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Quelles sont les bonnes pratiques avec la réutilisation des colonnes de dessalage

Quelles sont les bonnes pratiques avec la réutilisation des colonnes de dessalage


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Au moins selon quelques sources Prozyme et Protocols-Online, il est possible de réutiliser des colonnes de dessalage et comme je suis bon marché j'aimerais bien aussi.

Les éléments clés semblent se laver avec plusieurs volumes de colonne de votre tampon de choix. De même, certaines colonnes telles que les colonnes de dessalage réticulées ne se prêtent pas à la régénération. Je suis curieux de connaître d'autres facteurs.

J'utilise principalement des micro-spins Bio-Rad


Indépendamment du protocole que vous utilisez et de l'efficacité annoncée de ce protocole, dans toute situation comme celle-ci, je pense que la chose importante à considérer est la suivante : que se passerait-il si le matériau prélevé sur une colonne réutilisée était contaminé par une précédente application? Pouvez-vous vivre avec les conséquences d'une telle contamination ?

Si vous préparez de l'ADN pour une utilisation ultérieure (PCR et/ou clonage et/ou transformation), vous courez le risque de propager un contaminant au cours des étapes suivantes et de vous retrouver dans un véritable pétrin. J'ai travaillé une fois dans un laboratoire où un étudiant de troisième cycle a fini par passer plusieurs semaines à travailler avec un fragment cloné qui était en fait dérivé du travail de quelqu'un d'autre dans le même laboratoire (bien que ce ne soit pas dû à la réutilisation d'une colonne pour autant que je m'en souvienne).

Si vous préparez des échantillons de protéines, les risques sont peut-être réduits, mais si l'échantillon de protéines doit être soumis à des méthodes sensibles (buvardage, MS), cela pourrait à nouveau devenir salissant.


Bureau de réponse

"Est-ce possible" a un "oui" soigneusement conditionnel. Avons-nous l'expertise ou la technologie pour le faire maintenant? Non. L'une des plus grandes difficultés est que les tissus nerveux (les connexions entre le cerveau et le reste du corps) mettront du temps à guérir. période pendant laquelle le cerveau ne peut pas donner suffisamment d'ordres au reste du corps pour maintenir les fonctions autonomes en marche.

Les greffes de tête, cependant, ont été réalisées avec "succès" en utilisant des singes. Le singe a vécu quelque temps après la greffe, mais est finalement décédé. La Chine est également connue pour effectuer une procédure similaire avec les chiens.

Attention, cela peut être trop explicite pour certains, je ne suis pas sûr que les comités d'éthique le permettent de nos jours :
Greffe de tête de singe


Zone de travail stérile

Le moyen le plus simple et le plus économique de réduire la contamination par les particules en suspension dans l'air et les aérosols (par exemple, la poussière, les spores, la perte de peau, les éternuements) est d'utiliser une hotte de culture cellulaire.

  • La hotte de culture cellulaire doit être correctement installée et située dans une zone réservée à la culture cellulaire, à l'abri des courants d'air des portes, fenêtres et autres équipements, et sans circulation de transit.
  • La surface de travail doit être épurée et ne contenir que les éléments nécessaires à une procédure particulière, elle ne doit pas être utilisée comme zone de stockage.
  • Avant et après utilisation, la surface de travail doit être soigneusement désinfectée et les zones environnantes et l'équipement doivent être nettoyés régulièrement.
  • Pour le nettoyage de routine, essuyez la surface de travail avec de l'éthanol à 70 % avant et pendant le travail, surtout après tout déversement.
  • Vous pouvez utiliser la lumière ultraviolette pour stériliser l'air et les surfaces de travail exposées dans la hotte de culture cellulaire entre les utilisations.
  • L'utilisation d'un bec Bunsen pour le flambage n'est pas nécessaire ni recommandée dans une hotte de culture cellulaire.
  • Laissez la hotte de culture cellulaire en marche à tout moment, en l'éteignant uniquement lorsqu'elles ne seront pas utilisées pendant de longues périodes.

Comment réutiliser des colonnes dynamiques dans une instruction Oracle SQL ?

mais je pense que c'est un peu moche. De plus, je veux rendre la requête un peu plus complexe, par ex. réutiliser 'Q' également, et je ne veux pas créer une autre sous-requête.

Mise à jour : la raison pour laquelle je souhaite stocker le calcul de « P » est que je souhaite le rendre plus complexe et réutiliser « P » plusieurs fois. Je ne veux donc pas dire explicitement « A*2+5 AS Q », car cela deviendrait rapidement trop lourd à mesure que « P » devient plus complexe.

Il doit y avoir un bon moyen de faire ça, des idées ?

Mise à jour : je dois noter que je ne suis pas un administrateur de base de données :(.

