces problèmes, comme décrit dans la section suivante.

          Il est important de ne pas confondre « 0 » avec une déclaration de primitivité lors de la rédaction des listes de caractères et des matrices de notation, en particulier pour les caractères non ordonnés. En théorie, cela ne fait aucune différence que l'absence soit représentée par « - », « + », « 0 » ou « 1 ». En supposant que vous n'ayez pas ordonné ou pondéré de caractères, vous pouvez échanger toutes les instances de « 0 » contre « 1 » et vice versa et vous obtiendrez toujours le même résultat qu'avant. La seule chose qui compte est que les taxons qui partagent les mêmes conditions soient codés de la même manière. En raison des hypothèses par défaut de symétrie transformationnelle, il n'y a pas de différence entre les scores 0 et les scores non 0 lorsque l'évaluation d'un coût de transformation a lieu. Les états 1, 2, 3, etc., ne sont pas des états dérivés tant qu'une analyse phylogénétique n'a pas été effectuée et n'a pas renvoyé ce résultat, et l'algorithme de Fitch n'ajoutera aucune étape supplémentaire si chacun apparaît indépendamment dans l'arbre ou ensemble. De même, l'état 0 n'est pas « l'état plésiomorphe » simplement parce qu'il est étiqueté 0. « Dérivé » et « plésiomorphe » sont des propriétés qui sont exposées lorsque l'algorithme phylogénétique attribue les valeurs optimales des caractères aux nœuds internes. Ils peuvent être représentés par n'importe quel jeton choisi par l'investigateur. Il est de la responsabilité de l'investigateur de s'assurer que les jetons reflètent avec précision les informations de caractère d'une manière vraiment symétrique car l'algorithme de parcimonie (à moins que des commandes spécifiques ne soient données autrement) traitera les transformations de caractère de manière symétrique. La conséquence de ne pas tenir compte de cette symétrie sera une perte d'informations de regroupement.


          Fossiles vivants

          Le principal malentendu à traiter ici est qu'aucun être vivant n'est "plus évolué" qu'un autre. Qu'il s'agisse d'une bactérie ou d'un être humain, les deux partagent un ancêtre commun il y a au moins 3,4 milliards d'années, et les deux ont évolué depuis.

          Vraiment, il y a une fascination pour certains organismes &ndash un brachiopode appelé Lingula, limules, coelacanthes, le tuatara de Nouvelle-Zélande, . &ndash qui semblent peu changés par rapport à leurs ancêtres fossilisés, mais ce n'est en réalité qu'une vanité. Pour citer le livre de Richard Fortey&rsquos, Survivants &ldquo. J'ai été assez prudent en utilisant trop facilement l'étiquette &lsquoliving fossil &rsquo. De même qu'il est faux que l'évolution efface le passé, il est également vrai qu'aucun organisme ne reste complètement inchangée pendant de longues périodes de temps géologique. Le limule porte peut-être une carapace ancienne sur le dos [il parle ici au sens figuré, les gens], mais il a tout de même bougé avec les âges. Même le tuatara a évolué au niveau génomique pour autant que son visage au sourire obscur semble parler directement du Trias&rdquo (Fortey 2011, p. 280-281).


          BIOL 3300

          Même nucléotide à une position donnée en raison de la descendance d'un ancêtre commun Ou d'une évolution convergente ? Par exemple. indépendant des mutations dans des lignées divergentes se sont-elles produites à la fois pour produire un C ou un T sur un site particulier ?

          Seulement 4 états de caractères (nucléotides)

          • Bonne chance que des mutations indépendantes se produiront
          • Et plusieurs substitutions au même site : Distinguer donc homologie de l'homoplasie par "prépondérance de preuve"
          • -Modèles, programmes informatiques destinés à améliorer l'objectivité de l'analyse phylogénétique moléculaire
          • -par exemple. Le modèle à deux paramètres de Kimura -Corrige pour plusieurs substitutions en même temps
          • -Et les différences de fréquence des transitions vers les transversions
          • Espèces étroitement apparentées
          • - Différence nucléotidique = 16/924 = 1,73%
          • - K2P = 1,76% K2P
          • Espèces apparentées plus éloignées
          • - Différence nucléotidique = 144/924 = 15,58%
          • - K2P = 17,67%K2P
          • Les substitutions multiples au même site augmentent avec le temps depuis la divergence en raison de l'évolution convergente et des inversions
          • La différence entre les séquences sature à env. 75%
          • Estime les affinités taxonomiques de l'ensemble
          • similarité
          • Compare autant de caractères que possible
          • Sans pondération ni hypothèses phylogénétiques (par exemple, concernant l'homologie ou la polarité des états des caractères)
          • Suppose que la contribution de l'homologie à la similarité globale devrait être submergée par le degré d'homologie si suffisamment de caractères sont comparés
          • Mais les critiques soutiennent que la similitude globale n'est pas un indice de parenté fiable
          • Plus proche si ancêtre partagé plus récemment
          • par exemple. en utilisant le modèle à 2 paramètres de Kimura
          • La longueur de la branche indique la distance génétique
          • Méthode des distances
          • Représente l'approche phénétique
          • Regrouper les taxons afin que les formes les plus similaires soient regroupées
          • L'enracinement avec l'exogroupe peut permettre des inférences sur la direction du changement
          • Beaucoup d'arbres possibles mais celui préféré minimise la distance totale entre les taxons
          • Pas la méthode la plus précise, mais raisonnablement bonne, et a l'avantage d'être rapide, même avec de grands ensembles de données
          • Fait valoir que le degré de parenté ≠degré de similitude
          • Classifie les organismes selon ordre que les branches sont apparues le long d'un arbre phylogénétique dichotomique
          • L'analyse de parcimonie des synapomorphies détermine quelle phylogénie nécessiterait moins de changements pour illustrer les relations évolutives
          • Par conséquent, seulement partagé, les caractères dérivés (synapomorphies) sont informatifs
          • La parcimonie informative les caractères sont partagés par deux ou plusieurs taxons
          • Les caractères uniques à une lignée sont uniformisés avec parcimonie
          • Besoin d'un groupe externe pour identifier les synapomorphies
          • c'est-à-dire savoir ce qui est ancestral (plésiomorphe) et ce qui est dérivé (apomorphe)
          • Seul ordre de succursale important
          • La longueur de la branche n'a pas d'importance
          • Arbres dictomiques
          • par exemple. Analyse de parcimonie maximale dans MEGA
          • Les programmes informatiques comparent tous les arbres possibles
          • Plus difficile du point de vue informatique que l'arbre de jointure voisin
          • Même avec 8 espèces, plus de 10 000 arbres possibles
          • Quelle confiance devrions-nous accorder à un point de branchement particulier ?
          • Evalutae statistiquement en utilisant le bootstrap
          • Construit des arbres répliqués en créant de nouveaux ensembles de données à partir d'un ensemble existant par échantillonnage répété ("pseudoréplication")
          • Génère des ensembles de données artificielles par échantillonnage aléatoire, avec remplacement, à partir de l'ensemble de données réel
          • par exemple. si 300 pb en séquence, sélectionne au hasard un site et l'utilise
          • comme première entrée dans le nouvel ensemble de données
          • Sélectionne au hasard le deuxième site, etc., jusqu'à 300 sites
          • Nouveau sous-ensemble aléatoire de séquence de l'original
          • Utilisé pour estimer la phylogénie
          • Répété 1000 fois
          • c'est-à-dire 1000 arbres différents construits avec différents sous-ensembles de données
          • Génère un arbre de consensus indiquant dans quel pourcentage des arbres chaque branche particulière s'est produite
          • Si les résultats sont biaisés par quelques sites nucléotidiques, les valeurs des branches seront faibles
          • Le taux d'accumulation des mutations de l'ADN peut-il être utilisé à ce jour lorsque des événements majeurs se sont produits ?
          • par exemple. lorsque deux taxons ont divergé (c'est-à-dire qu'ils ont partagé un ancêtre pour la dernière fois) en fonction du degré de différenciation génétique entre eux
          • Oui : si on peut calibrer cette 'horloge moléculaire'
          • Mesurer la distance geneti entre deux taxons dont la divergence est connue à partir de :
          • Dossier fossile
          • Enregistrement géologique, par ex. divergence entre les organismes marins sur la face inférieure de l'isthme de Panama
          • Brown et al. - divergence de séquence estimée à 2% par million d'années chez les mammifères en utilisant les archives fossiles à travers le génome mt
          • Bermingham et Lessios - divergence estimée des espèces sœurs d'oursins trouvées de chaque côté de l'isthme de Panama (1,8 % à 2,2 % par million d'années)
          • Similaire dans les papillons (Brower)
          • Et les oiseaux (Shields et Wilson Weir et Schluter)

          Suggestions selon lesquelles le taux de mutation est plus rapide dans les organismes avec : des temps de génération courts les organismes à sang chaud par rapport aux organismes à sang froid

          • Et les différentes vitesses auxquelles les substitutions se fixent entraînent des différences au sein du génome mt (entre les gènes)
          • - Certains gènes et régions de gènes plus conservés que d'autres
          • Et les estimations ne sont pas nécessairement applicables à toutes les échelles de temps (pour les taxons proches et éloignés)
          • - par exemple. à cause de la saturation
          • - Si le taux est sous-estimé, les temps de divergence seront surestimés
          • Le parent vivant le plus proche des cétacés est difficile à déterminer car ils sont si spécialisés pour la vie aquatique
          • Relation entre les cétacés et les ongulés, suggérée par la structure des organes internes et les caractères squelettiques
          • Basé sur les dentitions, peut-être le groupe frère des artiodactyles ?
          • Ce qui rendrait les ongulés paraphylétiques
          • c'est-à-dire que les baleines sont dans le clade des ongulés
          • Baleine (cétacés) pas seulement dans le clade des ongulés
          • Mais aussi au sein du clade artiodactyle
          • Suggère que les cétacés sont un taxon frère des hippopotames (Gatesy et al.)
          • c'est-à-dire que les baleines sont des artiodactyles
          • Suggère que les traits des hippopotames et des baleines
          • On pensait qu'il s'agissait d'adaptations convergentes pour la vie aquatique (hippo = cheval de rivière)
          • Peut-être en fait des synapomorphies
          • Données fossiles supplémentaires :
          • Plusieurs synapomorphies identifient Artiodactyla comme descendants d'ancêtre commun
          • Astragale notamment lisse en forme de poulie
          • Mais des baleines fossiles (avec des membres postérieurs) trouvées
          • Avec astragale en forme de poulie (Thewissen et Madar, Thewissen et al.)
          • Mais deuxièmement, découverte de fossiles concluants
          • Deux espèces pour lesquelles la taille et la forme des os des oreilles les identifiaient clairement comme des baleines
          • Et l'astragale en forme de poulie les a marqués comme des artiodactyles

          Présence ou absence de SINEs et LINEs homologues (éléments courts ou longs intercalés)

          • Convergence improbable :
          • Peu probable que inséré dans deux lignées hôtes indépendantes exactement au même endroit
          • Inversion détectable :
          • En cas de perte, perd généralement également une partie du génome de l'hôte
          • Par conséquent, des caractères extrêmement fiables(="complexe")
          • Soutenir la baleine et l'hippopotame en tant que taxons frères (Nikaido et al.)
          • Commandez maintenant Cetartiodactyla généralement reconnu
          • Des fossiles vieux de 47,5 millions d'années découverts au Pakistan
          • Mâle et femelle d'une nouvelle espèce (Maiacetus inuus)
          • Avec quatre nageoires comme des membres modifiés pour la nage à pied, ils pourraient supporter leur poids mais ne pourraient probablement pas voyager loin sur terre
          • Femelle avec fœtus positionné pour un accouchement tête la première, comme les mammifères terrestres mais contrairement aux baleines modernes = indiquant la naissance sur terre
          • Différence de taille entre les hommes et les femmes seulement modérée - suggérant que les hommes ne contrôlaient pas les territoires ou ne commandaient pas de harems
          • des femelles
          • Le mystère vieux de 200 ans de la plus grande fleur la plus dégoûtante du monde résolu à l'aide de la phylogénie moléculaire
          • Les Rafflesiaceae ont des fleurs géantes, qui ressemblent et sentent comme de la viande en décomposition pour attirer les mouches charognardes qui les pollinisent
          • Sont également parasitaires (obtenant des nutriments à partir des tissus de la vigne tropicale plutôt que de la photosynthèse)
          • En utilisant l'analyse de l'ADN, trouvé appartenir à la famille des Euphorbiacées
          • Qui comprend l'hévéa, l'huile de ricin et l'arbuste de manioc
          • Ils tombent au milieu de ce groupe avec de minuscules fleurs
          • Les grandes fleurs odorantes ont probablement évolué parce que ces plantes se trouvent dans les sous-étages de la forêt tropicale humide faiblement éclairés
          • Davis et al.
          • Les cellules tumorales peuvent-elles se déplacer d'un patient à l'autre ?
          • Tumeur vénérienne transmissible canine (CTVT)
          • Question:
          • a) Les cellules tumorales sont-elles transmises de chien à chien ?
          • b) ou est-ce que chaque tumeur est une croissance anormale des propres cellules de chaque chien (causée peut-être par un virus transmis) ?
          • Si a), l'analyse génétique montrera que les cellules tumorales sont monophylétiques
          • Si b), les chiens et leurs tumeurs seront chacun monophylétiques
          • Support solide pour (a)
          • Pour répondre, Kittler et al ont expliqué que les poux de corps (qui vivent dans les vêtements) provenaient des poux de tête à l'époque où les humains ont commencé à porter des vêtements.
          • Par conséquent, estimé quand les poux de corps sont apparus en estimant la distance génétique entre les poux de corps et les poux de tête chez les humains du monde entier.
          • - Pour convertir la divergence génétique en divergence chronologique, nécessaire pour "calibrer" l'horloge moléculaire
          • - Raisonné que les poux de tête qui parasitaient les humains et les poux qui parasitaient les chimpanzés ont divergé lorsque leurs espèces hôtes ont divergé (il y a environ 5,5 millions d'années, selon les archives fossiles) pour calculer le "facteur de conversion"
          • Par conséquent, on a estimé que les poux de corps (et donc les vêtements) provenaient d'environ. il y a 72 000 ans
          • Associé à la propagation des premiers humains hors d'Afrique ?
          • plus petite unité indépendante de l'évolution
          • L'essence de la spéciation est le manque de flux génétique
          • Pools de gènes séparés
          • Mais des critères pratiques pour identifier quand les populations évoluent de façon indépendante ?
          • Suppose que les populations isolées sur le plan de la reproduction accumuleront des différences morphologiques
          • Mais toutes les différences ne sont pas des différences au niveau des espèces
          • - Dimorphisme sexuel
          • - Différences de cycle de vie
          • - Effets environnementaux
          • - Polymorphismes intraspécifiques (par exemple, colout des yeux) et polyphénismes (par exemple, reine, ouvrière, fourmis de soudure)
          • Et certaines espèces peuvent être cryptiques
          • Code-barres ADN découvrant de nombreuses espèces cryptiques
          • Les espèces sont les plus petites unités identifiables qui sont diagnostique et monphylétique
          • De nombreux groupes monophylétiques possibles
          • Critère différent de celui du BSC pour établir si le manque de flux génétique
          • Le PSC détecte que les espèces sont indépendantes de l'évolution depuis assez longtemps pour que des traits de diagnostic émergent
          • Peut être basé sur de nombreux caractères (pas seulement morphologiques - mais pas seulement génétiques)
          • Tout type d'organismes
          • Testable
          • Le critère est l'isolement reproductif
          • Séparer les espèces si elles ne s'hybrident pas régulièrement dans la nature ou si elles ne parviennent pas à produire une progéniture fertile et viable lorsqu'elles le font
          • Largement accepté depuis qu'Ernst Mayr l'a « défendu » en 1942, par ex. définition légale utilisée dans le U.S.Endangered Species Act 1973
          • Manque de flux génétique "test décisif" pour l'indépendance évolutive
          • Plus fréquent qu'on ne le pensait auparavant
          • - Difficile à détecter avant l'utilisation de méthodes génétiques, en particulier avec le rétrocroisement
          • De nombreux hybrides bien connus sont généralement stériles
          • - Mais pas toujours (par exemple "beefalo")
          • Particulièrement commun chez les plantes (plus tard)
          • L'hybridation dans la nature résulte souvent de changements anthropiques
          • - introduction d'étrangers
          • - suppression des barrières isolantes
          • - décalages de gamme
          • par exemple. L'ours polaire hybride grizzly est un signe inquiétant du changement climatique dans le Nord
          • Et difficile à tester et appliquer :
          • - Dans les populations qui ne coexistent pas
          • - Sous formes fossiles
          • - Non pertinent dans les organismes asexués
          • Doit faire des déductions (basées sur des différences morphologiques, génétiques ou comportementales) pour savoir si elles pourraient être isolées sur le plan de la reproduction
          • -> Doit comprendre les causes de l'isolement reproductif

          1. Copépodes

            Morphologiquement, une seule espèce
        • La phylogénie moléculaire a montré au moins 8 espèces
        • Différentes espèces de phylogénies incapables de produire une progéniture fertile (même lorsqu'elles se chevauchent dans la distribution)
        • Au moins 8 espèces cryptiques par BSC, PSC
          • 2. Éléphants
          • Éléphants traditionnels d'Afrique et d'Asie
          • Deux types africains (forêt et prairie) mais n'interagissent pas pour tester BSC
          • La PSC a montré qu'il s'agissait d'espèces distinctes
            Diatomées responsables de proliférations d'algues nuisibles (genre Pseudo-nitzchia)
          • Deux espèces morphologiques en microscopie optique
          • Mais la MET (microscopie électronique à transmission) et l'analyse phylogénétique utilisant des données de séquence d'ADN ont révélé 8 spp.
          • Essais d'accouplement convenus
          • Production de neurotoxine pendant la prolifération d'algues variable
          • Peut-être en raison de différentes compositions d'espèces à différents moments
          • 4. Espèce de raie cryptique
          • Espèce généralement considérée comme unique (raie commune)
          • L'analyse phylogénétique moléculaire a révélé deux espèces distinctes (raie bleue et raie à clapet)
          • - Qui n'étaient même pas des espèces sœurs
          • Une enquête plus approfondie a montré des espèces:
          • - Pourrait être distingué morphologiquement (par la forme de la dent)
          • - Avait des répartitions géographiques différentes
          • Important à des fins de conservation
          • Classiquement, la spéciation en 3 étapes :
          • 1. Isolement
          • 2. Divergence
          • 3. Isolement reproductif (IR)
          • une) Spéciation allopatrique (spéciation géographique)
          • L'indépendance évolutive commence par l'arrêt du flux génétique en raison de la séparation physique des populations
          • Les populations se développent alors intrinsèque différences génétiques, surtout si les conditions sont différentes de chaque côté de la barrière)
          • RI si contact secondaire

          La divergence commence après l'événement fondateur, résultant de la dérive génétique et de la sélection naturelle

          • par exemple. hawaïen Drosophile
          • >1000 spp. (Beaucoup d'îles endémiques)
          • Chaque île probablement fondée par un petit nombre d'individus ou même une seule femelle gravide
          • - Dérive génétique et sélection naturelle sur les gènes responsables des parades nuptiales et de l'utilisation de l'habitat
          • Appuyé par des preuves phylogénétiques : suggère que les îles ont été colonisées en séquence ("saut d'îles")
          • Mécanisme général considéré pour l'initiation de la spéciation
          • Surtout chez les animaux mobiles (ou avec des stades de repos)
          • par exemple. espèces envahissantes dans les eaux de ballast des navires
          • et plantes
          • par exemple. petit nombre de graines vers de nouveaux habitats par le vent ou les courants d'eau ou par les pieds, les plumes et le tube digestif des oiseaux et autres mammifères
          • Peut être un processus lent (par exemple, élévation de la chaîne de montagnes, glaciers) ou rapide (par exemple, coulée de lave)
          • - Comprend la fragmentation de l'habitat causée par l'homme
          • - La barrière au flux génétique dépend-elle des espèces ?
          • par exemple. Crevettes craquantes
          • De chaque côté de l'isthme de Panama (Pont terrestre fermé environ 3 millions d'années)
          • Espèces sœurs morphologiques de chaque côté de l'isthme
          • Confirmé phylogénétiquement (ADN)
          • Et l'étude d'accouplement a montré que les couples n'étaient plus capables de se croiser
          • Spéciation terminée

          Spéciation parapatrique

          Lorsqu'une population pénètre dans un nouvel habitat dans l'aire de répartition des espèces parentales

          Pas de séparation physique entre les populations (c'est-à-dire pas de barrière extrinsèque)

          Au lieu de cela, la spéciation résulte de l'évolution d'autres mécanismes qui réduisent le flux de gènes entre les populations

          par exemple. serpents d'eau bagués et non bagués : le continent en a bagué beaucoup sur les îles non bagués

          • Spéciation allopatrique si les courants d'eau ont complètement empêché la migration
          • Mais parapatrique car migration fréquente du continent et hybridation
          • - Avec sélection contre bagués sur les îles
          • Résultat dépendant de l'équilibre entre le flux génétique et la sélection
          • Spéciation plus probable dans les petites populations lorsque le flux de gènes est faible, la sélection pour la divergence est forte (intrinsèque barrières)
          • Se trouve entièrement dans l'aire de répartition des espèces parentales
          • Par conséquent, doivent être des barrières intrinsèques au flux de gènes
          • i) La polyploïdie et d'autres changements chromosomiques comme barrière au flux de gènes
          • - Duplication du génome entier
          • - La plus grande échelle de mutation possible
          • Une erreur dans la méiose produit des gamètes diploïdes (non réduits)
          • Gamètes avec des nombres de chromosomes différents normalement incompatibles (3N faible fertilité)
          • Immédiat isolement reproductif entre les populations parentales et filles
          • Polyploïdie commune chez les plantes car capable d'autofécondation
          • 70% angiospermes, 95% fougères avec polypoïdie dans l'histoire
          • Polyploïdisation chez les animaux relativement rare, bien que l'autofécondation et la parthénogenèse dans de nombreux groupes
          • par exemple. lézards whiptail : polyploïdie produite par hybridation entre espèces (allopolyploïdie)
          • par exemple. Chaque espèce peut apparaître indépendamment plusieurs fois
          • Pas de duplication du génome entier
          • Mais toute différence dans le nombre de chromosomes empêche toujours la formation d'une progéniture fertile
          • par exemple. genre papillon Agrodiaetus
          • - Espèce avec un nombre de chromosomes allant de 10 à 134
          • - Espèces sympatriques avec le même nombre de chromosomes rares, ce qui suggère que les différences sont importantes pour maintenir l'isolement

          D'autres barrières intrinsèques au flux de gènes en sympatrie comprennent l'isolement reproductif temporel (par exemple, les différences de temps de floraison), la spécialisation de l'hôte ou du pollinisateur, ou l'isolement anatomique ou comportemental

          • par exemple. Papillon d'hiver japonais
          • - Dans le nord du Japon (où la neige épaisse et le froid extrême empêchent la reproduction au milieu de l'hiver), une espèce se reproduit à la fin de l'automne/début de l'hiver et une autre se reproduit à la fin de l'hiver/début du printemps
          • Les espèces sont génétiquement divergentes malgré le chevauchement géographique
          • Mais dans le sud du Japon (où la reproduction est possible tout au long de l'hiver), pas d'isolement temporel et une seule population de croisement
          • par exemple. deux espèces de singes : l'une pollinisée par les abeilles, l'autre par les colibris
          • - Aucune opportunité d'hybridation même là où ils se produisent
          • par exemple. escargot japonais (genre Euhadra)
          • - Un seul gène contrôle si la coque montre un enroulement gaucher ou droitier
          • - La mutation produisant une autre maniabilité entraîne un isolement reproductif immédiat "en raison d'une incompatibilité reproductrice anatomique
          • - La phylogénie suggère que le droitier est apparu plusieurs fois
          • La sélection naturelle est reconnue comme le facteur le plus important favorisant la divergence
          • Différentes pressions de sélection sur chaque population dans différents habitats, en utilisant différentes ressources
          • par exemple. Mouche de la pomme et de l'aubépine
          • - Début de spéciation en sympatrie
          • - Espèce observée pour la première fois sur les pommes au milieu des années 1800
          • - Les arbres hôtes se produisent ensemble et les mouches recherchent largement l'hôte
          • - Non morphologiquement distinct
          • Mais forte préférence d'hôte
          • Par conséquent, accouplement associatif puisqu'ils s'accouplent sur l'hôte

          La divergence résulte-t-elle simplement d'une dérive génétique due à l'isolement reproductif ?

          • Ou deux « races » exposées à des pressions de sélection différentes ?
          • Evdence suggère une sélection motivée par la différence dans le moment où les fruits de chaque hôte mûrissent
          • - Les pommes mûrissent 3-4 semaines avant aubépines
          • - Par conséquent, encore chaud lorsque la larve de mouche du pommier se nympho par rapport à une température fraîche (avant l'hiver) pour les larves d'aubépine
          • Souris sylvestres de Sand Hills au Nebraska
          • Couleur de la lumière codée par un seul gène (agouti)
          • Estimé que le gène est apparu env. Il y a 4000 ans (quelques milliers d'années après la colonisation par les souris noires)
          • Le nouveau gène est depuis devenu très commun
          • Expériences de prédation utilisées par les hiboux pour estimer la force de la pression de sélection : les souris plus pâles ont un avantage de survie de 0,5 %
          • Linnen et al.
          • 1. Épinoches
          • - Perte d'armure indépendante dans les lacs isolés
          • - Disponibilité réduite des ions et intensité de prédation réduite

          De même, la divergence parallèle des paires benthiques et limnétiques (Rundle et al.)

          • 2. Insectes phasmes qui marchent
          • Forme non striée plus commune sur la plante hôte à feuilles larges
          • Forme rayée plus commune sur l'hôte avec des feuilles minces en forme d'aiguille
          • Prédation par les oiseaux et les lézards
          • Divergence dans la taille du corps, la forme, la préférence de l'hôte, le comportement
          • Poussé par une sélection divergente intense pour la crypsie (Nosil et al.)
          • Pas de dérive génétique
          • Type spécial de sélection naturelle agissant sur les phénotypes impliqués dans le choix du partenaire
          • L'accouplement en assortiment en raison de choix de partenaire direct (pas un sous-produit de la sélection écologique)
          • Peut contribuer à l'isolement reproductif qui peut conduire à la spéciation
          • par exemple. Genre de cricket hawaïen Laupala
          • - Les femelles choisissent les mâles de leur espèce en fonction du pouls du chant
          • - Différences importantes dans le maintien de l'IR entre 38 espèces
          • - Base génétique inconnue mais chant masculin et préférence féminine étroitement liés
          • par exemple. Cichlidés
          • >500 espèces rien que dans le lac Malawi
          • Pouvez direct le choix du partenaire (basé sur les différences de couleur des mâles) empêche les croisements ou est-ce que l'IR est le résultat d'une ségrégation de l'habitat ?
          • Oui : accouplement associatif complet, même en laboratoire
          • Des différences génétiques très significatives indiquent une RI
          • Dans certaines situations, les préférences d'accouplement et les facteurs environnementaux interagissent
          • Dans le lac Victoria, où la clarté de l'eau est mauvaise, les mâles des deux espèces ont des modèles de couleurs similaires et sont moins génétiquement divergents
          • Deux mécanismes généraux réduisent le métissage et l'hybridation :
          • 1) Isolement prézygotique Principalement isolement prématuré - isolement temporel (p. ex. papillon d'hiver japonais), spécialisation de l'hôte ou du pollinisateur, incompatibilité reproductrice anatomique (escargots terrestres japonais), choix du partenaire (p. ex. accouplement assortatif chez les cichlidés, les grillons)
          • Aussi isolement gamétique (par exemple. Drosophile)
          • Attendez-vous à une RI entre les bonnes espèces (selon BSC)
          • Mais l'hybridation entre des espèces récemment divergentes n'est pas rare (par exemple, suite contact secondaire)
          • - par exemple. plus de 700 espèces végétales introduites dans les îles britanniques s'hybrident avec des espèces indigènes
          • - Et au moins la moitié d'entre elles produisent des hybrides fertiles
            2. Lorsqu'ils sont également en forme, divergence entre les populations parentales effacé
          • 3. Meilleure condition physique (par exemple dans un habitat intermédiaire ou nouveau)
          • - Créer une population distincte qui leur est propre
          • - Soit zone hybride stable (aptitude plus élevée à la limite des plages parentales) ou nouvelle espèce (dans de nouveaux habitats)

          Évolution des mécanismes qui empêcher croisement entre des espèces naissantes nouvellement en interaction (prézygote)

          • Si les hybrides sont moins en forme : (postzygotique)
          • Populations parentales sous différentes pressions de sélection
          • Changements dans les systèmes d'accouplement
          • Ou si la fixation d'allèles qui ne fonctionnent pas bien ensemble lorsqu'ils sont hétérozygotes
          • Sélection contre les hybrides devraient renforcer sélection pour accouplement assortatif (IR prézygotique)
          • Et finaliser le processus de spéciation
          • Minimise le gaspillage de "gamètes"
          • par exemple. Drosophile santomea et D. yacuba
          • Devrait être sélectionné pour l'évolution de l'isolement prézygotique en sympatrie puisque les mâles hybrides sont stériles
          • Dans les populations allopatriques, les femelles produisent un nombre à peu près égal de descendants engendrés par les mâles de chaque espèce
          • Mais dans les populations sympatriques, les femelles produisent principalement des œufs engendrés par des mâles de leur propre espèce, même si elles s'accouplent d'abord avec des mâles d'autres espèces = isolement gamétique
          • Phéromones chez 2 espèces chimiquement différentes quand sympatrique Mais pas quand allopatrique
          • MAIS : dans des populations allopatriques regroupées en laboratoire
          • Les phéromones ont divergé pour ressembler à celles trouvées chez les espèces sympatriques
          • En 9 générations
          • Deux lignées divergentes isolées dans les refuges de forêt tropicale N et S au cours du Pliocène et du Pléistocène
          • Reconnecté env. Il y a 6500 ans dans la zone de contact
          • Sélection contre hybridation par choix du partenaire plus importante dans les zones de contact que dans la zone allopatrique = déplacement du caractère reproducteur Isolement reproductif après l'accouplement :
          • - S femelles x N mâles inviables
          • - N femelles x S mâles viables mais avec un développement plus lent
          • Plus de "pénalité" si la femme S choisit le mauvais homme
          • Conduit à l'isolement reproductif avant l'accouplement (renforcement) :
          • - S femelles mieux que N femelles pour choisir leurs propres mâles
          • par exemple. Une population d'épinoches
          • Répartition du couple d'espèces benthique-limnétique en essaim hybride (Gow et al. 2006)
          • Probablement en raison des changements environnementaux dans le lac
          • Écrevisse exotique introduite au début des années 1990 (Taylor et al)
          • par exemple. cichlidés dans le lac Victoria
          • Augmentation de la turbidité provoquant la rupture des barrières reproductives avant l'accouplement (Seehausen et al)
          • Hendry et al - impacts humains possibles sur le rayonnement adaptatif : bimodalité de la taille du bec chez les pinsons de Darwin
          • Divergence en ce qui concerne la taille et la forme du bec chez le pinson de taille moyenne Géospiza fortis
          • Distribution biomodale évidente dans les années 1940-1960
          • Peu avec une taille de bec intermédiaire
          • Pas d'incompatibilité génétique intrinsèque
          • Sélection vraisemblablement perturbatrice en raison de la sélection contre les hybrides
          • Approvisionnement insuffisant en graines de taille/dureté intermédiaire
          • Site avec présence humaine accrue après 1960
          • Mangeoires à pinsons avec du riz qui peut être fissuré par des oiseaux ayant une large gamme de tailles de bec
          • Plus de sélection contre les becs intermédiaires
          • par exemple. grand sagebush dans l'Utah
          • 2 sous-espèces, bassin et montagne, s'hybrident à élévations intermédiaires
          • Zone hybride relativement étroite par stable dans le temps
          • Expériences de transplantations réciproques a montré que chaque sous-espèce réussissait mieux à sa propre altitude
          • Hybrides supérieurs en habitat de transition
          • Continuer à s'hybrider à l'interface
          • par exemple. deux espèces de fleurs sauvages dans le Colorado
          • Les hybrides ont poussé aussi bien ou mieux dans les habitats de transition
          • Tournesol Helianthus anormal pensé pour avoir été créé par l'hybridation entre deux autres espèces (H.annuus et H. petiolaris)
          • Isolement reproductif des espèces parentales
          • Les preuves ADN appuient l'hypothèse précédente selon laquelle la paruline d'Aubodon (D. auduboni) est un hybride entre deux autres espèces (D. coronata et D. nigrifrons)
          • Spéciation hybride homoploïde par ailleurs considérée comme rare chez les tétrapodes
          • Les chercheurs ont recréé Heliconius heurippa au labo en croisant Heliconius cydno et Heliconius melpomène
          • Et les hybrides naturels présentent des motifs d'ailes très similaires à H. heurippa
          • Modèle d'aile de H. heurippa conduit à l'isolement reproductif des espèces parentales
          • De plus en plus de preuves circonstancielles de la spéciation hybride dans Ragoletis mouches des fruits, espadon et cichlidés africains
          • Et certains soupçonnent que le loup rouge américain pourrait être le produit d'une hybridation entre les coyotes et les loups gris
          • Sujet brûlant dans la recherche en biologie évolutive maintenant
          • Y compris l'identification des gènes et des mutations réels
          • par exemple. Souris sylvestres « blondes » sur Sand Hills au Nebraska (Linnen et al. 2009)
          • par exemple. "renforcement" gee chez les gobe-mouches (Sether et al)
          • Moucherolles pie et à collier
          • La spéciation a eu lieu au cours de la dernière période glaciaire réunie lorsque les glaciers ont reculé
          • Étroitement liés, se ressemblent, partagent le même territoire, mais se reproduisent rarement ensemble et les hybrides sont stériles
          • Les femelles préfèrent les mâles conspécifiques mais environ 2% s'hybrident
          • Hybrides étudiés pour déterminer si préférence génétique ou apprentissage par exposition : mécanisme de pré-accouplement RI ?
          • Les femelles hybrides préfèrent les mâles de la même espèce que père génétique les mâles hybrides n'ont montré aucune préférence
          • Gènes trouvés sur le chromosome sexuel (Z) des femmes (du père)
          • Saether et al. 2007
          • Auparavant pensé qu'une réorganisation radicale nécessitait = "révolution génétique"
          • RI due à une divergence à l'échelle du génome en allopatrie
          • Fixation séquentielle d'un grand nombre de changements génétiques, chacun avec un très petit effet (modèle géométrique de Fisher)
          • Mais des recherches récentes montrent que la spéciation peut également résulter de : Peu de changements à grand effet
          • - Grillons, cichlidés : peu de gènes liés au choix du partenaire
          • - Phlox: quelques gènes liés à la couleur des fleurs
          • Et la spéciation peut résulter des deux :
          • Nouvelles mutations:
          • par exemple. souris sylvestre de Sand Hills au Nebraska (Linnen et al)
          • par exemple. Réduction pelvienne des stickbacks (Chan et al.)
          • et Variante debout:
          • par exemple. plaques réduites chez les épinoches FW (Colosimo et al.)
          • par exemple 1 : Souris de plage sur la côte du golfe de Floride
          • La différence d'un seul nucléotide dans le gène du récepteur de la mélanocortine-1 représente jusqu'à 36 % de la couleur plus claire du pelage
          • Même mutation ne pas présent chez les souris de la côte Atlantique de couleur claire, suggérant une évolution phénotypique convergente
          • Gène agouti impliqué chez des souris sylvestres blondes de Sand Hills au Nebraska
          • Hoekstra et al.
          • par exemple 2 : Pigmentation foncée chez des souris à poches rocheuses envahissant les coulées de lave en Arizona par rapport au Nouveau-Mexique
          • "De toute évidence, dans la nature, des populations indépendantes peuvent avoir des solutions génétiques différentes à des problèmes écologiques similaires"
          • ex.3 Perte complète de pigment chez les poissons cavernicoles mexicains
          • Deux populations avec des délétions différentes dans le gène de l'albinisme oculaire 2
          • D'autres populations montrent plein complémentation gène différent probablement impliqué
          • Traverser des poissons cavernicoles aveugles (Astyanax mexicanus) depuis des grottes éloignées peut restaurer la vue
          • Soutient l'idée que la cécité a évolué de manière convergente dans des populations de poissons cavernicoles éloignées
          • Mutations dans différents gènes responsables de la perte de la vue dans des lignées distinctes

          par exemple 1: Exactement le même polymorphisme d'acides aminés dans Mc1r chez les souris blondes des plages et les mammouths laineux

          • par exemple 2 : Gène Pitx1 impliqué dans la réduction pelvienne chez les épinoches à trois et neuf épines
          • Suspicion d'implication chez les lamantins
          • Premiers métazoaires dans les archives fossiles env. 565 M
          • par exemple. méduses et éponges multicellulaires mais petites et morphologiquement simples
          • Puis "explosion" cambrienne (545-505 Ma)
          • Dans le temps, le Cambrien représente <1% de l'histoire de la Terre
          • Mais avec l'apparition de la plupart des embranchements d'animaux vivants
          • par exemple. arthropodes, annélides, mollusques, cordés

          Début de Phanérozoïque (= vie visible) éon

          • 1. Ambre et glacial Restes les moins altérés mais rares
          • par exemple. insectes conservés dans des résines végétales durcies
          • par exemple. mammouth laineux dans le pergélisol
          • Autres environnements sans altération, animaux charognards, décomposition
          • par exemple. restes humains dans les tourbières
          • 2. Perminéralisation et remplacement
          • Lorsque les minéraux dissous (par exemple, calcite, silice, gypse) remplacent le contenu minéral d'origine ou précipitent à l'intérieur et autour de celui-ci
          • Peut préserver les détails 3D de la structure interne
          • 3. Moisissures et moulages Restes de pourriture après avoir été enfouis dans les sédiments
          • Moulages = le nouveau matériau remplit l'espace et durcit en roche
          • Moules = espaces vides
          • Préserve les informations 3D sur la forme de la surface
          • 4. Compression et impression fossiles
          • La matière organique est enfouie dans les sédiments avant de se décomposer
          • Sous le poids des sédiments, laisse une impression 2D dans le matériau ci-dessous
          • 5. Traces de fossiles
          • Chemins ou terriers (par exemple, pierre de Tyndall)
          • Coprolithes (par exemple, excréments de paresseux dans les grottes du désert)
          • 1. Durabilité de l'échantillon ou de la protection
          • 2. Enterrement
          • 3. Manque d'oxygène
          • Par conséquent:
          • Fossiles pour la plupart des structures dures laissées là où les sédiments sont déposés
          • par exemple. deltas fluviaux, plages, plaines inondables, marais, fonds marins
          • Aussi les marécages anaérobies
          • 1. Biais d'habitat
          • Les dépôts sédimentaires s'accumulent principalement dans les zones marines côtières
          • - Composé de matériaux érodés par les masses continentales
          • Par conséquent, la plupart des organismes marins
          • - Dans une moindre mesure, d'autres organismes côtiers ou des plaines inondables
          • 2. Biais taxonomique
          • Biais envers les organismes à structure minéralisée (coquille ou os)
          • >60 % des embranchements d'animaux sans structures dures sont sous-réprimés
          • Les parties critiques de la plante (par exemple les fleurs) se fossilisent rarement
          • 3. Biais temporel
          • Les vieilles roches sont plus rares que les nouvelles roches alors que les montagnes s'érodent et que les plaques tectoniques se subductent
          • La fidélité des archives fossiles est meilleure pour les fossiles plus récents
          • 4. Biais de collecte
          • par exemple. certains groupes de fossiles sont préférentiellement collectés
          • Hiérarchie divisée en éons, ères, périodes, époques et étapes
          • début des années 1800, intervalles classés par âges relatifs uniquementTemps absolus attribués au développement des techniques de datation
          • Trois ères : Paléozoïque, Mésozoïque, Cénozoïque
          • Au Cénozoïque, soit :
          • Trois périodes : Paléogène, Néogène et Holocène (5e éd.)
          • La vie a évolué sur un monde qui était lui-même en train de changer (Freeman et Herron)
          • Réarrangement des continents et des océans dû à la tectonique des plaques
          • A entraîné des changements climatiques majeurs :
          • par exemple. modèles climatiques extrêmes lorsque les continents se sont réunis en raison de la plus petite quantité relative de côtes (avec son effet modérateur sur le climat)
          • La collision des plaques peut également provoquer une augmentation de la formation de montagnes -> l'altération des roches -> une diminution du CO2 -> une diminution des températures et de la glaciation
          • Pendant les périodes de forte concentration de CO2, les pôles sans glaciation
          • Daté 565-544 Ma
          • Découvert dans les années 40
          • Nommé pour les collines d'Ediacara, Australie
          • Mais un fossile similaire sur 20 sites à travers le monde
          • Principalement des fossiles ou des traces de compression et d'impression
          • Organismes sans coquilles ou autres parties dures
          • Petites éponges, méduses, gelées en peigne
          • Morphologiquement simple
          • Asymétrique ou à symétrie radiale
          • Mais des animaux à symétrie bilatérale plus complexes étaient-ils présents aussi tôt ?
          • Argument que les terriers et les pistes linéaires ont été créés par un organisme avec la tête et la queue
          • Les embryons fossilisés suggèrent également une symétrie bilatérale
          • - par exemple. ressemblant à des éponges larvaires
          • - par exemple. ressemblant à des embryons d'arthropodes en clivage
          • De solides preuves fossiles d'animaux à symétrie bilatérale à la fin du Précambrien
          • par exemple. ressemblant à un mollusque Kimberella Together suggère des bilatériens petits mais présents
          • Daté de 505 Ma
          • Découvert en 1909 près de Field, en Colombie-Britannique
          • Décrit dans "La vie merveilleuse" de Stephen Jay Gould
          • Principalement des fossiles de compression et d'impression
          • Variété de grandes formes complexes à symétrie bilatérale
          • Peu de chevauchement avec les fossiles d'Édiacarien
          • Segmentation bien développée, têtes, appendices
          • Arthropodes complexes (p. ex. trilobites)
          • Vers segmentés, priapulides vermiformes, mollusques
          • Plusieurs cordés avec des muscles du tronc segmentés, notochorde qui ressemblent à des myxines et des lamproies
          • Également des organismes inhabituels qui ne sont manifestement pas liés à des embranchements existants
          • Parfois regroupés sous le nom de « Problematica »
          • Dont certains pourraient représenter de nouveaux embranchements
          • Si tel est le cas, l'explosion cambrienne a entraîné une diversité morphologique encore plus grande que prévu
          • De nombreux grands groupes se sont ensuite éteints
          • Cependant, d'autres études suggèrent que "Problematica" est probablement un membre ou un proche parent de phylums vivants.
          • par exemple. Opabina par ex. Wiwaxia
          • Quelque chose d'inhabituel s'est produit pendant le Cambrien
          • Cela a conduit les premiers membres de pratiquement toutes les principales lignées animales à apparaître relativement soudainement
          • En même temps, dans de nombreuses régions du monde
          • Diversification en termes d'innovations morphologiques
          • Locomotion
          • Alimentation