Mise à jour : un exemple du monde réel, avec une requête plus concrète. Ce que je voudrais faire c'est :

pour l'instant, je l'ai écrit, ce qui fonctionne, mais est moche :

Je pourrais faire tout cela après avoir reçu les données, mais j'ai pensé, voyons jusqu'où je peux laisser la base de données faire. De plus, je voudrais également sélectionner sur 'BSA' (ce que je peux faire maintenant avec cette requête en tant que sous-requête/avec clause).

Mise à jour : OK, je pense que pour l'instant j'ai fini avec la solution de Cade Roux et Dave Costa. Bien que la solution de Pax et Jens Schauder semblerait mieux, mais je ne peux pas les utiliser car je ne suis pas un DBA. Maintenant, je ne sais pas qui marquer comme la meilleure réponse :).

BTW, au cas où quelqu'un serait intéressé, SB est la "luminosité de surface" des galaxies, pour laquelle B et D sont des termes de correction.


11ème Symposium International sur l'Ingénierie des Systèmes de Procédés

2.2.2 Chemin détourné des impuretés

La purification provoque non seulement une chute de pression, mais également une perte d'hydrogène en termes de gaz résiduaire, qui est rejeté dans le système de gaz combustible. Par conséquent, une purification inutile doit être évitée.

Un mélange raisonnable peut augmenter la réutilisation directe. Le chemin détourné des impuretés est un moyen de mélanger des sources internes entre elles ou de l'hydrogène frais, qui a une faible pureté dans toute impureté. De cette manière, les sources internes avec des puretés d'impuretés élevées peuvent être diluées par d'autres sources avec des puretés faibles d'impuretés correspondantes, de manière à rendre les sources avec des puretés d'impuretés élevées réalisables pour une réutilisation directe.

Par exemple, si une partie de la source interne 1 peut être mélangée à la source 2 ou à la source 3 pour diluer certaines impuretés, alors cette partie de la source interne 1 peut être directement envoyée au puits 2 au lieu d'être envoyée à la purification et à la réutilisation. De même, le mélange de la source interne 2 et de la source 3 envoyé au puits 3 pourrait également être un tel cas.

De plus, il existe encore d'autres sources internes, qui ne peuvent pas être directement envoyées aux puits après mélange en raison de la faible pression, comme la source interne 3. Comme il n'y a pas d'autres puits avec une pression inférieure à celle de la source interne 3, il ne peut être mélangé avec de l'hydrogène frais, puis être réutilisé directement après avoir été mis sous pression par des compresseurs.

Ainsi, A, B, C, D, E et F sont tous des chemins possibles de détournement d'impuretés et les chemins réalisables peuvent être déterminés en fonction de considérations pratiques.

Avec à la fois l'utilisation en cascade de pression et le chemin de détournement des impuretés, la réutilisation directe possible des sources d'hydrogène peut être prise en considération et la consommation d'hydrogène frais peut être réduite.


Collaboration

Vous pouvez commencer à travailler sur des projets seul ou avec un petit groupe de collaborateurs que vous connaissez déjà, mais vous devez le concevoir pour faciliter l'adhésion de nouveaux collaborateurs. Ces collaborateurs peuvent être de nouveaux étudiants diplômés ou des post-doctorants en laboratoire, ou ils peuvent être tu revenir à un projet inactif depuis un certain temps. Comme résumé dans [steinmacher2015], vous voulez permettre aux utilisateurs de configurer facilement un espace de travail local afin qu'ils pouvez contribuer, les aider à trouver des tâches afin qu'ils sachent Quel de contribuer et de clarifier le processus de contribution afin qu'ils sachent comment contribuer. Vous voulez également permettre aux gens de vous féliciter pour votre travail.

Créez une vue d'ensemble de votre projet. (3a) Ayez un fichier court dans le répertoire personnel du projet qui explique le but du projet. Ce fichier (généralement appelé README , README.txt ou quelque chose de similaire) doit contenir le titre du projet, une brève description, des informations de contact à jour et un ou deux exemples sur la façon d'exécuter diverses tâches de nettoyage ou d'analyse. C'est souvent la première chose que les utilisateurs et les collaborateurs de votre projet examineront, alors expliquez clairement comment vous voulez que les gens s'engagent dans le projet. Si vous recherchez plus de contributeurs, indiquez clairement que vous accueillez les contributeurs et indiquez-leur la licence (plus ci-dessous) et les manières dont ils peuvent vous aider.

Vous devez également créer un fichier CONTRIBUTING qui décrit ce que les gens doivent faire pour lancer le projet et l'utiliser ou y contribuer, c'est-à-dire les dépendances qui doivent être installées, les tests qui peuvent être exécutés pour s'assurer que le logiciel a été correctement installé , et des lignes directrices ou des listes de contrôle auxquelles votre projet adhère.