          Divergences majeures mises en évidence entre la faune édiacarienne et la faune des schistes de Burgess

          • 1. Radialement ou asymétrique (diploblastique) par ex. Méduses, gelées en peigne
          • vs.
          • Bilatéralement symétrique (triploblastique) = Bilatera par ex. arthropodes, nématodes, mollusques, cordés
          • 2. Protostome vs deutérostome
          • Protostomé :
          • La gastrulation forme la bouche en premier
          • par exemple. arthropodes, nématodes, mollusques, annélides, vers plats
          • vs.
          • Deutérostome : la première ouverture devient l'anus
          • par exemple. échinodermes, cordés
          • Combien de temps ces traits ont-ils existé avant d'apparaître dans les archives fossiles ?
          • Utilisez l'horloge moléculaire pour dater des événements non datés dans les archives fossiles
          • Wray et al. utilisé 7 gènes différents, tous calibrés indépendamment
          • Estimé que les cordés et les échinodermes ont divergé de 1000 Ma
          • Protostomes et deutérostomes ont divergé 1200 Ma
          • c'est-à-dire que des divergences se sont produites des centaines de millions d'années avant la première apparition dans les archives fossiles
          • Si tel est le cas, des fossiles de bilatériens, de protostomes et de deutérostomes devraient éventuellement être trouvés dans les roches protérozoïques
          • Cooper et Fortey, Smith
          • Suggéré que les lignées menant à la vie Bilatera ont divergé sur une période prolongée au Protérozoïque
          • Mais la plupart étaient de petits organismes qui n'ont laissé aucune trace fossile
          • Si oui, qu'est-ce qui a allumé le fusible ?
          • Qu'est-ce qui a provoqué un changement spectaculaire de la taille du corps dans plusieurs lignées, au cours de la même brève période ?
          • Peut avoir été lié à des changements écologiques (par exemple dans l'atmosphère ou la géochimie océanique)
          • En particulier l'augmentation des concentrations d'oxygène dans l'eau de mer en raison de l'augmentation des algues photosynthétiques au cours du Protérozoïque
          • Knoll et Carroll ont suggéré l'extinction massive d'une grande partie de la faune édiacarienne juste avant le Cambrien
          • En même temps que l'augmentation de l'oxygène atmosphérique
          • A permis à de minuscules bilatériens d'évoluer en réponse à des conditions modifiées
          • Preuve géologique d'augmentation de l'oxygène (par exemple, Knoll et Carroll)
          • Mais des prédictions supplémentaires n'ont toujours pas été testées :
          • Aucune preuve fossile de protostomes et de deutérostomes de petit corps au Protérozoïque
          • Aucune preuve d'extinction massive de la faune édiacarienne

          Grand changement évolutif

          Les archives fossiles montrent que la composition du biote a changé « radicalement » au fil du temps

          • Un seul ou petit groupe d'espèces ancestrales se diversifie rapidement en un grand nombre d'espèces descendantes
          • Occupent généralement une grande variété de niches
          • Le manque de concurrents permet une diversification pour combler des niches inoccupées
          • une) Suite à la colonisation d'un nouvel environnement appauvri
          • par exemple. Pinsons des Galapagos Poissons dans les lacs postglaciaires
          • b) Extinction d'autres taxons
          • par exemple. diversification des mammifères après l'extinction des dinosaures à la fin du Crétacé
          • par exemple. Diversification de Bilatera après l'extinction de nombreuses espèces d'Édiacariens
          • par exemple. diversification des arthropodes grâce aux membres articulés
          • par exemple. rayonnement adaptatif parmi les plantes terrestres
          • 1. Rayonnement des plantes terrestres d'ancêtres aquatiques (400 Ma)
          • - Caractéristiques morphologiques clés (par exemple, cuticules cireuses, stomates)
          • 2. Rayonnement des angiospermes (110 Ma)
          • - Fleur innovation clé car elle a rendu la pollinisation si efficace
          • Absence de changement évolutif dans un ou plusieurs caractères pendant une certaine période de temps évolutif
          • De nouvelles morpho-espèces apparaissent soudainement dans les archives fossiles
          • Puis persister pendant des millions d'années sans changement apparent
          • Darwin a souligné la nature progressive de l'évolution par la sélection naturelle pour contraster la création instantanée de nouvelles formes présentées dans la théorie de la création spéciale
          • Attribué le manque de formes de transition à l'incomplétude des archives fossiles
          • Modèle accepté par le progressif pour le siècle prochain
          • Gradualisme opposé par Eldredge et Gould
          • La stase revendiquée est un modèle réel dans les archives fossiles
          • La morphologie est statique au sein des espèces
          • Et la variation morphologique se produit au moment de la spéciation (cladogenèse)
          • Testé sur des bryozoaires
          • Abondant dans les archives fossiles depuis 100 mois
          • La phylogénie bien connue
          • Confiant que les désignations des morpho-espèces reflètent le phylogent
          • Bryozoaires Cheetham, Jackson et Cheetham des Caraïbes de 20 ans à présent
          • 19 espèces éteintes et vivantes dans deux genres
          • Phylogénie estimée pour chaque genre
          • Aucune des populations n'a montré de traits intermédiaires entre les espèces
          • Les caractéristiques des espèces étaient stables dans le temps
          • c'est-à-dire montre des modèles de stase sans équivoque
          • - Ponctué par un changement morphologique rapide
          • Erwin et Anstey ont examiné 58 études à la recherche de preuves d'équilibre ponctué
          • Grande variété de taxons et d'époques
          • Capacité variée à répondre aux critères de test de stase
          • Mais nombre d'études peuvent compenser cela

          par exemple. Pourquoi la morphologie des bryozoaires resterait-elle inchangée pendant 5 à 10 millions d'années ?

          Adresse utilisant ce qu'on appelle "fossile vivant"

            Espèces ou clades qui montrent peu ou pas de changement mesurable sur des millions d'années
          • Bien que ne retiennent pas nécessairement toutes les caractéristiques « primitives » de la lignée ancestrale
          • 1. Ginkgo biloba Espèce unique existante sans parents vivants proches
          • Feuilles semblables à des fossiles d'impression de 40 Ma
          • Pensé pendant des siècles comme éteint à l'état sauvage, mais on sait maintenant qu'il pousse à l'état sauvage dans au moins deux petites zones de l'est de la Chine
          • 2. Prêle
          • Environ. 15 % d'espèces existantes dans le genre Equisetum sans parents vivants proches
          • Groupe beaucoup plus grand et plus diversifié 350-300 Ma avant que les plantes à graines ne deviennent dominantes
          • 3. Cœlacanthe
          • Les poissons préhistoriques auraient disparu depuis 65 millions d'années
          • Jusqu'à ce qu'un spécimen vivant soit trouvé au large de la côte est de l'Afrique du Sud en 1938
          • Une fois le groupe réussi avec de nombreux genres et espèces
          • Abondant registre fossile de 400 à 65 Ma
          • 4. Crabe en fer à cheval Espèces existantes dans le genre Limule pratiquement identique aux espèces fossiles à partir de 150 Ma
          • Est-ce dû à un manque de variation génétique ?
          • Non, selon Avise et al :
          • Comparaison de la variation de l'ADNmt des limules à celle du clade du crabe ermite royal
          • Variation génétique identique (ou plus) au sein du fer à cheval
          • Au lieu de cela, probablement en raison d'un environnement relativement stable
          • Sélection stabilisatrice autour d'un phénotype optimal
          • 5 épisodes d'extinction majeurs au Phanérozoïque
          • Californie. 20-55% des familles ont disparu
          • Californie. 60 à 95 % des espèces ont disparu en 1 million d'années
          • Étendue mondiale
          • Impliqué un large éventail d'organismes
          • Rapide par rapport à la durée de vie attendue des taxons
          • Bien que "The Big Five" ne soit responsable que de 4% de toutes les extinctions au cours du Phanérozoïque
          • D'autres extinctions à 96 % se sont produites à des taux normaux ou de fond :
          • - Les taxons avec des aires de répartition restreintes et une dispersion limitée sont plus susceptibles de disparaître
          • 5 événements d'extinction de masse reconnus au début des années 1800
          • 1. Ordovicien terminal (environ 440 Ma)
          • 2. Dévonien supérieur (environ 365 Ma)
          • 3. Permien-Trias (252 millions d'années)
          • 4. Extinction de la fin du trias(215 millions d'années)
          • 5. Crétacé-Paléogène (65M)
          • 440 M
          • Extinction de >100 familles d'invertébrés marins
          • par exemple. brachiopodes, bryozoaires, faune récifale
          • Probablement causée par la glaciation du supercontinent sud du Gondwana
          • Dépôts glaciaires de cette période trouvés dans le désert du Sahara
          • La glaciation a également causé l'abaissement du niveau de la mer et la disponibilité réduite de l'habitat du plateau continental
          • 365 M
          • Espèces marines d'eau chaude les plus touchées (par exemple, coraux rugueux, brachiopodes, trilobites)
          • Peut-être causé par un autre épisode de refroidissement global
          • Avec abaissement du niveau de la mer qui l'accompagne
          • Dépôts glaciaires de cet âge dans le nord du Brésil
          • Les impacts de météorites ont également suggéré
          • Mais preuves non concluantes
          • 252 Ma
          • Fin du Paléozoïque
          • Le plus grand des cinq grands
          • Mère des extinctions massives (Erwin 1993)
          • Extinction de 90 à 95 % des espèces marines
          • Invertébrés marins principalement touchés
          • par exemple. foraminifères, trilobites, bryozoaires, brachiopodes, échinodermes
          • Et aussi des vertébrés comme les pélycosaures
          • - Reptiles ressemblant à des mammifères, par ex. Les fossiles de Dimetrodon trouvés dans de nombreux endroits dans le monde
          • Surtout le Texas et l'Oklahoma
          • Où une grande partie du pétrole provient de fossiles du Permien
          • Encore débattu par de nombreuses théories
          • 1. Glaciation sur le Gondwana
          • 2. Réduction de l'habitat du plateau continental peu profond en raison de la formation du supercontinent Pangée
          • - Qui s'est produit au début et au milieu du Permien
          • 3. Grandes éruptions volcaniques en Sibérie
          • - preuves de coulées de lave riches en silice datées de cette époque
          • 215 Ma
          • Particulièrement sévère dans les océans
          • par exemple. brachiopodes, gastéropodes, mollusques gravement atteints
          • Certains groupes terrestres touchés
          • par exemple. certains groupes de reptiles et d'amphibiens
          • Cause précise inconnue
          • Mais d'énormes éruptions volcaniques se sont produites ca. 208-213 Ma alors que le supercontinent Pangée commençait à se séparer
          • Les extinctions du Trias ont permis aux dinosaures de devenir dominants
          • 65 M
          • Fin du Mésozoïque
          • Plancton marin et invertébré touchés
          • Et les dinosaures (non aviaires), les ptérosaures, les reptiles marins de grande taille (ichthyosaures, plésiosaures) anéantis
          • Preuve qu'un énorme astéroïde a frappé la terre
          • - Forte concentration d'iridium à la limite K-Pg
          • - Iridium rare dans la croûte terrestre mais abondant dans les objets extraterrestres
          • La quantité d'iridium suggère un astéroïde de 10 à 15 km de large
          • Présence également de deux autres minéraux à la frontière K-Pg :
          • - Particules de quartz choquées
          • - Microtektites (minuscules particules de verre fondues par la chaleur d'un impact)
          • Connu d'autres sites de crash de météorites bien documentés
          • Quatz et microtektitea choqués à la frontière K-Pg dans les Caraïbes
          • Site d'impact trouvé au début des années 1990 à partir d'anomalies magnétiques et gravitationnelles dans la péninsule du Yucatan
          • Cratère de 180 km de diamètre
          • Dater 65 Ma

          L'océan frappant un astéroïde de 10 km aurait produit une série d'événements affectant le climat, l'atmosphère et la chimie océanique dans le monde entier


          Qu'est-ce qu'une apomorphie ? Qu'est-ce qu'une plésiomorphie ? Quelqu'un peut-il confirmer ces définitions? - La biologie

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          Semaine 2 : Morphologie végétative et clés d'ampli

          Les plantes à fleurs sont le point culminant d'une incroyable cascade d'innovations évolutives. Ce laboratoire vise à les replacer dans le contexte de la diversité des plantes vasculaires et à retracer l'évolution de certains aspects fondamentaux de leur morphologie.

          La première partie de ce laboratoire vise à illustrer l'organisation moins spécialisée du corps végétal retrouvé chez les plantes non florifères et dont est issue la morphologie des angiospermes, tandis que la dernière partie du laboratoire introduit l'utilisation de clés d'identification. Le reste du cours se concentre sur les plantes à fleurs et examinera plus en détail la forme et la fonction des divers organes de ce groupe.

          Le but de la plupart des questions de cet atelier est de vous encourager à examiner attentivement votre matériel pour voir ce qui s'y trouve réellement. Aujourd'hui, l'accent est mis sur feuilles, bourgeons, et tiges. Dans différentes espèces, ils donnent un aspect très différent. Il existe également des termes spécialisés pour discuter de différents types de feuilles. Il n'est pas nécessaire de mémoriser ces termes, mais il est bon de savoir qu'ils existent et où trouver des définitions lorsque vous en avez besoin.

          Dans le laboratoire d'aujourd'hui, nous ferons une très brève visite des feuilles de tous les principaux groupes de plantes vasculaires, des fougères fouet, des fougères, des gymnospermes et en terminant par les angiospermes.

          ![Termes pour différentes formes de feuilles. Figure de N.C.W. Beadle, O.D. Evans & R.C. Carolin (1982) Flore de la région de Sydney. Reed, Sydney.](Fig. 2 Forme de la feuille .tif)

          ![Arrangements foliaires feuilles simples et composées. Figure de N.C.W. Beadle, O.D. Evans & R.C. Carolin (1982) Flore de la région de Sydney. Reed, Sydney.](Fig. 3 Marges des feuilles, simple & compound.tif)

          ##Un groupe basal de fougères : les fougères fouet

          Les premières plantes vasculaires connues consistaient en un système d'axes cylindriques. Les tissus corticaux des parties aériennes avaient des stomates et une cuticule et étaient photosynthétiques, tandis que l'épiderme des parties souterraines n'avait pas de cuticule mais produisait des excroissances ressemblant à des cheveux pour faciliter l'absorption d'eau et de minéraux. De telles plantes ne sont connues que par les archives fossiles, mais il existe deux genres vivants qui se rapprochent de ce niveau d'organisation simple. Ceux-ci sont psilotum et Tmesipteris, qui sont à la fois des "fougères à fouet" et originaires d'Australie.

          Il se compose d'un système de tige portant de petits microphylles. La tige pousse par une seule "initiale" apicale plutôt que par un méristème (un groupe d'initiales).

          • Examinez la ramification de la tige. Ce type de branchement, où il n'y a pas d'axe principal portant des latéraux, est appelé dichotomique. C'est la forme de ramification la plus ancienne chez les plantes et elle est encore courante chez les algues. Pouvez-vous distinguer un axe principal portant des branches latérales, ou toutes les branches sont-elles de taille et de croissance égales ?
          • Déterminez quelle relation, le cas échéant, existe entre la microphylle et la position de la branche. Cette plante a-t-elle des bourgeons axillaires ? S'il n'y a pas de vrais bourgeons, à partir de quel point et de quelle manière se forment les branches ?

          Les membres de ce groupe ont des racines, des tiges et des feuilles, mais ces dernières sont mégaphylles, et ne sont pas homologues avec les microphylles du groupe précédent. Dans les fougères il n'y a pas de système racinaire principal, les racines étant des organes latéraux portés sur les tiges (adventice racines).

          Examiner Lygodium scandens.

          La tige pousse horizontalement sous la surface du sol (c'est un rhizome) seules les feuilles sont visibles. Chaque feuille pousse pendant un an, grimpant sur d'autres plantes vers la lumière, mais finit par mourir pour être remplacée par une nouvelle l'année suivante.

          • Notez que le sommet croissant d'une feuille est enroulé pour protéger la cellule initiale responsable de la croissance. Toutes les feuilles de fougère se déroulent au sommet comme ça, pourquoi est-ce adaptatif ?
          • Utilisez les dessins des Figs.1.1. et 1.2 pour identifier les feuillets primaires et secondaires (pennes et pinnules), et le primaire et le secondaire rachis.
          • Comment décririez-vous la ramification primaire de la feuille ? Y a-t-il des signes de ramification dichotomique dans ces feuilles?
          • Notez que les nervures des folioles (pinnules) se présentent sous la forme d'un système ouvert où les branches se terminent à l'aveugle plutôt que de se rejoindre pour former un filet.
          • Quelle partie, le cas échéant, de Psilotum nudum serait homologue à la feuille de Lygodium scandens? Y a-t-il un organe de ce dernier homologue avec les microphylles du premier ?

          Notez les petites racines adventives fibreuses qui apparaissent à n'importe quel point le long de la tige et les grandes mégaphylles divisées (composées). Ces feuilles se déroulent pendant la croissance.

          • Déterminez la relation (le cas échéant) entre la position des feuilles et la ramification de la tige. Cette espèce a-t-elle des bourgeons axillaires ? Comment les branches sont-elles initiées dans le système de tige?
          • Utilisez les diagrammes de la figure 1 pour déterminer quel type de ramification est présent dans la feuille. Combien y a-t-il d'ordres de ramification dans une feuille ? Identifier les rachis primaire, secondaire et tertiaire.
          • Comparez une feuille d'un an avec une feuille de deux ans. Y a-t-il des preuves d'une croissance indéterminée de ces feuilles?
          • Examinez l'apex du rhizome (tige souterraine). Cette plante a-t-elle un bourgeon apical ? Y a-t-il une protection de l'apex en croissance?

          Ce sont des plantes à graines sans fruits ni fleurs. On pense qu'ils ont dominé la végétation du monde pendant la période plus froide et plus sèche qui a suivi le Carbonifère.

          Examiner Podocarpus elatus

          Podocarpus elatus (Plum Pine) est un conifère originaire des forêts denses de l'est de l'Australie.

          Les feuilles des conifères sont également interprétées comme des mégaphylles, c'est-à-dire comme ayant évolué à partir d'une branche latérale dont la croissance est devenue déterminée et aplatie pour améliorer l'interception de la lumière.

          • Notez les feuilles simples qui caractérisent l'ordre. Les feuilles sont-elles strictement déterminées dans la croissance? Comment sont-ils disposés ? Quel(s) terme(s) décrivent le mieux le phyllotaxie (disposition des feuilles) ?
          • Tenez une feuille contre la lumière et examinez le motif des veines avec une loupe. Pouvez-vous détecter des veines latérales se ramifiant à partir de la nervure médiane ? Ces feuilles ont une feuille continue de cellules ressemblant à des trachéides entre le tissu mésophylle adaxial et abaxial qui distribue l'eau latéralement à travers le limbe à partir de la seule veine médiane.
          • Examinez le modèle de ramification de la tige. Cherchez des bourgeons axillaires à l'aisselle des feuilles. Cette plante a-t-elle une ramification axillaire comme chez les angiospermes ou une ramification apicale comme chez les fougères ?

          Examinez de près l'apex en croissance. Plutôt qu'un méristème apical nu, ce groupe a le méristème protégé dans un bourgeon. A noter que le bourgeon est constitué d'un méristème entouré de feuilles embryonnaires, mais que celles-ci sont elles-mêmes enfermées dans un groupe de écailles de bourgeons, c'est-à-dire des feuilles réduites et durcies qui protègent le bourgeon. Lorsque l'apex commence à pousser au printemps suivant, les écailles des bourgeons tombent (laissant des cicatrices là où elles étaient attachées) et les nouvelles feuilles végétatives se développent à mesure que la tige sort du bourgeon. Les positions des précédents bourgeons d'hiver peut être vu à intervalles le long de la tige. Ils apparaissent comme des anneaux de cicatrices où les écailles des bourgeons étaient attachées.

          • Étant donné que chaque bourgeon d'hiver marque la fin d'une année de croissance, quel âge a l'entre-nœud basal du spécimen que vous examinez ?

          Angiospermes -- Plantes à fleurs

          Remplissez les informations appropriées dans les tableaux 1.1 et 1.2 pendant que vous examinez les angiospermes dans le laboratoire aujourd'hui.

          Il existe de nombreux ordres de plantes à fleurs. Tous se caractérisent par la possession d'un carpelle, la pollinisation à distance du micropyle de l'ovule, et une double fécondation via un tube pollinique. Comme les deux divisions précédentes, leurs feuilles sont des mégaphylles, bien qu'il existe des preuves que le mégaphylle a évolué séparément dans chaque groupe. Contrairement aux conifères, les feuilles des angiospermes peuvent être simples ou composées.

          Notez qu'il a des feuilles simples avec un pétiole court, et que les limbes de celles-ci sont pour la plupart disposés dans un seul plan, s'étalant de chaque côté de la tige. Notez soigneusement comment les feuilles sont attachées aux nœuds successifs.

          • À l'aide d'une loupe et en tenant la feuille à contre-jour, examinez le motif des nervations dans le limbe de la feuille.
          • Y a-t-il des terminaisons veineuses libres dans la feuille ? Quel terme décrit le mieux ce modèle ? En quoi ce motif diffère-t-il de celui de la foliole d'une fougère ?
          • Examinez la relation entre les tiges, les feuilles et les branches. Comment naissent les branches sur la tige ? Cette plante a-t-elle une ramification axillaire ? Chaque aisselle de feuille contient-elle un bourgeon ? Comment distinguer une branche d'Abelia portant deux rangées de feuilles simples d'une seule feuille pennée ?

          Examinez les semis de pois (Pisum sativum) sur votre banc.

          Chaque feuille est composée, constituée d'un pétiole terminé par un rachis portant plusieurs paires de folioles arrondies.

          • Identifiez la paire de grandes stipules arrondies associées à chaque nœud et ressemblant à une paire de folioles basales qui sont attachées directement à la tige. Notez comment ils enferment le bourgeon apical de l'axe principal. Quelle éventuelle valeur adaptative ces stipules pourraient-elles avoir ?

          Examiner Acacia elata (Cèdre Wattle).

          Combien constitue une feuille? Recherchez les bourgeons axillaires qui peuvent apparaître à l'aisselle des feuilles, mais jamais à l'aisselle des folioles. Recherchez également la plus grande unité d'organisation répétée. La feuille est la plus grande unité d'organisation déterminée, à la différence du système de tige indéterminé.

          • Identifier le pétiole, le rachis, les folioles primaires (pinnules) et les folioles secondaires (pinnules). Les folioles primaires et secondaires sont-elles strictement appariées ?
          • Recherchez les glandes en forme de beignet ou de volcan (nectaires) qui sont un trait caractéristique du pétiole et/ou du rachis de Acacia espèce. Quelle pourrait être la valeur adaptative de tels nectaires ?
          • Comparez la forme de ces feuilles avec celles de Gleichenia. En quoi diffèrent-ils ? Laquelle de ces deux formes de feuilles ressemble le plus à un système de tige ? (c'est-à-dire quelle est la mégaphylle la plus primitive ?) Quelles caractéristiques du Acacia considérez-vous comme avancé, et lequel considérez-vous comme primitif ?

          Examiner les spécimens A, B et C

          Chez certains angiospermes, le processus d'adaptation a brouillé la distinction fonctionnelle entre les feuilles et les tiges. Certains de ces exemples sont examinés ci-dessous.

          Dans chacun des spécimens A, B et C, utilisez votre connaissance de la relation entre les tiges, les feuilles et les branches axillaires pour déterminer ce qui constitue une feuille, puis entrez dans le tableau 1.1 la terminologie appropriée de la figure 1.2 pour décrire la forme et la disposition des les feuilles.

          Dans les cas suivants, une partie de la plante a été modifiée pour servir d'aide à l'escalade.

          Examinez le vrilles sur les jeunes plants de pois fournis. Chaque vrille naît près de l'extrémité d'une feuille composée, dans la position dans laquelle vous trouvez une foliole (VÉRIFIEZ CECI) sur une feuille qui n'a pas de vrille.

          Par conséquent, nous pouvons conclure que le développement a été modifié de sorte que les tissus qui se développent normalement dans le feuillet se transforment plutôt en une vrille (c'est-à-dire que la vrille est un feuillet/un pavillon modifié).

          Maintenant, examinez les vrilles sur la branche de Cissus sp. Chacun se pose sur la tige en face d'une feuille. Cela suggère que la plante avait à l'origine des feuilles en paires opposées, et que l'une a été modifiée pour former la vrille.

          Pour vérifier cette explication, trouvez un nœud au niveau duquel aucune vrille n'a été formée.

          Cela montre que notre interprétation initiale est erronée. La vrille ne peut pas être une feuille modifiée.

          S'il ne s'agit ni d'une feuille modifiée ni d'une branche axillaire modifiée, il doit en fait être une modification de la pointe de l'axe principal.

          Chez cette espèce, chaque fois qu'une vrille se forme, elle utilise le méristème apical dans le bourgeon apical, de sorte que la croissance continue de la plante ne peut provenir que d'un bourgeon axillaire émergeant de l'aisselle entre la dernière feuille et la vrille. Au fur et à mesure de sa croissance, la branche axillaire pousse la vrille sur le côté et forme le prolongement de l'axe vertical de la plante. Ainsi l'axe végétal est formé par une nouvelle "branche latérale" à chaque nœud portant une vrille. Ce modèle de croissance est décrit comme croissance sympodiale. Une croissance sympodiale est également observée chez certaines plantes où le bourgeon apical est utilisé pour former une fleur.

          Examiner les spécimens D, E et F

          Déterminer dans chaque cas si la structure grimpante (vrille ou griffe) représente un bourgeon apical, et un bourgeon axillaire, une feuille ou une partie de feuille. Entrez vos réponses dans le tableau 1.2.

          TABLEAU 1 Morphologie des feuilles chez les angiospermes. Pour la forme de la feuille, écrivez la forme, l'apex, la base et la nervation en utilisant les termes des figures 1.1 et 1.2.

          Espèce hspace <20 mm>Forme de la Feuillehspace <20 mm>Disposition des feuilles hspace <15 mm>Stipules

          TABLEAU 2 Modifications pour faciliter l'escalade. Pour la forme de la feuille, notez la forme, l'apex, la base et la nervation en utilisant les termes des figures 1.1 et 1.2.

          Espèce hspace <13 mm>Forme de la feuille hspace <10 mm>Modification pour faciliter l'escalade hspace<10 mm>Organe modifié

          Vérifiez vos réponses auprès des démonstratrices / conférenciers / camarades de classe

          Introduction à l'utilisation d'une clé d'identification

          L'identification des plantes est presque toujours basée sur une clé. Les objectifs de cet exercice sont d'apprendre à utiliser une clé d'identification, mais aussi de se familiariser avec une gamme de caractéristiques végétatives communes des plantes. Utilisez la section précédente et le glossaire pour comprendre tous les termes de la clé.

          Une clé est un dispositif qui élimine progressivement les possibilités jusqu'à ce que l'identification soit complète. À chaque étape du processus, il vous demande de choisir lequel d'une paire de conditions ou de caractères contrastés se produit dans votre spécimen, puis vous dirige vers le prochain choix approprié en fonction de la condition choisie. Il est important de réaliser que vous ne pas doivent utiliser toutes les alternatives possibles pour un même spécimen. Les alternatives contrastées peuvent être organisées de l'une des manières suivantes :

          Dans Clés entre crochets les alternatives contrastées sont placées ensemble, généralement sous un seul numéro. Chaque alternative vous dirige vers l'alternative numérotée qui doit être examinée ensuite. Par conséquent, la première alternative sous le numéro 1 pourrait vous diriger vers 2 (la deuxième paire de conditions contrastées), tandis que la deuxième alternative sous 1 peut vous diriger vers 13, en omettant toutes les paires intermédiaires (2 à 12).

          Dans Clés en retrait les variantes contrastées sont marquées des mêmes symboles (chiffres ou lettres) et en retrait ou en retrait à la même distance de la marge de gauche, mais ne sont pas nécessairement placées directement les unes sous les autres en effet, elles peuvent parfois se trouver sur des pages différentes du livre, donc il faut chercher l'alternative. Généralement, les première et deuxième alternatives sont distinguées comme A et *A, B et *B, etc. Après avoir décidé quelle alternative correspond le mieux à l'échantillon, passez à la paire d'alternatives qui immédiatement suit la bonne alternative (vers le bas!). Par conséquent, si votre échantillon correspond à la seconde des deux alternatives, disons *B, ignorez tous les choix répertoriés sous B et passez au premier choix répertorié sous *B.

          Dans les deux types, il est essentiel de -

          1. procéder toujours vers le bas
          2. lire attentivement toutes les alternativesavant décider lequel correspond le mieux au spécimen et vérifier tous les termes inconnus dans le glossaire. Jamais décidez que la première alternative est correcte avant de lire la seconde de la paire contrastée !

          Tournez-vous maintenant vers la clé au dos du manuel de laboratoire. Il s'agit d'une clé qui utilise uniquement des caractères végétatifs. L'avantage d'une telle clé est qu'elle ne vous oblige pas à avoir des fleurs ou des fruits, qui ne sont sur l'arbre qu'à certaines saisons. Utilisez cette clé pour identifier au moins deux des spécimens.

          Semaine 3 : Morphologie florale et inflorescences

          Référence : Raven, P.H., Evert, R.F. & Eichhorn, S.E. 2013. La biologie des plantes 8$^$ édition pages 478-492.

          Dans cette pratique, nous examinerons les caractères floraux des angiospermes typiques. De plus, nous vous présenterons une terminologie suffisante pour que vous puissiez utiliser des clés d'identification basées sur les caractères reproducteurs.

          Le rayonnement de la structure florale au sein des angiospermes a conduit à une grande variété de structures florales et d'inflorescences. Cela est dû en partie à des événements évolutifs aléatoires et en partie aux pressions de sélection qui découlent d'un mécanisme de pollinisation particulier.
          Parfois, les pollinisateurs sont des animaux qui évoluent eux-mêmes, ce qui signifie que l'évolution de la structure florale ne peut être comprise que dans le contexte de co-évolution-- la plante et l'animal évoluent en même temps et en réponse l'un à l'autre.

          La diversité florale des angiospermes est stupéfiante, mais avec un peu de pratique, elle est également utile --- elle peut être d'une grande aide pour l'identification des plantes. Avec quelques termes et un peu de pratique.

          Comme vous le verrez, les fleurs sont complexes, hautement spécialisées et présentent une énorme diversité morphologique à travers les taxons.Les botanistes ont plusieurs manières de décrire la structure florale.

          La structure florale de base comprend quatre verticilles, comprenant chacun 3 à 5 segments, mais cela varie considérablement d'une espèce à l'autre. Un "tour" est un groupe d'appendices provenant du même point sur un axe. L'identité de chaque verticille floral est déterminée par sa position et sa fonction. Le verticille le plus interne et le plus haut est le gynécée, suivi de l'androcée, de la corolle et du calice (le verticille le plus externe et le plus bas de la fleur.

          Assurez-vous de connaître ces termes (consultez le glossaire à la fin du manuel) :

          croissance déterminée et indéterminée

          symétrie radiale et bilatérale

          périanthe, pétale, corolle, sépale, calice

          Une formule florale peut exprimer le nombre, la fusion et l'insertion des parties florales.

          Les symboles utilisés sont les suivants :

          K : calice (sépales)

          C : corolle (pétales)

          P fait référence au périanthe, lorsque le calice (K) et corolle (C) ne sont pas différents.

          UNE : androcée, c'est-à-dire le nombre et la disposition des étamines et des staminodes.

          g : gynécée c'est-à-dire le nombre et la disposition des carpelles.

          g Qu'est-ce qu'une apomorphie ? Qu'est-ce qu'une plésiomorphie ? Quelqu'un peut-il confirmer ces définitions? - Biologie,[nobr][H1àH2]

          PERSONNAGES CONTRE LEURS JETONS

          Certains des problèmes décrits ci-dessus peuvent provenir du fait que des symboles comme « 0 » et « - » (comme signe « moins ») ont des associations connotatives avec des concepts tels que l'absence ou la perte, qui proviennent d'usages dans d'autres (c'est-à-dire non- contextes phylogénétiques). Un fil conducteur parmi ces problèmes est l'implication que « 0 » est traité comme étant intrinsèquement différent de tout état différent de zéro, peut-être même en remplacement de la primitivité. C'est peut-être le résultat de l'utilisation fréquente de « 0 » pour les états du taxon racine par convention. Il se peut que la convention soit parfois confondue (consciemment ou inconsciemment) avec une nécessité procédurale. Le but de l'examen de certains détails des algorithmes de comptage phylogénétique plus tôt était de souligner le fait que les jetons n'indiquent qu'une identité. Cela permet d'évaluer non seulement en quoi les procédures de notation ci-dessus sont problématiques, mais aussi comment nous choisissons parmi d'autres moyens de traiter ces problèmes, comme décrit dans la section suivante.

          Il est important de ne pas confondre « 0 » avec une déclaration de primitivité lors de la rédaction des listes de caractères et des matrices de notation, en particulier pour les caractères non ordonnés. En théorie, cela ne fait aucune différence que l'absence soit représentée par « - », « + », « 0 » ou « 1 ». En supposant que vous n'ayez pas ordonné ou pondéré de caractères, vous pouvez échanger toutes les instances de « 0 » contre « 1 » et vice versa et vous obtiendrez toujours le même résultat qu'avant. La seule chose qui compte est que les taxons qui partagent les mêmes conditions soient codés de la même manière. En raison des hypothèses par défaut de symétrie transformationnelle, il n'y a pas de différence entre les scores 0 et les scores non 0 lorsque l'évaluation d'un coût de transformation a lieu. Les états 1, 2, 3, etc., ne sont pas des états dérivés tant qu'une analyse phylogénétique n'a pas été effectuée et n'a pas renvoyé ce résultat, et l'algorithme de Fitch n'ajoutera aucune étape supplémentaire si chacun apparaît indépendamment dans l'arbre ou ensemble. De même, l'état 0 n'est pas « l'état plésiomorphe » simplement parce qu'il est étiqueté 0. « Dérivé » et « plésiomorphe » sont des propriétés qui sont exposées lorsque l'algorithme phylogénétique attribue les valeurs optimales des caractères aux nœuds internes. Ils peuvent être représentés par n'importe quel jeton choisi par l'investigateur. Il est de la responsabilité de l'investigateur de s'assurer que les jetons reflètent avec précision les informations de caractère d'une manière vraiment symétrique car l'algorithme de parcimonie (à moins que des commandes spécifiques ne soient données autrement) traitera les transformations de caractère de manière symétrique. La conséquence de ne pas tenir compte de cette symétrie sera une perte d'informations de regroupement.


          Évolution : Glossaire

          Trait acquis Caractéristique phénotypique, acquise au cours de la croissance et du développement, qui n'est pas génétique et ne peut donc pas être transmise à la génération suivante (par exemple, les gros muscles d'un haltérophile). (PBS évolution Glossaire)

          Adaptation le processus évolutif par lequel une population devient mieux adaptée à son habitat. Peut également faire référence à une caractéristique qui est particulièrement importante pour la survie d'un organisme. Par exemple, l'adaptation des dents des chevaux au broyage de l'herbe, ou leur capacité à courir vite et à échapper aux prédateurs. De telles adaptations sont produites dans une population variable par les formes les mieux adaptées se reproduisant avec plus de succès, c'est-à-dire par la sélection naturelle. (Wikipédia)

          Adaptationnisme ou pansélectionnisme un ensemble de méthodes dans les sciences de l'évolution pour distinguer les produits de l'adaptation des traits qui surviennent à travers d'autres processus. Il est utilisé dans des domaines tels que l'éthologie et la psychologie évolutionniste qui s'intéressent à l'identification des adaptations. Les critiques (notamment Richard Lewontin et Stephen Jay Gould) soutiennent que les adaptationnistes (John Maynard Smith, WD Hamilton et Richard Dawkins en étant des exemples fréquents) ont surestimé le pouvoir de la sélection naturelle de façonner des traits individuels à un optimum évolutif et ont ignoré le rôle des contraintes de développement et d'autres facteurs pour expliquer les traits morphologiques et comportementaux existants. (Wikipédia)

          Radiation adaptative l'expansion et la diversification rapides d'un groupe d'organismes au fur et à mesure qu'ils remplissent des niches écologiques inoccupées, évoluant en de nouvelles espèces ou sous-espèces, l'exemple classique étant les pinsons de Darwin. Cela se produit lorsque différentes populations sont isolées les unes des autres sur le plan de la reproduction, généralement en s'adaptant à différents environnements. Les rayonnements destinés spécifiquement à augmenter la diversité taxonomique ou la disparité morphologique, en raison d'un changement adaptatif ou de l'ouverture de l'écoespace, peuvent affecter un ou plusieurs clade, et être rapide ou progressif. rayonnement des mammifères" (voir schéma ci-dessous), bien que dans ce contexte, il soit peut-être préférable de l'appeler rayonnement évolutif. Le rayonnement évolutif dans ce contexte fait référence à un rayonnement à plus grande échelle alors qu'un rayonnement rapide entraîné par l'adaptation d'une seule lignée à son environnement est un rayonnement adaptatif proprement dit. Les radiations adaptatives et évolutives dans ce dernier contexte suivent des extinctions massives, comme lorsqu'au début du Cénozoïque, les mammifères et les grands oiseaux incapables de voler ont rempli les rôles écologiques précédemment occupés au Mésozoïque par les dinosaures.

          Diagramme en fuseau montrant le rayonnement adaptatif des mammifères placentaires au Cénozoïque (chronologie géologique en haut du diagramme). Les placentaires ont rayonné rapidement après l'extinction des dinosaures, et la diversité moderne des formes s'est établie au cours des 10 premiers millions d'années du Tertiaire (au cours du Paléocène). (Basé sur Gingerich 1984.)

          Avancée certains scientifiques évolutionnistes et systématiciens rejettent des termes comme « primitif » ou « avancé » lorsqu'ils discutent d'organismes fossiles ou récents. On pense que ces termes impliquent l'ascension ou la téléologie, et que des termes comme les termes primitifs et avancés suggèrent un certain degré d'« amélioration » ou de supériorité dans le cas d'organismes considérés comme avancés par rapport à ceux considérés comme primitifs. De telles associations sont particulièrement préoccupantes en cladistique, où l'accent est mis uniquement sur une méthodologie empirique vérifiable. Par conséquent, des mots neutres en termes de valeur comme « dérivé » sont utilisés comme alternative. Cependant, on pourrait soutenir que l'évolution peut effectivement faire référence à une augmentation de la complexité et à l'émergence de nouvelles caractéristiques. Cela étant, il n'y a aucune raison pour que ces termes ne puissent pas être utilisés. (MAC)

          allèle Différentes versions du même gène. Par exemple, les humains peuvent avoir des allèles de groupe sanguin A, B ou O. (W. R. Elsberry talk.origins via W.J. Hudson)

          Allométrie La relation entre la taille d'un organisme et la taille de l'une de ses parties, décrite pour la première fois par Otto Snell en 1892 et Julian Huxley en 1932. La croissance allométrique est le phénomène où des parties du même organisme croissent à des rythmes différents. Par exemple, chez diverses espèces d'insectes (par exemple, le coléoptère Hercule), où un petit changement dans la taille globale du corps peut entraîner une augmentation énorme et disproportionnée des dimensions des appendices tels que les pattes, les antennes ou les cornes. Les relations allométriques peuvent être étudiées au cours de la croissance d'un même organisme, entre différents organismes au sein d'une espèce ou entre des organismes d'espèces différentes. Contraste avec la croissance isométrique.

          Acide aminé Les éléments constitutifs moléculaires des protéines. Les propriétés d'une protéine sont déterminées par sa séquence particulière d'acides aminés. Il y a 20 acides aminés dans les protéines de la vie sur Terre.

          Anagenèse la transformation évolutive d'une espèce au fil du temps en une autre, ou en d'autres termes, l'émergence d'un nouveau caractère ou attribut (qui dans ce cas une nouvelle espèce) à partir d'une plus ancienne. L'un des deux principaux paramètres du changement évolutif, l'autre étant la ramification (soit cladogenèse ou bourgeonnement). O'Keefe & Sander 1999 fournissent une étude de cas parmi les pachypleurosaures du Trias moyen, et son interprétation en utilisant des méthodologies phénétiques, cladistiques et stratigraphiques. Le diagramme à droite de Paul Olsen, Conférence 5 Evolution, montrant la relation entre l'anagenèse et la cladogenèse. Voir aussi fig. 1 à Talk Origins : Macroévolution montrant l'anagenèse et la cladogenèse comme paramètres complémentaires (voir aussi ancêtre, descendant). (MAC)

          Analogie/structure analogue Structures ayant une fonction ou un aspect superficiel similaire, mais ayant une origine évolutive différente. Par exemple les ailes d'insectes et les ailes d'oiseaux. Contraste avec les structures homologues.

          Le conte de l'ancêtre livre de vulgarisation scientifique écrit par Richard Dawkins. Le livre retrace l'histoire évolutive de la vie, qui est illustrée comme un pèlerinage dans le temps en direction de l'origine de la vie. Cela crée des séries de 40 "rendez-vous" en suivant l'homme, en tant que créature actuellement sélectionnée, à travers les ancêtres communs les plus récents (appelés "concesseur"). La structure de base du livre est calquée sur celle de Chaucer Contes de Canterbury. (EvoWiki)

          1880 photo du Berlin Archéoptéryx spécimen

          De Vogt, vers 1880. "Archaeopteryx macrura, une forme intermédiaire entre les oiseaux et les reptiles". Ibis 4:434-456.

          Archéoptéryx sans doute la plus célèbre de toutes les formes de transition, Archéoptéryx est l'oiseau connu le plus ancien et le plus primitif, dont la plupart des restes fossiles ont été récupérés au 19ème siècle, dans le calcaire jurassique de Solnhofen en Bavière. Parfaitement intermédiaire entre le reptile (ou plus exactement, le dinosaure théropode) et l'oiseau moderne, sa découverte était une preuve puissante de l'évolution darwinienne. (MAC). Page Wikipédia (couverture détaillée)

          Course aux armements en biologie évolutive comme c'est le cas entre deux nations rivales, une rétroaction positive entre deux ou plusieurs lignées évolutives coévoluant de telle manière que chacune, à son tour, développe des défenses et des armes de plus en plus extrêmes/efficaces en réponse aux attributs des autres. Par exemple, un prédateur peut développer des dents ou des griffes plus grosses, ce qui entraîne une vitesse plus rapide de l'espèce de proie, une taille plus grande ou une armure protectrice, obligeant la lignée de prédateur elle-même à se développer davantage pour pouvoir capturer sa proie. En plus du prédateur et de la proie, peut également se produire avec la co-évolution d'un parasite et de son hôte. Alternativement, la course aux armements peut être entre les membres de la même espèce, comme dans la sélection sexuelle ou les effets de la reine rouge. Voir aussi l'hypothèse d'escalade. (MAK, Wikipédia)

          Selection artificielle Élevage sélectif d'animaux et cultive des cultures pour sélectionner les traits les plus souhaitables dans une population végétale ou animale. La plupart des espèces domestiquées et agricoles ont été produites par sélection artificielle. Ce sont les observations de Darwin dans ce domaine qui ont inspiré l'idée de la sélection naturelle (sans intervention humaine)

          Ascension La prémisse que l'évolution directionnelle, passant de formes primitives et moins parfaites à des formes plus complexes et parfaites, le tout constituant une sorte de gradation hiérarchique, généralement avec l'homme au sommet. La progression de (ce qui est considéré de manière anthropocentrique) d'une forme de vie inférieure à une forme de vie supérieure. L'emblématique et souvent mal interprété de Zallinger (il n'a jamais été destiné à dépeindre un modèle d'évolution strictement linéaire) Marche du progrès donne la représentation classique de la conception profane de l'évolution, montrant la progression de l'homme d'un ancêtre semblable à un singe à travers diverses étapes intermédiaires d'hommes-singes, jusqu'à l'homme moderne. . Selon des écrivains de vulgarisation scientifique comme Stephen Jay Gould, l'idée de l'évolution comme une ligne droite de la boue à l'homme et au-delà est un concept qui a vraiment très peu à voir avec le vrai darwinisme, malgré les apparences superficielles du contraire. D'un autre côté, des domaines modernes tels que la théorie des systèmes et l'étude de la biodiversité à travers le temps montrent que l'évolution est en effet directionnelle en ce sens qu'elle progresse vers des formes plus complexes (alors que des organismes plus simples tels que les bactéries continuent à suivre, c'est une mauvaise interprétation de supposer que La pensée darwinienne et la théorie évolutionniste en général soutiennent une hiérarchie anthropocentrique naïve de l'être.

          Le mème Evolution as Progress est cependant immensément influent dans la pensée humaine. Elle apparaît dans le marxisme, dans la théosophie, dans l'humanisme, dans le transhumanisme et ailleurs. Il est critiqué et réprimandé par les créationnistes religieux anti-évolutionnistes, qui pensent s'opposer au darwinisme, alors qu'ils s'opposent en réalité à quelque chose qui n'a rien à voir avec le darwinisme. Certains penseurs populaires, comme Teilhard de Chardin, ont plaidé pour une cosmologie anthropocentrique, culminant dans un futur point oméga. (MAC)

          Reproduction asexuée (également appelée reproduction végétative) Une forme de duplication utilisant uniquement la mitose. Exemple, une nouvelle plante pousse à partir de la racine ou d'une pousse d'une plante existante. Ce processus ne produit que des descendants génétiquement identiques puisque toutes les divisions se font par mitose. 1. descendance appelée clones signifiant que chacun est une copie exacte de l'organisme d'origine 2. ce mode de reproduction est rapide et efficace permettant la propagation d'un organisme 3. Les descendants étant identiques, le seul mécanisme d'introduction de la diversité génétique est la mutation. (W.J. Hudson)

          Base L'information codant une partie de l'ADN, les lettres du code génétique. La molécule d'ADN est une chaîne de nucléotides constituée chacun d'un squelette composé d'un sucre et d'un groupe phosphate, avec une base azotée attachée. Il existe quatre bases ("lettres" pour ainsi dire) dans le "langage" de l'ADN : l'adénine (A), la guanine (G), la cytosine (C) ou la thymine (T). Dans l'ARN, l'uracile (U) est utilisé à la place de la thymine. A et G appartiennent à la classe chimique appelée purines C, T et U sont des pyrimidines. Dans un brin d'ADN, les bases sont appariées et alignées l'une en face de l'autre : A s'apparie avec T et G s'apparie avec C. La séquence de bases le long de la molécule d'ADN détermine ce que code l'ADN (comme la fabrication d'une protéine, ou activer ou désactiver un gène). Dans les régions codant pour les protéines, trois paires de bases codent pour un seul acide aminé. Par exemple, la séquence de paires de bases ATG code pour l'acide aminé méthionine. (adapté de UCMP Understanding Evolution Glossary et PBS evolution Glossary)

          Mimétisme batésien Une forme de mimétisme dans laquelle une espèce non vénéneuse (le mimétisme batesien) a évolué pour imiter les signaux d'avertissement d'une espèce nuisible ou vénéneuse, afin de dissuader un prédateur. Il porte le nom du naturaliste anglais Henry Walter Bates, d'après son travail dans les forêts tropicales du Brésil. En contraste avec le mimétisme müllerien, une forme de convergence mutuellement bénéfique entre deux ou plusieurs espèces nuisibles. (adapté de Wikipédia)

          Notion d'espèce biologique Partie intégrante de la synthèse évolutive moderne, définit une espèce comme "une communauté reproductive de populations (reproductivement isolée des autres) qui occupe une niche spécifique dans la nature". Le BSC s'applique bien aux animaux à reproduction sexuée, mais pas aussi bien à la vie végétale car il y a un plus grand flux de gènes entre les espèces végétales. Il est également difficile, voire impossible, à appliquer aux archives fossiles. Les fossiles sont divisés en espèces en fonction de la classification taxonomique (similitude des caractéristiques physiques - voir le concept d'espèce morphologique. Voir aussi le concept d'espèce cladistique, le concept d'espèce écologique, le concept d'espèce phénétique et le concept d'espèce de reconnaissance. (W.J. Hudson. Kutschera & Niklas 2004 p.263).

          Goulot, effet de goulot d'étranglement Une forme de dérive génétique qui se produit lorsque la taille d'une population est considérablement réduite. Les fréquences des gènes dans la population sont susceptibles de changer simplement par hasard et de nombreux gènes peuvent être perdus de la population, réduisant ainsi la variation génétique de la population. Lorsque la population augmente plus tard en nombre, les fréquences génétiques résultantes peuvent être nettement différentes de celles d'avant le goulot d'étranglement. (Voir aussi Effet fondateur.) (UCMP Understanding Evolution Glossary, M. W. Strickberger)

          Branchement par commodité, j'emploie ce terme comme le contre-pôle de l'anagenèse. Voir aussi Multiplication d'espèces.

          Bourgeonnant dans un contexte phylogénétique, l'origine d'un nouveau taxon (groupe de population, espèce ou groupe d'espèces), qui n'affecte pas l'existence et les attributs du taxon parental (groupe de population souche, ou groupe souche d'espèces). (Horandl & Stuessy 2010, p.1643). Mayr & Bock (2002) ont inventé ce terme pour désigner la divergence d'un petit groupe de populations, tandis que le reste des populations reste inchangé. Les cas les plus évidents sont les cas de spéciation péripatrique après isolement géographique d'un petit groupe de populations. Cela devrait se produire principalement après des événements de colonisation par quelques individus, puis suivi d'une spéciation rapide et d'une adaptation à de nouveaux environnements. Des preuves récentes provenant d'études biogéographiques sur les animaux et les plantes suggèrent que la spéciation péripatrique peut être plus courante qu'on ne le pensait auparavant, puisque la dispersion, même la dispersion transocéanique, explique de nombreux modèles de distribution disjoints. Les bourgeonnements de ce type sont souvent liés à une grande quantité de changements phénotypiques dans les espèces dérivées, qui subissent une dérive et un changement adaptatif dans la nouvelle situation écologique. En revanche, les populations sources ne sont ni dans un nouvel environnement, ni sous aucune nouvelle pression sélective. » Anagenèse de contraste, cladogenèse. (Horandl & Stuessy 2010, p.1644)

          Explosion cambrienne L'apparition soudaine de tous les phylums animaux actuels au cours du Cambrien inférieur et moyen.

          Cladogenèse (aussi appelé Scission) : La division d'une lignée parentale ancestrale en deux ou plusieurs lignées ou espèces filles, plutôt que la transformation de l'espèce ancestrale in toto (anagenèse). Contrairement au bourgeonnement, la division conduit à l'extinction de la lignée parentale. (W. R. Elsberry talk.origins via W.J. Hudson Horandl & Stuessy 2010, p.1643). Comme le montre le diagramme (à droite) de Moore, Lalicker et Fischer 1952, la cladogenèse a été reconnue, avec l'anagenèse, comme l'un des deux types d'évolution graduelle. Ce paradigme évolutif a été remplacé dans les années 1970 et 1980 par la cladistique. Les arbres hautement formalisés sur lesquels repose la cladistique ne permettent pas l'anagenèse, en conséquence la cladogenèse (et alors seulement une division en deux espèces filles) devient la forme standard de spéciation. Cependant, selon Horandl & Stuessy 2010, p.1644 (qui plaident pour la reconnaissance de la paraphylie) : "seule une partie des processus de spéciation connus peut être classée comme une division d'une espèce en deux ou plusieurs groupes de population isolés. Spéciation allopatrique, où, par exemple, une barrière géographique isole des groupes de population, entraîne une disparition complète de l'espèce d'origine. La spéciation allopatrique a longtemps été préconisée comme le principal mécanisme de spéciation, en particulier dans la littérature zoologique (Coyne & Orr, 2004). Ce mode de spéciation se produit sur des dimensions temporelles plus longues, et il divise l'espèce ancestrale en portions plus ou moins égales. La spéciation allopatrique correspond donc bien au modèle cladistique de divergence symétrique, mais elle n'est plus considérée comme le mode de spéciation prédominant, en particulier chez les plantes (par exemple, Rieseberg & Brouillet, 1994). D'autres processus évolutifs, en particulier le bourgeonnement et la fusion, augmentent la divergence asymétrique et donc l'apparition de la paraphylie." . Voir aussi multiplication des espèces, rayonnement adaptatif. (MAC)

          Codon une unité de trois bases d'ADN qui spécifie un acide aminé ou la fin d'une protéine.

          Co-évolution Évolution chez deux espèces ou plus, comme un prédateur et sa proie ou un parasite et son hôte, dans laquelle les changements évolutifs d'une espèce influencent l'évolution de l'autre espèce. Voir aussi course aux armements évolutive. (PBS évolution Glossaire)

          Co-extinction la perte d'une espèce due à l'extinction d'une autre par exemple, l'extinction des insectes parasites suite à la perte de leurs hôtes. La co-extinction peut également se produire lorsqu'une plante à fleurs perd son pollinisateur ou par la perturbation d'une chaîne alimentaire. (Wikipédia)

          Ancêtre commun Espèce ancestrale qui a donné naissance à deux ou plusieurs lignées descendantes, et représente donc l'ancêtre qu'elles ont en commun.

          Descente commune la prémisse que chaque groupe d'organismes descend d'un ancêtre commun, et que tous les groupes d'organismes, y compris les animaux, les plantes et les micro-organismes, remontent finalement à une origine unique de la vie sur terre. (W.J. Hudson)

          Convergence des formes entre placentaires (à gauche) et marsupiaux (à droite).

          Évolution convergente, Convergence processus dans lequel deux ou plusieurs lignées distinctes développent indépendamment des caractéristiques similaires les unes des autres. En d'autres termes, il existe une convergence évolutive entre deux types non apparentés ou seulement éloignés. Cela se produit souvent parce que les deux lignées sont confrontées à des défis environnementaux et à des pressions sélectives similaires. Une forme d'homoplasie. Comparer Évolution parallèle: par exemple. le requin, le thon, l'ichtyosaure et le dauphin ont tous développé une forme profilée similaire à celle des grands prédateurs aquatiques nageant rapidement. (adapté de UCMP Understanding Evolution Glossary) On peut distinguer deux types de convergence : analogie (modifications convergentes d'une structure ou d'un comportement non homologue, par exemple les ailes d'insectes (probablement dérivées de tergal paranota) et les ailes d'oiseaux (dérivées des pattes antérieures de vertébrés)) et homoiologie (Modifications convergentes d'une structure ou d'un comportement homologue - par exemple, les ailes des ptérosaures, des oiseaux et des chauves-souris représentent une telle homoiologie, car elles sont homologues en tant que patte antérieure des tétrapodes, mais ont été modifiées de manière convergente en dispositifs de vol (ailes)). (Glossaire de Systématique Phylogénétique par Günter Bechly)

          Création La production de matière à partir de rien, ou le développement de la vie à partir de systèmes non vivants. cf. abiogenèse. (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W.J. Hudson)

          Croisement L'échange de nucléotides entre paires de chromosomes homologues lors de la mitose ou surtout de la méiose. (W.R. Elsberry dans talk.origins)

          Darwin, Charles Naturaliste du XIXe siècle considéré comme le père de la science de l'évolution. Son œuvre phare, À propos de l'origine des espèces, publié en 1859, a présenté une multitude de faits soutenant l'idée de l'évolution et a proposé une théorie viable sur la façon dont l'évolution se produit, via le mécanisme qu'il a appelé « sélection naturelle » (comme un processus naturel analogue à la sélection artificielle) A également publié d'importants travaux sur le corail récifs et sur la géologie des Andes, et un récit de voyage populaire de son voyage de cinq ans à bord du HMS Beagle, et une étude scientifique complète des balanes. (adapté du glossaire PBS evolution)

          La théorie de l'évolution de Darwin par sélection naturelle peut être résumée au moyen de trois principes :

          1. Principe de variation. Parmi les individus au sein d'une population, il existe des variations dans la morphologie, la physiologie et le comportement.
          2. Principe d'hérédité. La progéniture ressemble plus à ses parents qu'à des individus non apparentés.
          3. Principe de sélection. Certaines formes réussissent mieux à survivre et à se reproduire que d'autres dans un environnement donné.

          (Griffiths AJF, Miller JH, Suzuki DT, et al. "Introduction", dans Une introduction à l'analyse génétique. 7e édition. New York : W. H. Freeman 2000)

          darwinien De ou se rapportant à la sélection naturelle, ou à la théorie de l'évolution de Darwin en général. Parfois pris pour signifier la sélection naturelle avec des hypothèses graduelles, bien qu'il soit maintenant considéré comme douteux que Darwin était un uniformitariste à ce degré. (modifié de W. R. Elsberry dans talk.origins)

          Classification darwinienne voir Systématique évolutionnaire.

          évolution darwinienne Voir le darwinisme.

          darwinisme En 1859, Charles Darwin a fourni un mécanisme, à savoir la sélection naturelle, qui pourrait expliquer comment se produit l'évolution. La théorie de la sélection naturelle de Darwin a aidé à convaincre la plupart des gens que la vie a évolué et ce point n'a pas été sérieusement remis en question au cours des cent quarante dernières années. Il est important de noter que le livre de Darwin "L'origine des espèces au moyen de la sélection naturelle" a fait deux choses. Il a résumé toutes les preuves en faveur de l'idée que tous les organismes sont descendus avec modification d'un ancêtre commun, et a ainsi construit un dossier solide pour l'évolution. De plus, Darwin a préconisé la sélection naturelle comme mécanisme d'évolution. Les biologistes ne se demandent plus si l'évolution s'est produite ou est en train de se produire. Cette partie du livre de Darwin est maintenant considérée comme étant si largement démontrée qu'on l'appelle souvent la fait d'évolution. Cependant, le mécanisme de l'évolution est encore débattue. cf. Synthèse moderne. (W.J. Hudson). Historiquement, le darwinisme a représenté l'étape du développement de la pensée évolutionniste qui a commencé avec la publication en 1859 de À propos de l'origine des espèces. « Plus précisément, il se réfère au principe de sélection naturelle de Darwin/Wallace comme la principale force motrice de l'évolution. Puisque Darwin (1859, 1872) a accepté le principe de Lamarck de l'héritage des caractéristiques acquises comme source de variabilité biologique, il est tout aussi juste de appelons cela la période de la pensée évolutionniste "Lamarck/Darwin/Wallace". (Kutschera & Niklas 2004, p.259-260)

          Descendant dans ce contexte, une population, une lignée ou une espèce, qui résulte de l'évolution d'un ancêtre (une espèce ou un taxon antérieur). Lorsqu'un certain nombre de descendants partagent le même ancêtre (cladogenèse), l'ancêtre est appelé ancêtre commun. (MAC)

          Diploïde Avoir deux allèles pour chaque gène à chaque locus, un de la mère et un du père. La plupart des animaux, y compris les humains, sont diploïdes. (W.J. Hudson)

          Directionnalité (en évolution) comme défini ici, la prémisse selon laquelle l'évolution commence par des structures ou des formes de vie simples ou primitives et évolue vers une complexité ou une perfection plus grandes, par conséquent certaines formes de vie sont plus complexes, avancées ou évoluées par rapport à d'autres, voir la définition de l'évolution de la théorie des systèmes. Il en résulte un arbre ou une hiérarchie dans laquelle, selon votre point de vue, la vie multicellulaire, les animaux vertébrés ou les êtres humains, ou la conscience de soi, la culture ou le point oméga sont à leur apogée. Alors que l'émergence de la complexité est un fait évident, les philosophes et les scientifiques sont divisés sur la question de savoir si l'évolution elle-même est directionnelle. Voir aussi complexification, émergence, grande histoire. (MAC)

          ADN L'acide désoxyribonucléique, la molécule qui contient l'information génétique.

          Hypothèse d'escalade a hypothèses avancées par Geerat J. Vermeij. Il indique que les organismes sont en conflit constant les uns avec les autres et consacrent donc beaucoup de ressources à contrecarrer les adaptations que l'évolution apporte à tous les organismes concurrents au fil du temps. Cela contraste avec les adaptations que l'évolution peut apporter et qui ne sont pas liées à la compétition avec d'autres organismes, telles que l'adaptation à des niches écologiques basées sur d'autres facteurs tels que la géologie et le climat. Le travail approfondi de Vermeij avec les caractéristiques des fossiles de gastéropodes marins a informé son développement de réflexions sur l'escalade. Une prédiction de l'hypothèse d'escalade est que les espèces individuelles ayant moins d'adaptations qui leur permettent de rivaliser avec d'autres formes de vie sont plus susceptibles de survivre à un événement d'extinction de masse comme celui des Big Five. En effet, il y a plus de flexibilité pour s'adapter à de nouvelles niches écologiques que des adaptations ardues telles que des coquilles lourdes ou une production de venin énergivore entraveraient. (Wikipédia)

          Évolution (Biologie) Un changement dans le pool génétique d'une population au fil du temps. Le processus d'évolution peut être résumé en trois phrases : Les gènes mutent. Les individus sont sélectionnés. Les populations évoluent. (W.J. Hudson) Un sous-ensemble de l'évolution (théorie des systèmes). Voir aussi le darwinisme, la synthèse moderne. Notez que dans le contexte biologique, l'évolution ne s'applique pas aux individus (contrairement aux prémisses de l'évolution consciente). (MAC)

          Théorie des jeux évolutionnaires (EGT) est l'application de la théorie des jeux à l'évolution de la stratégie dépendante de l'interaction dans les populations. L'EGT est utile dans un contexte biologique en définissant un cadre de stratégies dans lequel les caractéristiques adaptatives peuvent être modélisées. Elle est née en 1973 avec la formalisation par John Maynard Smith et George R. Price des stratégies évolutivement stables en tant qu'application de la théorie mathématique des jeux à des contextes biologiques, résultant de la prise de conscience que la fitness dépendante de la fréquence introduit un aspect stratégique à l'évolution. L'EGT diffère de la théorie des jeux classique en se concentrant sur la dynamique du changement de stratégie plus que sur les propriétés des équilibres stratégiques. Malgré son nom, la théorie des jeux évolutionnaires intéresse de plus en plus les économistes, les sociologues, les anthropologues et les philosophes.

          Dans l'article de Smith et Price, "The Logic of Animal Conflict", un modèle informatique a été utilisé pour montrer pourquoi les animaux n'avaient pas adapté une stratégie de "guerre totale". Adaptations pour les mâles axées sur la maximisation de leur capacité à rivaliser les uns avec les autres afin de maximiser leur domination sur un territoire et de mieux rivaliser pour les partenaires. En utilisant la théorie des jeux, ils ont pu tester une variété de stratégies évolutives pour voir laquelle a émergé avec le gain moyen le plus élevé, expliquant pourquoi les animaux n'ont fait qu'évoluer. guerre limitée stratégie, dans laquelle le risque de blessures graves est faible. (Wikipédia)

          Psychologie évolutionnaire branche de la psychologie ou des sciences de l'évolution qui examine les traits psychologiques, tels que la mémoire, la perception ou le langage, d'un point de vue évolutif moderne. Il cherche à identifier quels traits psychologiques humains sont des adaptations évoluées, c'est-à-dire les produits fonctionnels de la sélection naturelle ou de la sélection sexuelle. La psychologie évolutionniste a ses racines historiques dans la théorie de la sélection naturelle de Charles Darwin.[4] La théorie de Darwin a inspiré l'approche fonctionnaliste de la psychologie de William James. Avec les articles fondateurs de W.D. Hamilton (1964) sur la condition physique inclusive, ceux de E. O. Wilson Sociobiologie (1975) ont contribué à établir une pensée évolutionniste en psychologie et dans les autres sciences sociales. (Wikipédia)

          Rayonnement évolutif voir Rayonnement adaptatif.

          Synthèse évolutive voir Synthèse moderne.

          Théorie de l'évolution (ou Théorie du mécanisme évolutif) L'une quelconque des nombreuses théories de la biologie traitant explicitement d'un aspect de l'évolution ou de l'évolution cumulative. Les exemples incluent la « théorie de l'équilibre changeant » de Sewall Wright, la « théorie de l'équilibre ponctué » d'Eldredge et Gould, la théorie de la descendance commune, la « descendance avec modification » de Darwin, « l'orthogénèse » de Henry Fairfield Osborn et « le flux génétique ». Alors que la "théorie évolutionniste" est équivalente, le point que les mécanismes sont proposés et testés dans les théories des mécanismes évolutionnaires mérite d'être souligné et répété. Certains mécanismes augmentent la variation génétique ( cf. mutation, recombinaison, flux de gènes ) et certains diminuent la variation génétique ( cf. sélection naturelle, dérive génétique). (W. R. Elsberry talk.origins via W.J. Hudson)

          Aptitude la capacité d'un organisme individuel à survivre et à reproduire un élément central de la théorie de l'évolution. La forme physique est égale à la contribution moyenne au pool génétique de la prochaine génération qui est faite par un individu moyen du génotype ou du phénotype spécifié. Si les différences entre les allèles d'un gène donné affectent la fitness, alors les fréquences des allèles changeront au fil des générations, les allèles avec une fitness plus élevée deviendront plus courants (en d'autres termes, la sélection naturelle). (Wikipédia)

          Paysage de remise en forme Sewall Wright a proposé que les populations occupent pics adaptatifs sur un paysage de remise en forme. Pour évoluer vers un autre pic plus élevé, une population devrait d'abord traverser une vallée d'étages intermédiaires inadaptés. Une population donnée peut être « piégée » sur un pic qui n'est pas adapté de manière optimale. (Wikipédia)

          Effet fondateur Changements dans la fréquence des gènes qui accompagnent généralement le démarrage d'une nouvelle population à partir d'un petit nombre d'individus. La population nouvellement fondée est susceptible d'avoir des fréquences de gènes très différentes de celles de la population source en raison d'une erreur d'échantillonnage (c'est-à-dire la dérive génétique). La population nouvellement fondée est également susceptible d'avoir une variation génétique moindre que la population source. Pour une explication plus détaillée, consultez notre ressource sur l'adaptation dans Evolution 101. (Lexique de compréhension de l'évolution de l'UCMP)

          Gène L'unité physique et fonctionnelle fondamentale de l'hérédité qui transporte l'information de génération en génération. (W. R. Elsberry talk.origins via W.J. Hudson)

          Famille de gènes Un ensemble de gènes apparentés occupant divers loci dans l'ADN, presque certainement formé par duplication d'un gène ancestral et ayant une séquence reconnaissable similaire. Les membres d'une famille de gènes peuvent être fonctionnellement très similaires ou très différents. La famille des gènes de la globine en est un exemple. (PBS évolution Glossaire)

          Flux de gènes Une théorie des mécanismes évolutifs. Le flux génétique indique que de nouveaux organismes peuvent entrer dans une population par migration à partir d'une autre population. S'ils s'accouplent au sein de la population, ils peuvent apporter de nouveaux allèles au pool génétique local. Chez certaines espèces étroitement apparentées, des hybrides fertiles peuvent résulter d'accouplements interspécifiques. Ces hybrides peuvent véhiculer des gènes d'une espèce à l'autre. (W.J. Hudson)

          Fréquence des gènes La fréquence dans la population d'un gène particulier par rapport à d'autres gènes à son locus. Exprimé en proportion (entre 0 et 1) ou en pourcentage (entre 0 et 100 %). (PBS évolution Glossaire)

          Sélection génétique, théorie du « gène égoïste », ou vision de l'évolution centrée sur les gènes théorie selon laquelle les gènes sont l'unité de sélection. La théorie affirme que bien que les individus fassent l'objet d'une sélection, en raison du croisement et de la recombinaison qui brassent les gènes, ce sont les gènes qui sont sélectionnés pour la durée. Les alternatives à la sélection génétique sont la sélection de groupe et la sélection individuelle.

          La théorie de la sélection génétique est au cœur de la compréhension de la théorie de l'évolution contemporaine et s'est développée à partir de la génétique des populations et de la synthèse moderne, et a été établie comme la principale théorie de la sélection naturelle pendant la révolution Williams. La révolution était basée sur les découvertes de la génétique des populations, et d'autres principaux architectes de la révolution incluent W.D. Hamilton, John Maynard Smith, Robert Trivers et Richard Dawkins, qui ont popularisé la révolution en Le gène égoïste.

          Il existe encore un débat scientifique sur la sélection des gènes, que des biologistes de premier plan tels que Ernst Mayr rejettent la théorie. Mayr (2000) affirme que le gène ne peut pas faire l'objet d'une sélection car c'est l'organisme entier qui vit, se reproduit et meurt, et non des gènes individuels. Ceci, cependant, n'est pas un problème pour la sélection génique, qui a toujours maintenu qu'une partie de l'environnement dans lequel les gènes sont sélectionnés inclut les autres gènes de la population, mais en raison de la recombinaison aucune combinaison de gènes n'existe plus d'une fois, donc bien que les individus peut être l'objet d'une sélection, les gènes sont les unités et l'évolution consiste en un changement de fréquences alléliques indépendantes dans les populations. (EvoWiki)

          Diversité génétique résultant de sources de variation génétique, c'est la variété des allèles et des génotypes au sein d'une population ou d'une espèce.

          Dérive génétique Modifications aléatoires de la fréquence des gènes dans la population qui ne sont pas dues à une pression sélective. Cela peut se produire parce que les différents génotypes n'ont pas d'effet notable sur l'aptitude relative des individus (comme différents haplotypes mitochondriaux), ou la sélection peut ne pas être assez forte pour affecter la transmission du génotype (par exemple, sur une île récemment colonisée sans prédateurs). La dérive génétique est un facteur d'évolution neutre. L'importance de la dérive génétique dans l'évolution est incertaine. Dans une grande population, la plupart des facteurs affectés par la dérive génétique seront mineurs, et la dérive n'est probablement pas significative sur l'ensemble de la population. Cependant, dans une petite population isolée, la dérive peut avoir un effet significatif sur la composition de la population. CKT061201

          Ingénierie génétique Supprimer des gènes de l'ADN d'une espèce et les épisser dans l'ADN d'une autre espèce en utilisant les techniques de biologie moléculaire. (PBS évolution Glossaire)

          Recombinaison génétique voir Recombinaison.

          La génétique La branche de la science qui traite de l'élucidation des attributs et des mécanismes de l'hérédité dans les systèmes vivants. Sur Terre, cela implique des recherches sur l'ARN et l'ADN. (W.R. Elsberry dans talk.origins)

          Génome complément haploïde complet d'ADN (y compris tous les gènes) provenant des chromosomes du noyau d'un organisme. (Biologie du développement 376 Glossaire)

          Génotype Les informations héréditaires contenues dans un individu. (W.R. Elsberry dans talk.origins) Ensemble de deux gènes possédés par un individu à un locus donné. Plus généralement, le profil génétique d'un individu. (PBS évolution Glossaire)

          selon Moore, Lalicker et Fischer

          Gradualisme ou gradualisme phylétique la théorie des mécanismes évolutifs, basée sur la prémisse que le changement évolutif se produit par le changement graduel des populations et non par la production soudaine (saltationnelle) de nouveaux individus qui représentent un nouveau type. De nouvelles espèces évoluent à travers la transformation régulière et progressive de l'ensemble de la population. Le paradigme évolutionniste standard avant le début des années 1970, comme le montre le diagramme (à droite) de Moore, Lalicker et Fischer 1952. Ce point de vue est généralement attribué à Darwin en raison de son influence par la géologie uniformitariste d'Eldredge et Gould, qui ont plutôt soutenu pour les équilibres ponctués. Mais Richard Dawkins a expliqué qu'un tel gradualisme à taux constant n'est pas présent dans la littérature professionnelle, de sorte que le terme ne sert que d'homme de paille pour les défenseurs de l'équilibre ponctué. Dans son livre L'horloger aveugle, Dawkins s'oppose à l'idée que Charles Darwin lui-même était un gradualiste à taux constant, comme suggéré par Niles Eldredge et Stephen Jay Gould. Voir aussi les commentaires de John Wilkins et Larry Moran. (MAK W.J. Hudson, Wikipédia)

          Sélection de groupe théorie selon laquelle les allèles peuvent se fixer ou se propager en raison des avantages qu'ils confèrent aux groupes, quelle que soit l'aptitude des individus au sein de ce groupe. Les idées sélectionnistes de groupe existent depuis que Darwin l'a mentionné dans le Descente de l'homme comme mécanisme possible de l'évolution de l'altruisme humain, mais ont été élaborés plus avant par V.C. Wynne-Edwards dans les années 1960.

          Plus correctement, la sélection de groupe est définie comme la survie et la reproduction différentielles des groupes (Wade 1977). Une réponse à la sélection de groupe se produit lorsque les différences entre les groupes ont une base héréditaire. Pour la sélection de groupe, cela signifie non seulement des différences alléliques à un seul locus, mais aussi des différences génétiques épistatiques, des différences dans les interactions génétiques entre les individus, et même des différences potentiellement culturelles. Ainsi, il est simpliste de parler de sélection de groupe simplement en termes de propagation d'un allèle altruiste.

          Des critiques, notamment de George C. Williams (1966), John Maynard Smith (1964) et C.M. Perrins (1964) a jeté un doute sérieux sur la sélection de groupe en tant que mécanisme majeur dans l'histoire de l'évolution. Ces réponses faisaient partie de la préparation de la révolution Williams dans laquelle la théorie de la sélection génétique est devenue le paradigme prédominant. (EvoWiki)

          haploïde n'ayant que la moitié du complément normal des chromosomes. (W.J. Hudson)

          hétérozygote Avoir deux allèles différents à un locus donné. (W.J. Hudson)

          Hérédité la transmission de traits à la progéniture (de son parent ou de ses ancêtres). C'est le processus par lequel une cellule ou un organisme descendant acquiert ou devient prédisposé aux caractéristiques de sa cellule ou de son organisme parent. Par hérédité, les variations présentées par les individus peuvent s'accumuler et faire évoluer certaines espèces. L'évolution des organismes se produit par le biais de changements dans les traits héréditaires, caractéristiques particulières d'un organisme. Chez l'homme, par exemple, la couleur des yeux est une caractéristique héréditaire et un individu peut hériter du « trait des yeux bruns » d'un de ses parents. Les traits hérités sont contrôlés par les gènes et l'ensemble complet des gènes dans le génome d'un organisme est appelé son génotype. L'ensemble complet des traits observables qui composent la structure et le comportement d'un organisme est appelé son phénotype. Ces traits proviennent de l'interaction de son génotype avec l'environnement. En conséquence, de nombreux aspects du phénotype d'un organisme ne sont pas hérités. Par exemple, la peau bronzée provient de l'interaction entre le génotype d'une personne et la lumière du soleil, ainsi, les bronzages ne sont pas transmis aux enfants des personnes. L'étude de l'hérédité en biologie s'appelle la génétique. Voir aussi Synthèse moderne, Héritage mendélien. (Wikipédia)

          Homoiologie Modifications convergentes d'une structure (ou comportement) homologue. Les ailes des ptérosaures, des oiseaux et des chauves-souris représentent une telle homoiologie, car elles sont homologues en tant que patte antérieure des tétrapodes, mais ont été modifiées de manière convergente en dispositifs de vol (ailes). (Glossaire de Systématique Phylogénétique par Günter Bechly

          Chromosomes homologués paires de chromosomes de même longueur, position centromère et schéma de coloration, avec des gènes pour les mêmes caractéristiques aux loci correspondants. Un chromosome homologue est hérité de la mère de l'organisme, l'autre du père de l'organisme. (Wikipédia)

          Homologie/structure homologue inventé par Richard Owen pour faire référence à la similitude essentielle, plutôt qu'à l'analogie. Avec l'essor de la théorie de l'évolution, la similitude en est venue à signifier le partage d'une origine évolutive commune (Rieppel, 1993, pp.2-3). Dans cette définition, qui est toujours celle utilisée, l'homologie désigne un caractère partagé par un ensemble d'espèces et présent et hérité, avec ou sans modification, de leur ancêtre commun. Par exemple, les os d'une aile de chauve-souris, d'une patte avant de chien et d'un bras humain sont les mêmes, bien que modifiés pour remplir des fonctions différentes (voir le schéma suivant). Contraste avec homoplasie et analogue.

          Le principe d'homologie illustré par le rayonnement évolutif du membre antérieur des mammifères. Tous sont conformes au modèle pentadactyle de base mais sont modifiés pour différents usages. Le troisième métacarpien est ombré tout au long de l'épaule est hachuré.

          Homoplasie en relation avec l'apomorphie, l'autapomorphie, la synapomorphie, la plésiomorphie et la symplesiomorphie

          Homoplasie ayant une origine évolutive indépendante. Caractéristiques similaires mais non le résultat d'un héritage d'un ancêtre commun. Les deux principales causes de caractères homoplasiques sont l'évolution convergente (apparition d'un même caractère dans au moins deux lignées distinctes) et la réversion du caractère (le retour à un caractère ancestral). L'utilisation d'homoplasies lors de la construction d'un cladogramme est parfois inévitable mais doit être évitée lorsque cela est possible. (modifié à partir de Wikipedia et UCMP Understanding Evolution Glossary)

          Homozygote Avoir deux allèles identiques à un locus donné. (W.J. Hudson)

          Monstre plein d'espoir nommé par le généticien d'origine allemande Richard Goldschmidt, qui pensait que de petits changements graduels ne pouvaient pas combler le fossé entre la microévolution et la macroévolution. Dans La base matérielle de l'évolution (1940), Goldschmidt a écrit « le changement d'espèce en espèce n'est pas un changement impliquant de plus en plus de changements atomistiques supplémentaires, mais un changement complet du modèle primaire ou du système de réaction en un nouveau, qui peut ensuite produire à nouveau une variation intraspécifique par micromutation ." Sa thèse a cependant été universellement rejetée et a été largement ridiculisée au sein de la communauté biologique, qui a favorisé les explications néo-darwiniennes de R.A. Fisher, J.B.S. Haldane et Sewall Wright. (Wikipédia)

          Transfert horizontal de gènes (HGT) ou Transfert latéral de gènes (LGT) tout processus dans lequel un organisme incorpore ou transfère du matériel génétique vers ou depuis un autre organisme, sans être la progéniture de cet organisme. Souvent, le transfert se fait entre des membres d'espèces différentes. Par contre, transfert vertical se produit lorsqu'un organisme reçoit du matériel génétique de son ancêtre, par exemple, son parent ou une espèce à partir de laquelle il a évolué. La plupart des réflexions en génétique se sont concentrées sur le transfert vertical, mais il y a une prise de conscience croissante que le transfert horizontal de gènes est un phénomène très important et parmi les organismes unicellulaires peut-être la forme dominante de transfert génétique. Les bactéries, par exemple, se transmettent fréquemment des copies de gènes particuliers et récupèrent du matériel génétique étranger dans leur environnement, ce qui entraîne un transfert horizontal. Les mécanismes comprennent Transformation, l'altération génétique d'une cellule résultant de l'introduction, de l'absorption et de l'expression de matériel génétique étranger (ADN ou ARN), un processus relativement courant chez les bactéries, moins chez les eucaryotes, et utilisé dans les laboratoires pour insérer de nouveaux gènes dans des bactéries pour des expériences ou pour des applications industrielles ou médicales (génie génétique) Transduction, processus par lequel l'ADN bactérien est déplacé d'une bactérie à une autre par un virus Conjugaison bactérienne, un processus dans lequel une cellule bactérienne transfère du matériel génétique à une autre cellule par contact de cellule à cellule et Agents de transfert de gènes, éléments de type virus codés par l'hôte que l'on trouve dans l'ordre des alphaprotéobactéries Rhodobacterales. (Wikipédia, Glossaire de compréhension de l'évolution de l'UCMP) "a joué un rôle important dans l'évolution du génome eucaryote, mais son importance est souvent éclipsée par la plus grande prévalence et notre compréhension plus avancée du transfert de gènes chez les procaryotes. Les endosymbioses récurrentes et l'échantillonnage généralement médiocre de la plupart des gènes nucléaires de diverses lignées ont également compliqué la recherche de gènes transférés. Néanmoins, le nombre de cas bien étayés de transfert de procaryotes et d'eucaryotes, dont beaucoup ont des implications fonctionnelles importantes, augmente maintenant rapidement. " (Keeling & Palmer 2008, résumé)

          Hybride une progéniture résultant d'un croisement entre deux espèces différentes. Les hybrides animaux sont souvent infertiles. Le mulet par exemple est un croisement d'un cheval femelle et d'un âne mâle. Le bardot, croisement entre une ânesse et un cheval mâle (mulet et bardot sont des hybrides réciproques). Cependant, il existe également des hybrides fertiles, par ex. entre les coyotes, les loups, les dingos, les chacals et les chiens domestiques. Les espèces végétales s'hybrident plus facilement que les espèces animales, et les hybrides résultants sont plus souvent des hybrides fertiles et peuvent se reproduire, bien qu'il existe encore des hybrides stériles et une élimination hybride sélective où la progéniture est moins capable de survivre et est donc éliminée avant de pouvoir se reproduire. Un certain nombre d'espèces végétales sont le résultat de l'hybridation et de la polyploïdie avec de nombreuses espèces végétales à pollinisation croisée et produisant des graines viables, la distinction entre chaque espèce est souvent maintenue par un isolement géographique ou des différences dans la période de floraison. (Wikipédia)

          Théorie du fitness inclusif en biologie évolutive et en psychologie évolutive, il soutient qu'un organisme peut améliorer son succès génétique global par un comportement social coopératif. La théorie définit la fitness inclusive d'un organisme comme la somme de sa fitness classique (combien de sa propre progéniture il produit et soutient) et le nombre d'équivalents de sa propre progéniture qu'il peut ajouter à la population en soutenant d'autres. (PBS évolution Glossaire)

          Héritage des caractéristiques acquises théorie proposée par Jean Baptiste Lamarck, selon laquelle l'évolution se produit par l'hérédité de traits ou de capacités qu'un organisme acquiert au cours de la vie. Par exemple, la girafe ancestrale a étiré son cou pour atteindre les feuilles des arbres et a ainsi transmis un cou et des pattes légèrement plus longs à sa progéniture. Également appelée « théorie de l'utilisation et de la désuétude ». Bien qu'il ait été rejeté par le néodarwinisme de Weismann, le lamarckisme est resté populaire jusqu'au début du XXe siècle, en particulier en France, mais a été supplanté par la synthèse des théories darwinienne et mendellienne.

          Intron « séquence intermédiaire », un tronçon de séquence d'acide nucléique épissé à partir du transcrit d'ARN primaire avant que l'ARN ne soit transporté vers le cytoplasme en tant qu'ARNm mature peut faire référence soit à la séquence d'ARN, soit à la séquence d'ADN à partir de laquelle l'ARN est transcrit. Voir aussi exon. (Biologie du développement 376 Glossaire)

          Lignée dans ce contexte, une lignée évolutive, une séquence d'ancêtres et de descendants (qui peuvent être des cellules, des gènes, des populations, des espèces) qui évoluent dans le temps.

          Lieu L'emplacement d'un gène sur un chromosome. À n'importe quel locus, il peut y avoir de nombreux allèles différents dans une population, plus d'allèles que ne peut en posséder un seul organisme. Par exemple, aucun humain ne peut porter simultanément les allèles de groupe sanguin A, B et O. (W.J. Hudson)

          Macroévolution Évolution au niveau ou au-dessus du niveau de l'espèce. La frontière entre macro et micro est floue, car certains chercheurs préfèrent inclure la spéciation dans la micro et d'autres pensent que le seul macro-processus qui donne des événements distinctifs est la spéciation. Les événements de spéciation sont donc, pour de nombreux scientifiques, des exemples de macroévolution. Une autre définition est une évolution trop imperceptible pour être observée du vivant d'un chercheur. (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W. J. Hudson) lien: Macroévolution sa définition, sa philosophie et son histoire par John Wilkins

          Par les utilisateurs de Wikipedia Seb951 et Stannered.

          Extinction de masse Événement impliquant des taux d'extinction plus élevés que le degré habituel d'extinction de fond. Voir Big Five pour un diagramme des taux d'extinction et un résumé des cinq extinctions majeures.

          Méiose Processus qui convertit une cellule diploïde en un gamète haploïde et provoque une modification de l'information génétique pour augmenter la diversité de la progéniture. (W.J. Hudson). Dans la première étape de la reproduction sexuée, qui est la méiose, le nombre de chromosomes est réduit d'un nombre diploïde (2n) à un nombre haploïde (n). Lors de la fécondation, les gamètes haploïdes se rassemblent pour former un zygote diploïde et le nombre initial de chromosomes (2n) est restauré. (Graphique Wikipédia de Stannered)

          Mème concept controversé proposé par Richard Dawkins. Un mème est une "unité d'héritage culturel, supposée analogue au gène particulaire et naturellement sélectionnée en raison de ses conséquences "phénotypiques" sur sa propre survie et sa réplication dans l'environnement culturel". Un mème peut être une idée, une compétence, une histoire ou une coutume, qui est transmise d'une personne à une autre par imitation ou enseignement. Certains théoriciens soutiennent que les mèmes sont l'équivalent culturel des gènes et se reproduisent, mutent, sont sélectionnés et évoluent de la même manière. L'étude des mèmes s'appelle mémétique. (Mavericks of the Mind PBS évolution Glossaire)

          Héritage mendélien Le mode de transmission génétique de toutes les espèces diploïdes, et donc de presque tous les organismes multicellulaires. L'héritage est contrôlé par des gènes, qui sont transmis à la progéniture sous la même forme qu'ils ont été hérités de la génération précédente. À chaque locus, un individu possède deux gènes, l'un hérité de son père et l'autre de sa mère. Les deux gènes sont représentés en proportions égales dans ses gamètes. (PBS évolution Glossaire) Pendant un certain temps, la redécouverte de l'œuvre de Mendel a été considérée comme le clou décisif dans le cercueil darwinien, tuant l'idée de sélection naturelle telle que Darwin la proposait. Puisque par la publication de la sixième édition de « L'origine des espèces » de Darwin, Darwin avait presque inextricablement lié la sélection naturelle à son hypothèse sur le mécanisme de l'hérédité, la « pangenèse », ce point de vue était tout à fait compréhensible. Cependant, au début des années 40, la synthèse néo-darwinienne avait rencontré et adressé les critiques des mendélistes. (Peter J. Bowler. 1984. Evolution: the history of an idea. University of California Press. Review by W. R. Elsberry link)

          Tableau montrant comment les gènes s'échangent selon la ségrégation ou l'assortiment indépendant pendant la méiose et comment cela se traduit dans les lois de Mendel.

          Microévolution Évolution au sein de l'espèce, ou changement de la fréquence des allèles dans une population au fil du temps. Notez que cette connotation est équivalente à l'évolution. Tous les « créationnistes scientifiques » admettent jusqu'à présent que la microévolution est observée. Certains anti-évolutionnistes théistes ne le peuvent pas. (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W. J. Hudson)

          Mimétisme comportement imitatif, une espèce se ressemblant et gagnant ainsi des avantages. Par exemple des mouches inoffensives qui ont la même coloration que les abeilles et les guêpes. Parce que les prédateurs savent que les guêpes piquent, ils ont tendance à éviter tout ce qui leur ressemble. Voir mimétisme batésien et mimétisme müllerien. (Lexique Wikipédia)

          Mitochondries (chanter. mitochondrie) : Un petit organite rond présent dans la plupart des cellules de presque tous les eucaryotes. Ils sont entourés de deux membranes dont l'intérieur est replié en invaginations appelées crêtes, où se déroule la respiration aérobie. Les mitochondries produisent des enzymes qui convertissent les aliments en énergie. Ils contiennent de l'ADN qui code pour certaines protéines mitochondriales. Parce que les mitochondries sont généralement transportées dans les ovules mais pas dans le sperme, l'ADN mitochondrial est hérité des mères mais pas des pères. Par conséquent, il est possible de retracer l'ascendance à travers la lignée maternelle (voir aussi Eve mitochondriale). (PBS évolution Glossaire, Wikipédia)

          Mitose La division cellulaire. Toutes les divisions cellulaires dans les organismes multicellulaires se produisent par mitose, à l'exception de la division spéciale appelée méiose qui génère les gamètes. (PBS évolution Glossaire)

          Synthèse moderne Aussi appelée "synthèse évolutive", "théorie synthétique", et surtout synthèse évolutive moderne. Les années 1920 ont vu l'émergence d'une version élargie du darwinisme, qui a été fondée par Ronald Fisher, J. B. S. Haldane et Sewall Wright. Ils ont réconcilié l'idée d'évolution par sélection naturelle avec la nature discontinue et particulaire des gènes. C'était l'essence de la synthèse moderne de la théorie de Darwin et de la génétique mendélienne. La nouvelle synthèse continue de se développer dans les années 1940, notamment avec celle de Julian Huxley, Évolution : la synthèse moderne (1942) et celui de Bernhard Rensch, Évolution au-dessus du niveau de l'espèce (1947). La sélection naturelle était considérée comme la force dominante qui façonnait le changement évolutif. Rensch a exprimé l'opinion que rien dans la nature biologique ne suggère que des processus évolutifs autres que la sélection naturelle fonctionnent sur la génétique naturelle de la variation au sein des populations. Le grand débat : le darwinisme aujourd'hui. La révolution du paradigme synthétique était beaucoup plus large que le concept néo-darwinien de Weismann et Wallace, incorporant des faits de domaines tels que la génétique, la systématique et la paléontologie. (Kutschera & Niklas 2004, p.256)

          La synthèse moderne est une théorie sur le fonctionnement de l'évolution au niveau des gènes, des phénotypes et des populations, alors que le darwinisme concernait principalement les organismes, la spéciation et les individus. La synthèse moderne diffère du darwinisme sous trois aspects importants : 1. Elle reconnaît plusieurs mécanismes d'évolution en plus de la sélection naturelle. L'une d'entre elles, la dérive génétique aléatoire, peut être aussi importante que la sélection naturelle. 2. Il reconnaît que les caractéristiques sont héritées en tant qu'entités discrètes appelées gènes. La variation au sein d'une population est due à la présence de plusieurs allèles d'un gène. 3. Il postule que la spéciation est (généralement) due à l'accumulation progressive de petits changements génétiques. Cela équivaut à dire que la macroévolution est simplement beaucoup de microévolution. (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W. J. Hudson)

          Évolution de la mosaïque Parce que l'évolution ne se produit pas de manière uniforme, mais que des caractéristiques différentes évoluent à des rythmes différents, les organismes de transition ont tendance à avoir une mosaïque de caractéristiques de descendants ancestraux/primitifs et plus spécialisés. Ainsi, par exemple, les premiers tétrapodes avaient à la fois des caractéristiques de poisson et d'amphibien, et Archéoptéryx possédait à la fois des caractéristiques de dinosaure et d'oiseau. (MAC)

          Multiplication des espèces La théorie selon laquelle les espèces se multiplient, soit par division en espèces filles, soit par "bourgeonnement", c'est-à-dire par l'établissement de populations fondatrices géographiquement isolées qui évoluent en de nouvelles espèces. (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W. J. Hudson)

          Mutation Une erreur de duplication de matériel génétique qui se traduit par une séquence différente et/ou un nombre différent de paires de bases dans la copie par rapport à l'original. La mutation crée de nouveaux allèles. (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W. J. Hudson)

          Morphologie L'étude de la forme et de la structure des organismes, tels que les animaux et les plantes et leurs restes fossiles. Par exemple, comparer la forme du fémur chez différents mammifères au pâturage est une étude morphologique. (Lexique de compréhension de l'évolution de l'UCMP). Morphologie brute se réfère aux structures collectives ou à un organisme dans son ensemble comme une description générale de la forme et de la structure d'un organisme, prenant en compte toutes ses structures sans spécifier une structure individuelle. Anatomie est l'étude de la forme et de la structure des caractéristiques internes d'un organisme. Morphologie comparée est l'analyse des modèles du locus des structures dans le plan corporel d'un organisme et constitue la base de la catégorisation taxonomique. Morphologie fonctionnelle: l'étude de la relation entre la structure et la fonction des caractéristiques morphologiques. Morphologie expérimentale est l'étude des effets de facteurs externes sur la morphologie des organismes dans des conditions expérimentales, tels que l'effet de la mutation génétique. (Wikipédia La morphologie se rapporte au phénotype plutôt qu'au génome ("la morphologie moléculaire" a été utilisée pendant un certain temps pour décrire la structure des molécules composées, telles que les polymères et l'ARN, est un domaine distinct).

          Sélection naturelle Reproduction différentielle et, par conséquent, transmission d'allèles entre générations, d'individus dans une population, en raison de la variation héréditaire d'un ou de plusieurs traits qu'ils possèdent. C'est un mécanisme par lequel l'évolution peut se produire. (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W. J. Hudson). Conçu indépendamment puis publié conjointement par Darwin et Wallace, et substantiellement élaboré au début du vingtième siècle avec la redécouverte de la génétique mendélienne puis les progrès de la génétique des populations. (Kutschera & Niklas 2004, p.256)

          Néo-darwinisme historiquement, terme inventé par Romanes (1895) pour désigner l'incorporation des idées de Weismann sur l'hérédité dans la théorie de la sélection naturelle de Darwin, montrant comment la variation biologique est générée et rejetant l'héritage lamarckien du darwinisme antérieur. (Kutschera & Niklas 2004, p.260). Le terme est également utilisé comme synonyme de synthèse moderne, ou même de toute approche moderne de la théorie de l'évolution.

          Théorie neutre de l'évolution moléculaire La théorie neutre de l'évolution moléculaire a été formellement suggérée par Motoo Kimura en 1968, et soutient que la majorité des mutations survenant au sein d'une population sont sélectivement neutres (c'est-à-dire n'ont ni effet positif ni négatif), et que la dérive génétique plutôt que la sélection naturelle est un facteur majeur de différences entre les populations. Alors que le débat continue sur l'importance relative de ces deux processus, la théorie neutre est devenue l'hypothèse nulle pour les tests de savoir si la sélection naturelle s'est produite dans une lignée donnée. Une implication majeure de cette théorie est que les mutations devraient s'accumuler à un taux assez constant, et donc les temps de divergence entre les lignées devraient être calculables à partir du degré de divergence - la soi-disant horloge moléculaire. L'utilité et l'application correcte des horloges moléculaires restent un sujet très controversé dans les études sur l'évolution. Références : Kimura, M. 1968. Taux d'évolution au niveau moléculaire. La nature 217 : 624-626. pdf Wikipédia : Théorie neutre de l'évolution moléculaire. CKT070830

          Néo-Lamarckisme Alternative populaire au darwinisme à la fin du XIXe et au début du XXe siècle, basée sur l'idée de Lamarck des caractéristiques acquises. Le néo-lamarckisme était soutenu par la théologie naturelle, populaire en Amérique au tournant du siècle. Spencer soutenait le néo-lamarckisme. "Contre la sélection elle-même, Spencer [1893] a utilisé un argument qui avait une force considérable lorsqu'on le comparait à la théorie de la sélection prégénétique (Ridley, 1982a). Il a souligné que lorsqu'une nouvelle structure évolue, tout le reste du corps doit s'adapter à la nouvelle Ainsi, une série de variations serait nécessaire pour ajuster la structure globale d'une manière corrélée au nouvel organe. Quelles seraient les chances que toutes ces variations apparaissent ensemble au bon moment, si l'espèce devait dépendre d'une variation aléatoire ? La sélection pourrait expliquer les changements dans un seul organe, mais pas une transmutation intégrée de tout le corps." Le lamarckisme, comme l'a souligné Spencer, pourrait fournir une explication du développement intégré ou de l'élimination des organes. Cela a été considéré comme une faiblesse de la sélection naturelle. "La loi de "l'accélération de la croissance" a été publiée pour la première fois dans "Sur l'origine des genres" de Cope de 1867 (réimprimé dans Cope, 1887) et dans Hyatt (1868). Selon cette loi, l'évolution progresse par une série d'ajouts soudains à la croissance de l'individu. À certains moments, chaque individu d'une espèce commence à présenter une nouvelle phase de croissance qui avance tous vers la forme d'une nouvelle espèce. Pour faire de la place à cet ajout, la forme adulte ancienne est comprimée Retour à une phase de croissance antérieure, d'où "l'accélération" de la croissance pour s'adapter à une étape supplémentaire avant la maturité. Cope a nié que l'évolution à petite échelle est un processus de ramification, affirmant plutôt que chaque genre représente un groupe d'espèces qui ont atteint la même point dans le développement historique de leur groupe. Leur relation étroite n'est pas un signe de descendance commune mais de position identique dans le schéma de développement. « Cope a postulé une force de croissance appelée « bathmisme » concentrée dans les parties du corps les plus utilisées, il les a développées aux dépens d'autres domaines. Au cours de la dernière décennie du siècle, ce lamarckisme avait été développé à une profondeur considérable (Cope , 1887, 1896 Hyatt, 1880, 1884, 1889)." Se référant au cas du crapaud sage-femme : « L'encre de Chine a-t-elle été ajoutée par quelqu'un souhaitant préserver les marques originales, ou était-ce un sabotage délibéré, peut-être un complot nazi visant à discréditer des preuves hostiles à leurs théories raciales ? Koestler a certainement suggéré que les expériences de Kammerer peut-être vraiment réussi, bien que d'autres pensent qu'il était simplement malhonnête. (Aronson, 1975). " (Peter J. Bowler. 1984. Evolution : l'histoire d'une idée. University of California Press. Revue par W. R. Elsberrylink)

          Non-directionnalité (en évolution) telle qu'elle est définie ici, le postulat que l'évolution n'a pas de sens, que la nature ne tend pas vers une plus grande complexité, qu'il est trompeur de parler de « inférieur », de « plus simple » ou de « primitif », et que toute tentative d'imposer une narratif sont des vestiges d'idées victoriennes telles que l'ascension. La non-directionnalité est favorisée par certains évolutionnistes tels que Steven Jay Gould. Voir aussi cosmisme, réductionnisme. Contraste avec l'anthropocentrisme, l'ascension, la directionnalité, l'évolution (théorie des systèmes) et la téléologie. (MAC)

          Lien non manquant Bien que les créationnistes prétendent souvent qu'aucune forme de transition n'est connue dans les archives fossiles, c'est en fait l'inverse qui se produit. (voir lien). Comme il serait oxymorique de désigner ces espèces intermédiaires par leur surnom populaire comme "chaînon manquant" (par exemple, lien de lien), j'ai inventé le terme informel "lien non manquant". Voir aussi anagenèse, ancêtre, ancêtre commun, taxon basal, groupe souche. Notez que même si, compte tenu des caprices des archives fossiles, le chaînon non manquant peut ne pas être nécessairement l'ancêtre réel, littéral et commun de toutes les espèces ultérieures de cette lignée (bien que dans certains cas où la conservation stratigraphique est très bonne, il pourrait), mais ce serait certainement une forme étroitement liée. (MAC)

          Ontogénie Le processus de développement et de croissance d'un individu de zygote à adulte. (W.R. Elsberry dans talk.origins). Voir aussi biologie du développement, evo-devo, morphogenèse.

          L'ontogenèse récapitule la phylogénie Voir Récapitulation.

          Orthogenèse une conjecture liée au lamarckisme. "La différence cruciale est que les tendances de l'orthogenèse ne sont pas adaptatives. Loin d'être une réponse positive à l'environnement, elles représentent une force non utilitaire qui peut dans certains cas conduire l'espèce à l'extinction. En cela, il y a une similitude avec le concept de Hyatt de sénilité raciale." "Un cas célèbre était celui de l'"élan irlandais" récemment disparu, qui aurait disparu parce que ses bois sont devenus trop gros à la suite d'une tendance interne (Gould, 1974b). Il semblait que la tendance qui a produit les bois, peut-être à l'origine dans un but utile, avait acquis un élan propre qui l'avait porté bien au-delà du point d'utilité. Cette théorie de « surdéveloppement » de l'extinction est devenue très populaire parmi les paléontologues non darwiniens au début du XXe siècle. » "Un fort soutien à l'orthogenèse est venu du biologiste russe Leo S. Berg (traduction 1926), mais peut-être que son représentant le plus connu était le paléontologue américain Henry Fairfield Osborn." Aristogenèse—Le propre terme d'Osborn pour l'orthogenèse. Le mendélisme était à l'origine considéré comme une alternative à la sélection. (Peter J. Bowler. 1984. Évolution : l'histoire d'une idée. Presse de l'Université de Californie. Revue par W. R. Elsberry lien)

          Organisme membre individuel d'une espèce, c'est-à-dire une seule entité biologique, soit unicellulaire (unicellulaire) ou multicellulaire (multicellulaire). Un système vivant tel qu'un animal, une plante, un champignon ou un micro-organisme eucaryote ou procaryote, capable de répondre aux stimuli, à la reproduction, à la croissance et au maintien de l'homéostasie en tant qu'ensemble stable. De manière familière et informelle, le terme peut également être utilisé dans les récits évolutifs pour désigner une espèce ou une population, plutôt que simplement un individu. (de Wikipédia, MAK, Fossil Mall)

          Évolution parallèle le développement d'un ou de plusieurs traits similaires chez des espèces apparentées, mais distinctes, descendant du même ancêtre, mais de clades ou de lignées différentes. Par exemple:

          • Les porcs-épics de l'Ancien et du Nouveau Monde partageaient un ancêtre commun, les deux ont développé des structures de plumes étonnamment similaires.
          • Evolution contemporaine des chevaux brouteurs et des paléotheres partageant tous deux le même espace environnemental.
          • Posture verticale développée indépendamment parmi plusieurs lignées d'archosaures triasiques.
          • La fertilisation interne a évolué indépendamment chez les requins, certains amphibiens et amniotes.
          • Le Patagium est une membrane charnue que l'on trouve chez les mammifères planeurs tels que: les lémuriens volants, les écureuils volants, les planeurs de sucre et les disparus Volaticotherium. Ces mammifères ont acquis le patagium indépendamment.
          • Les Pyrotheriens sud-américains ont développé un plan corporel (membres graviportaux, tronc, défenses) similaire aux premiers proboscidiens. indique que le lophophore, une structure d'alimentation complexe, a évolué indépendamment parmi les bryozoaires et les brachiopodes, deux phylums auparavant regroupés mais maintenant considérés comme n'ayant qu'une parenté lointaine.

          L'un des exemples les plus spectaculaires d'évolution parallèle est fourni par les deux branches principales des mammifères, les placentaires et les marsupiaux, qui ont suivi des voies évolutives indépendantes suite à l'éclatement de masses continentales telles que le Gondwana il y a environ 100 millions d'années. En Amérique du Sud, les marsupiaux et les placentaires partageaient l'écosystème (avant le Grand Échange Américain) en Australie, les marsupiaux prédominaient et dans l'Ancien Monde, les placentaires l'emportaient. Cependant, dans toutes ces localités, les mammifères étaient petits et n'occupaient que des endroits limités dans l'écosystème jusqu'à l'extinction massive des dinosaures soixante-cinq millions d'années plus tard. À cette époque, les mammifères des trois masses continentales ont commencé à assumer une plus grande variété de formes et de rôles. Alors que certaines formes étaient uniques à chaque environnement, des animaux étonnamment similaires ont souvent émergé dans deux ou trois des continents séparés. Des exemples de ceux-ci incluent les litopterns et les chevaux, dont les pattes sont difficiles à distinguer le chat européen à dents de sabre (Machairodontinae) et le marsupial sud-américain à dents de sabre (Thylacosmilus), le loup de Tasmanie et le loup européen ainsi que les taupes marsupiales et placentaires, les écureuils volants , et (sans doute) des souris. (modifié de Wikipédia)

          Phénotype L'ensemble des caractéristiques physiques ou comportementales mesurables ou détectables d'un individu. Le phénotype représente l'expression du génotype de l'individu tel que modifié par les conditions environnementales au cours de l'ontogenèse de l'individu. (W.R. Elsberry dans talk.origins)

          Phylogénie terme inventé par Haeckel (Haeckel 1866): l'étude de l'histoire familiale de la vie, les relations évolutives entre les groupes d'organismes, souvent illustrée par un arbre d'évolution ramifié. Suite

          Homme de Piltdown célèbre canular de 1912 de l'homme fossile primitif, composé d'un crâne humain, d'une mâchoire de singe et de dents limées. A eu un impact négatif significatif sur les premières recherches sur l'évolution humaine : les découvertes de fossiles d'australopithèques trouvés dans les années 1920 en Afrique du Sud ont été ignorées et à la place la théorie populaire (mais erronée) a soutenu que le cerveau humain s'agrandit avant que la mâchoire ne s'adapte à de nouveaux types de nourriture. plutôt que l'inverse. Définitivement exposé comme un faux par des scientifiques en 1953. (MAK, Wikipédia)

          Polyploïdie contenant plus de deux paires (homologues) de jeux de chromosomes. (Wikipédia)

          Population Un groupe d'individus potentiellement croisés de la même espèce trouvés au même endroit au même moment (Booth et al. 2003). Groupe d'organismes, généralement une seule espèce, et généralement isolé des autres membres de son espèce d'une manière ou d'une autre. (W.J. Hudson)

          Plasmide Un élément génétique qui existe (ou peut exister) indépendamment de l'ADN principal de la cellule. Dans les bactéries, les plasmides peuvent exister sous forme de petites boucles d'ADN et être transmis indépendamment entre les cellules. (PBS évolution Glossaire)

          Primitif ancestral, similaire ou identique aux formes originales, membre basal ou tige d'une lignée, a tendance à être généraliste, n'a pas les caractéristiques spécialisées de ses descendants. La cladistique rejette des termes comme « primitif », en utilisant à la place la plésiomorphie plus technique et (pour les étrangers et les geeks non paléo) obscure. Néanmoins, "primitif" ne doit pas être assimilé anthropomorphiquement à l'avancement, à la technologie, etc., comparez "primitif" ou "primordial". Voir aussi mes commentaires sur "avancé". (MAC)

          Évolution progressive et ponctuée

          Équilibres ponctués (plus connu sous le nom évolution ponctuée) : une théorie de l'évolution qui soutient que les nouvelles espèces évoluent soudainement et dans des zones géographiquement isolées. La plupart des spéciations impliquent la cladogenèse plutôt que l'anagenèse, et se produisent via la spéciation péripatrique. Par conséquent, la spéciation est rarement trouvée dans les archives fossiles, car les espèces établies, peuplées et répandues (le genre qui est le plus susceptible simplement par un plus grand nombre de laisser des restes fossiles) changent généralement lentement, voire pas du tout, pendant leur temps de résidence. Les nouvelles espèces ont tendance à se développer dans une région géographiquement limitée et une étendue stratigraphiquement limitée, qui est petite par rapport à l'époque et à la distribution globales de l'espèce. L'échantillonnage des archives fossiles révélera un schéma de la plupart des espèces en stase, l'apparition abrupte d'espèces nouvellement dérivées étant une conséquence de la succession et de la dispersion écologiques. Le changement adaptatif dans les lignées se produit principalement pendant les périodes de spéciation, et les tendances d'adaptation se produisent principalement par le biais du mécanisme de sélection des espèces. Voir la FAQ des équilibres ponctués sur le site d'archives talk.origins. (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W. J. Hudson, modifié).
          A droite : évolution progressive et ponctuée. L'évolution graduelle (ou gradualisme phylétique) se produit là où le changement est faible et l'évolution constante ponctuée là où le changement est très rapide, alors que la plupart du temps il n'y a pratiquement pas de changement. (Diagramme de Paul Olsen, Lecture 5 Evolution—URL de référence principale : Eldredge & Gould 1972)

          Protéine les éléments constitutifs des cellules de grosses molécules constituées d'une séquence d'acides aminés. La plupart des grosses molécules importantes dans les organismes vivants, par exemple les enzymes, sont des protéines. (Lexique Fossil Mall, MAK)

          Quasi-espèce Évolution darwinienne des entités auto-répliquantes dans le cadre de la chimie physique. En termes simples, une quasi-espèce est un grand groupe ou un nuage de génotypes apparentés qui existent dans un environnement à taux de mutation élevé, où une grande partie de la progéniture devrait contenir une ou plusieurs mutations par rapport au parent. Cela contraste avec une espèce qui, du point de vue de l'évolution, est un génotype unique plus ou moins stable, dont la plupart des descendants seront des copies génétiquement exactes.

          Le modèle de quasi-espèce est utile pour fournir une compréhension qualitative des processus évolutifs de macromolécules auto-répliquantes telles que l'ARN ou l'ADN ou d'organismes asexués simples tels que les bactéries ou les virus (quasi-espèce virale), et est utile pour expliquer quelque chose des premiers stades de la origine de la vie. Les prédictions quantitatives basées sur ce modèle sont difficiles car les paramètres qui lui servent d'entrée sont difficiles à obtenir à partir de systèmes biologiques réels. Le modèle de quasi-espèce a été proposé par Manfred Eigen et Peter Schuster sur la base des premiers travaux effectués par Eigen. (Wikipédia)

          r-sélection, r-espèces sélectionnées Espèce qui produit un grand nombre de descendants, dont chacun reçoit peu de soins (quantité plutôt que qualité). Les espèces R-sélectionnées sont mieux adaptées aux environnements variables ou imprévisibles. (Lexique Wikipédia)

          Sénilité raciale théorie intrigante mais longtemps réfutée selon laquelle certaines lignées de longue durée sont devenues vieilles et « séniles », par analogie avec le développement individuel, au fur et à mesure que leur nouveauté évolutive est épuisée. Développé par Alpheus Hyatt pour expliquer les formes exotiques de certaines coquilles, cornes et plaques d'ammonites du Crétacé sur des dinosaures, etc. (MAC)

          Aléatoire Imprévisible en quelque sorte. Les mutations sont "aléatoires" dans le sens où le type de mutation qui se produit ne peut généralement pas être prédit sur la base des besoins de l'organisme. Cependant, cela ne signifie pas que toutes les mutations sont également susceptibles de se produire ou que les mutations se produisent sans aucune cause physique. En effet, certaines régions du génome sont plus susceptibles de subir des mutations que d'autres, et diverses causes physiques (par exemple, les radiations) sont connues pour provoquer des types particuliers de mutations. (Lexique de compréhension de l'évolution de l'UCMP)

          Récapitulation Les théorie de la récapitulation, aussi appelé le loi biogénétique ou Parallélisme embryologique, et souvent exprimée par l'expression "l'ontogenèse récapitule la phylogénie". L'hypothèse qu'en se développant de l'embryon à l'adulte, les animaux passent par des stades ressemblant ou représentant des stades successifs de l'évolution de leurs lointains ancêtres. Par conséquent, chaque phase de l'ontogenèse d'un individu représente directement la phase adulte de certaines espèces ancêtres dans la phylogénie de l'espèce à laquelle appartient l'individu. Avec différentes formulations, de telles idées ont été appliquées à plusieurs domaines, dont la biologie, l'anthropologie et la théorie de l'éducation. En biologie, il existe plusieurs exemples de stades embryonnaires présentant des caractéristiques d'organismes ancestraux, mais une formulation "forte" du concept a été discréditée. Le concept est né dans les années 1790 parmi les philosophes allemands de la nature et, comme proposé par Étienne Serres en 1824-1826, est devenu connu sous le nom de « loi Meckel-Serres ». En 1866, le zoologiste allemand Ernst Haeckel a proposé que le développement embryonnaire d'un organisme individuel (son ontogénie) suive le même chemin que l'histoire évolutive de son espèce (sa phylogénie). Ce principe est reconnu inexact à plusieurs égards, et son utilisation est maintenant généralement déconseillée. La tournure de phrase est attribuée à Ernst Haeckel, tandis que la « loi biogénétique » sur laquelle elle était fondée remonte à von Baer. (W.R. Elsberry dans talk.origins, Wikipédia)

          Concept d'espèce de reconnaissance Une définition d'une espèce comme un ensemble d'organismes qui se reconnaissent comme partenaires potentiels, ils ont un système de reconnaissance de partenaire partagé. Comparez avec le concept d'espèce biologique, le concept d'espèce cladistique, le concept d'espèce écologique et le concept d'espèce phénétique. (Lexique Fossil Mall) Voir les définitions des autres espèces.

          Recombinaison La recombinaison crée de nouvelles combinaisons d'allèles. La recombinaison se produit principalement par la reproduction sexuée, où les cellules diploïdes forment des gamètes haploïdes. L'organisme hérite d'un gamète chacun de la mère et du père, et les gamètes sont «recombinés» pour former un nouveau chromosome diploïde. La recombinaison peut se produire non seulement entre les gènes, mais aussi à l'intérieur des gènes. La recombinaison au sein d'un gène peut former un nouvel allèle. (cf. mutation ) La recombinaison est un mécanisme d'évolution car elle ajoute de nouveaux allèles et combinaisons d'allèles au pool génétique. (W.J. Hudson)

          L'hypothèse de la reine rouge ou Effet Reine Rouge est une hypothèse évolutionniste. Le terme est tiré de la course de la reine rouge dans Lewis Carroll's De l'autre côté du miroir. La Reine Rouge a dit : "Il faut toute la course que vous pouvez faire, pour rester au même endroit." Le principe de la reine rouge peut être énoncé ainsi : En référence à un système évolutif, une adaptation continue est nécessaire pour qu'une espèce maintienne son aptitude relative parmi les systèmes co-évolués avec. L'hypothèse vise à expliquer deux phénomènes différents : l'avantage de la reproduction sexuée au niveau des individus, et la course aux armements évolutive constante entre espèces concurrentes. Dans la première version (micro-évolutive), en faisant de chaque individu une expérience de mélange des gènes de la mère et du père, la reproduction sexuée peut permettre à une espèce d'évoluer rapidement juste pour conserver la niche écologique qu'elle occupe déjà dans l'écosystème. Dans la deuxième version (macro-évolutive), la probabilité d'extinction des groupes d'organismes est supposée constante au sein du groupe et aléatoire entre les groupes. Sa contrepartie est la Hypothèse du bouffon de cour, qui propose que la macroévolution soit principalement motivée par des événements et des forces abiotiques. (Wikipédia)

          Isolement reproductif Isolement d'une espèce ou d'une population d'une autre espèce ou population par des différences dans les traits ou les habitudes de reproduction. Les deux espèces ou populations peuvent ou non partager la même aire de répartition environnementale. Un exemple de deux espèces isolées sur le plan de la reproduction sont des espèces d'animaux similaires qui se reproduisent à différents moments de l'année. (W.J. Hudson)

          Espèce de bague Une situation dans laquelle deux populations isolées sur le plan de la reproduction vivant dans la même région sont reliées par un anneau géographique de populations qui peuvent se croiser. (PBS évolution Glossaire)

          Acide ribonucléique (ARN) : Molécule similaire à l'ADN, mais avec un seul brin, par laquelle le code génétique de l'ADN est converti en protéines dans les cellules. Il a trois formes : ARN messager, ARN ribosomique, et transférer l'ARN. Certains virus portent de l'ARN comme matériel génétique au lieu de l'ADN. Il y a eu des spéculations selon lesquelles un "monde d'ARN" a précédé la vie actuelle sur Terre.

          Pression sélective tous les facteurs environnementaux tels que la rareté de la nourriture ou les températures extrêmes qui favorisent la survie des seuls organismes dotés de caractéristiques offrant résistance ou adaptabilité. (basé sur le glossaire de l'évolution de PBS)

          Sélection sexuelle un trait qui rend un individu plus susceptible de trouver un partenaire que d'autres. Un processus micro-évolutif. (Wikipédia : Glossaire de l'écologie). Ce processus peut produire des traits qui semblent diminuer les chances de survie d'un organisme, tout en augmentant ses chances de s'accoupler. (Lexique de compréhension de l'évolution de l'UCMP)

          Théorie de l'équilibre changeant La théorie du « changement d'équilibre » de Sewall Wright soutient que les populations sont souvent divisées en sous-populations plus petites. La dérive pourrait entraîner des différences de fréquence allélique entre les sous-populations si le flux de gènes était suffisamment faible. Si une sous-population était suffisamment petite, la population pourrait même dériver à travers des vallées de fitness dans le paysage adaptatif. Ensuite, la sous-population pourrait gravir une plus grande colline de fitness. Le flux génétique de cette sous-population pourrait contribuer à l'adaptation de la population dans son ensemble. (W.J. Hudson)

          Darwinisme social une philosophie politique du 19ème siècle qui a tenté d'expliquer les différences de statut social (en particulier les différences de classe et de race) sur la base de l'aptitude évolutive. Basé sur l'interprétation erronée de la théorie darwinienne, le darwinisme social est généralement considéré comme non scientifique par les philosophes des sciences modernes. (Lexique Wikipédia)

          Espèce Terme très controversé étant donné une variété de définitions par les biologistes. Actuellement, le concept d'espèce biologique (BSC) est très populaire : Groupes de populations réellement ou potentiellement métissées, qui sont isolés sur le plan de la reproduction d'autres groupes de ce type (Mayr, 1963, Animal Species and Evolution). Suite (W.R. Elsberry dans talk.origins passant par W. J. Hudson) Voir aussi le concept d'espèce cladistique, le concept d'espèce écologique, le concept d'espèce phénétique et le concept d'espèce de reconnaissance. Voir les définitions des autres espèces. (Lexique Fossil Mall)

          Spéciation Le processus de base de l'évolution par lequel de nouvelles espèces apparaissent. Bien que la théorie de l'évolution soit vieille d'un siècle et demi, le mécanisme précis par lequel de nouvelles espèces font leur apparition dans la biosphère reste un domaine de recherche active, avec tous les désaccords et les débats qui l'accompagnent. Plusieurs types de spéciation ont été proposés :

          Spéciation allopatrique est censé être causé par la séparation physique de spécimens de ce qui était une seule et même espèce. L'exemple classique est le travail de Darwin sur les pinsons des îles Galapagos. Le scénario présumé est qu'une espèce ancestrale de pinson a atteint les différentes îles et a évolué en autant d'espèces différentes qu'il y a d'îles. Le facteur critique causant la spéciation est généralement supposé être la rupture du flux génétique entre la population sur une île et la population mère sur le continent. Mayr a également souligné la petite taille de la nouvelle population et a soutenu que, par ex. l'émergence de l'isthme de Panama n'a pas conduit à une grande spéciation du biote des mers peu profondes de chaque côté, car les deux représentaient un pool génétique bien trop important pour permettre une spéciation allopatrique. Jcwf100131

          Spéciation péripatrique est considéré comme se produisant dans la même zone géographique - sans rupture du flux génétique - en raison de différences écologiques, par ex. l'existence de deux niches écologiques différentes dans lesquelles une espèce existante peut se spécialiser. Jcwf100131. Alternativement, une population d'une espèce ancestrale dans une partie géographiquement périphérique de l'aire de répartition ancestrale est modifiée au fil du temps jusqu'à ce que même lorsque les populations ancestrales et filles entrent en contact, il y ait un isolement reproductif. Voir aussi cladogenèse, anagenèse, équilibres ponctués. (W.J. Hudson)

          Tierra Simulation de la vie artificielle de Tom Ray qui démontre l'utilité de la sélection naturelle dans les implémentations informatiques pour trouver de nouvelles approches à des problèmes difficiles. Il s'agit d'une preuve prima facie que A. E. Wilder-Smith était prématuré en déclarant que « les simulations de la sélection naturelle « broutent » les meilleurs ordinateurs ». (W.R. Elsberry dans talk.origins)

          Forme de transition, ou fossile de transition Un fossile ou un groupe d'organismes intermédiaires et un lien entre un groupe plus primitif ou ancestral et un groupe plus avancé ou spécialisé, possédant les caractéristiques ou traits des deux (voir Évolution mosaïque). Généralement, toute lignée évolutive constitue une série de formes transitionnelles, par exemple dans l'évolution des oiseaux à partir des dinosaures, ou des baleines à partir des ancêtres terrestres, il existe un certain nombre de formes intermédiaires ou de chaînons non manquants. Un aspect important de la systématique évolutive, voir aussi l'anagenèse. Notez que l'application stricte de la cladistique rejette la possibilité d'identifier des formes transitionnelles (cela ne nie pas la réalité de l'évolution bien sûr, juste qu'il est possible de savoir avec certitude quels fossiles représentent des formes transitionnelles) (Systématique et biogéographie : Paraphyly Watch 3 : Transitional Fossils, Microbes & Patrocladistics). Une approche alternative (donnée dans Wikipédia) serait de faire une distinction entre « transitionnel » et « intermédiaire ». De transition les formes n'ont pas un nombre significatif de traits dérivés uniques, de sorte qu'elle est morphologiquement proche de l'ancêtre commun réel qu'elle partage avec son parent plus dérivé (voir aussi taxon basal et groupe souche). Intermédiaire peut être utilisé pour les formes avec un plus grand nombre de traits dérivés uniques. Selon cette définition, Archéoptéryx est transitoire alors que l'ornithorynque (un mammifère spécialisé en ponte, descendant de mammifères très primitifs) est intermédiaire. Mais plutôt que de multiplier la terminologie, il vaudrait mieux conserver intermédiaire dans le sens informel mais plus grammaticalement correct du même sens que « transitionnel ». Certaines formes intermédiaires/transitionnelles reliant les principaux groupes de vertébrés comprennent la séquence poisson/amphibien de Eusthénoptéron (poisson) à Panderichthys à Tiktaalik à Acanthostega aux amphibiens pleinement développés (période dévonienne), aux formes transitionnelles de reptiles/mammifères telles que le cynodonte Thrinaxodon et d'autres reptiles ressemblant à des mammifères qui présentent un mélange de caractéristiques mammifères et reptiliennes (Trias), Vélociraptor et parents, et plus encore Microraptor, un dromaeosauridé planeur à quatre ailes, et des formes encore plus avancées telles que Anchiornis et Scansorioptéryx, représentant une étape intermédiaire entre les théropodes incapables de voler et les oiseaux primitifs tels que l'archéoptéryx (Jurassique) Pézosiren, une forme intermédiaire d'une vache de mer primitive avec des adaptations à la fois terrestres (mammifères terrestres) et aquatiques (éocène) Pakicetus, Ambulocetus, Rodhocetus et des formes similaires constituent des liens entre les ongulés artiodacyles amphibies et terrestres (à doigts pairs) et les baleines aquatiques (Éocène) et Sahelanthrope, indiquant qu'il est proche de l'ancêtre commun des chimpanzés et des humains modernes) l'hominidé africain le plus basal ressemblant à un singe. mosaïque de caractéristiques primitives (de type chimpanzé) et dérivées d'hominidés (Miocène). (MAK Kutschera & Niklas 2004, p.259).

          Organisme unicellulaire un système vivant composé d'une seule cellule. Peut être simple, comme pour les bactéries, ou complexe, comme pour les protistes. Dans le cas des protistes, différentes parties de la cellule assument les fonctions que les organes et autres systèmes remplissent dans les organismes multicellulaires (multicellulaires). (MAC)

          Uniformitarisme L'hypothèse selon laquelle les processus agissant dans le passé sont les mêmes que ceux agissant dans le présent. a proposé la théorie de James Hutton à la fin du XVIIIe siècle selon laquelle les forces naturelles qui modifient maintenant la forme de la surface de la Terre ont fonctionné dans le passé de la même manière. L'implication la plus importante est que la terre est très ancienne (temps profond) et que le présent est la clé pour comprendre le passé. Développé par Charles Lyell au 19ème siècle, qui à son tour a influencé Darwin. Contraste avec catastrophisme, équilibre ponctué.

          Arbre de vie universel Voir arbre de vie.

          Variation différences entre les organismes individuels ou les populations. Le phénotype d'un organisme individuel résulte à la fois de son génotype et de l'influence de l'environnement dans lequel il a vécu. Une partie substantielle de la variation des phénotypes dans une population est causée par les différences entre leurs génotypes. La synthèse évolutive moderne définit l'évolution comme le changement dans le temps de cette variation génétique. La fréquence d'un allèle particulier fluctue, devenant plus ou moins répandue par rapport à d'autres formes de ce gène. Les forces évolutives agissent en entraînant ces changements de fréquence allélique dans un sens ou dans l'autre. La variation disparaît lorsqu'un nouvel allèle atteint le point de fixation, lorsqu'il disparaît de la population ou remplace entièrement l'allèle ancestral. La variation provient des mutations du matériel génétique, de la migration entre les populations (flux de gènes) et du remaniement des gènes par la reproduction sexuée. La variation provient également d'échanges de gènes entre différentes espèces par exemple, via le transfert horizontal de gènes chez les bactéries, et l'hybridation chez les plantes. Malgré l'introduction constante de variations à travers ces processus, la majeure partie du génome d'une espèce est identique chez tous les individus de cette espèce. Cependant, même des changements relativement faibles du génotype peuvent entraîner des changements spectaculaires du phénotype : par exemple, les chimpanzés et les humains ne diffèrent que par environ 5 % de leurs génomes. (Wikipédia)

          Vestige, structure vestigiale Un composant anatomique non fonctionnel retenu simplement comme une question d'histoire contingente. (W.R. Elsberry dans talk.origins) Habituellement, les structures résiduelles se forment lorsqu'une lignée subit un ensemble de pressions sélectives différent de celui de ses ancêtres, et la sélection pour maintenir l'élaboration et la fonction de la caractéristique se termine ou est considérablement réduite. Glossaire de la compréhension de l'évolution de l'UCMP, De nombreux organismes ont des organes vestigiaux, qui sont les vestiges des structures pleinement fonctionnelles de leurs ancêtres. À la suite de changements dans le mode de vie, les organes sont devenus superflus et ne sont pas fonctionnels ou leur fonctionnalité est réduite. Avec la perte de fonction va la perte de la sélection positive, et l'accumulation subséquente de mutations délétères. Étant donné que toute structure représente une sorte de coût pour l'économie générale du corps, un avantage peut résulter de leur élimination une fois qu'elles ne sont pas fonctionnelles. Exemples : les dents de sagesse chez l'homme la perte de pigment et les yeux fonctionnels chez la faune des cavernes la perte de structure chez les endoparasites. (Wikipédia)

          Vicariat un processus dans lequel l'aire de répartition d'une espèce est divisée même si l'espèce est restée en place. Cela peut se produire par l'action tectonique, l'activité géologique (comme l'élévation d'une chaîne de montagnes ou le changement du cours d'une rivière) ou d'autres processus. La vicariance est généralement opposée à la dispersion en tant que mécanisme biogéographique. (Lexique de compréhension de l'évolution de l'UCMP)

          Virus agent infectieux qui ne peut se répliquer qu'à l'intérieur des cellules vivantes des organismes, et infecter tous les types d'organismes, des animaux et des plantes aux bactéries. La plupart des virus sont trop petits pour être vus directement avec un microscope optique. Depuis la découverte initiale du virus de la mosaïque du tabac par Martinus Beijerinck en 1898, environ 5 000 virus ont été décrits en détail, bien qu'il existe des millions de types différents. Les virus se trouvent dans presque tous les écosystèmes de la Terre et constituent le type d'entité biologique le plus abondant. Une énorme variété de structures génomiques peut être observée parmi les espèces virales en tant que groupe contenant plus de diversité génomique structurelle que les plantes, les animaux, les archées ou les bactéries. Un virus possède des gènes d'ADN ou d'ARN et est appelé respectivement virus à ADN ou virus à ARN. La grande majorité des virus ont des génomes à ARN. Les virus végétaux ont tendance à avoir des génomes à ARN simple brin et les bactériophages ont tendance à avoir des génomes à ADN double brin. Les virus ne sont généralement pas considérés comme des organismes parce qu'ils sont incapables de reproduction ou de métabolisme "indépendants" ou autonomes. Leurs origines ne sont pas claires : certains peuvent avoir évolué à partir de plasmides, d'autres à partir de bactéries. Les virus sont un moyen important de transfert horizontal de gènes, ce qui augmente la diversité génétique. L'étude des virus est connue sous le nom de virologie, une sous-spécialité de la microbiologie. (Wikipédia)

          Web de la vie se réfère conventionnellement à la chaîne alimentaire ou au réseau trophique, décrit les relations alimentaires entre différentes espèces dans un écosystème. Cependant, en référence au transfert horizontal de gènes, il peut également faire référence au transfert génétique et à l'évolution par des moyens non héréditaires, particulièrement courants chez les bactéries.

          Révolution Williams changement de paradigme des années 1960 qui a vu le gène devenir le centre de la pensée évolutionniste, qui a vu la biologie évolutive s'unir à la génétique. La révolution porte le nom de George C. Williams, dont le livre de 1966 Adaptation et sélection naturelle popularisé la théorie. Auparavant, la plupart des penseurs évolutionnistes considéraient que la sélection favorisait les individus, les groupes (sélection de groupe) et les espèces, tels que les individus agissant « pour le bien de l'espèce ». La révolution Williams, cependant, a établi la sélection des gènes comme le principal processus de sélection et a montré que parce que les gènes étaient les unités de sélection, la sélection favoriserait les gènes qui maximisaient leur propre survie, pas celle du groupe ou de l'espèce. (EvoWiki)

          Zygote Cellule formée par la fécondation de gamètes mâles et femelles. (PBS évolution Glossaire)


          Voir la vidéo: Chapitre 3: Les champignons ou Mycètes. (Juillet 2022).


Commentaires:

  1. Abukcheech

    À mon avis, des erreurs sont commises. Nous devons discuter.

  2. Dagen

    Je m'excuse, mais, à mon avis, vous n'avez pas raison. Je suis assuré. Je peux le prouver.

  3. Kajizil

    What was to be expected, the writer successfully sprinkled it!

  4. Jamian

    Ne vous cassez pas sur la tête!

  5. Beldan

    Cette phrase est à peu près



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