Créer une liste "à faire" partagée (3b). Cela peut être un fichier texte simple appelé quelque chose comme notes.txt ou todo.txt , ou vous pouvez utiliser des sites tels que GitHub ou Bitbucket pour créer un nouveau problème pour chaque tâche à faire. (Vous pouvez même ajouter des étiquettes telles que « fruits suspendus » pour indiquer aux nouveaux arrivants des problèmes qui sont de bons points de départ.) Quoi que vous choisissiez, décrivez les éléments clairement afin qu'ils aient un sens pour les nouveaux arrivants.

Décider des stratégies de communication. (3c) Prendre des décisions explicites sur (et faire connaître le cas échéant) la manière dont les membres du projet communiqueront entre eux et avec les utilisateurs/collaborateurs externes. Cela inclut l'emplacement et la technologie des listes de diffusion, des canaux de discussion, des conférences vocales/vidéo, de la documentation et des notes de réunion, ainsi que celui de ces canaux qui sera public ou privé.

Rendez la licence explicite. (3d) Ayez un fichier LICENSE dans le répertoire personnel du projet qui indique clairement quelle(s) licence(s) s'appliquent au logiciel, aux données et aux manuscrits du projet. L'absence d'une licence explicite ne signifie pas qu'il n'y en a pas plutôt, cela implique que l'auteur conserve tous les droits et que les autres ne sont pas autorisés à réutiliser ou à modifier le matériel.

Nous recommandons les licences Creative Commons pour les données et le texte, soit CC-0 15 (la licence "No Rights Reserved") ou CC-BY 16 (la licence "Attribution", qui permet le partage et la réutilisation mais oblige les gens à donner le crédit approprié aux créateurs). Pour les logiciels, nous recommandons une licence open source permissive telle que la licence MIT, BSD ou Apache [laurent2004].

Ce qu'il ne faut pas faire

Nous recommandons contre les variantes « pas d'utilisation commerciale » des licences Creative Commons, car elles peuvent entraver certaines formes de réutilisation. Par exemple, si un chercheur dans un pays en développement est payé par son gouvernement pour compiler un rapport de santé publique, il ne pourra pas inclure vos données si la licence indique "non commercial". Nous recommandons les licences logicielles permissives plutôt que la licence publique générale GNU (GPL) car il est plus facile d'intégrer des logiciels sous licence permissive dans d'autres projets, voir le chapitre trois dans [laurent2004].

Rendre le projet citable (3e) en incluant un fichier CITATION dans le répertoire personnel du projet qui décrit comment citer ce projet dans son ensemble, et où trouver (et comment citer) les ensembles de données, le code, les figures et autres artefacts qui ont leurs propres DOI. L'exemple ci-dessous montre le fichier CITATION pour l'Ecodata Retriever 17 pour un exemple de fichier CITATION plus détaillé, voir celui du projet khmer 18.


De nombreuses revues d'écologie et d'évolution ont récemment adopté des politiques exigeant que les données de leurs articles soient archivées publiquement. Je présente des suggestions sur la façon dont les générateurs de données, les réutilisateurs de données et les revues peuvent maximiser l'équité et la valeur scientifique de l'archivage des données. Les données doivent être archivées avec suffisamment de clarté et d'informations à l'appui pour qu'elles puissent être interprétées avec précision par d'autres. Les réutilisateurs doivent respecter leur dette intellectuelle envers les auteurs des données en citant à la fois l'article et le paquet de données. De plus, les revues devraient envisager d'exiger que toutes les données des articles publiés soient archivées, tout comme les séquences d'ADN doivent être déposées dans GenBank. Les données sont un autre élément précieux de l'héritage d'une carrière scientifique et leur archivage peut conduire à de nouvelles connaissances scientifiques. L'archivage augmente également les opportunités de crédit à accorder aux scientifiques qui ont initialement collecté les données.

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Règle 5 : Décrivez comment la qualité des données sera assurée

L'assurance qualité et le contrôle qualité (AQ/CQ) font référence aux processus utilisés pour mesurer, évaluer et améliorer la qualité des produits (par exemple, les données, les logiciels, etc.). Il peut être nécessaire de suivre des directives spécifiques d'AQ/CQ en fonction de la nature d'une étude et d'un parrainage de recherche. Ces exigences, si elles existent, sont normalement énoncées dans la DP. Quoi qu'il en soit, il est recommandé de décrire les mesures d'AQ/CQ que vous prévoyez d'employer dans votre projet. Ces mesures peuvent comprendre des activités de formation, des tests d'étalonnage et de vérification des instruments, la saisie de données en double aveugle et des approches statistiques et de visualisation pour la détection d'erreurs. Des approches simples d'exploration de données graphiques (par exemple, nuages ​​de points, cartographie) peuvent être inestimables pour détecter les anomalies et les erreurs.


Conclusion

Cet article présente des contributions à la fois théoriques et pratiques à l'étude de la réutilisation des données scientifiques. En termes de théorie, nous avons développé un modèle de recherche sur la façon dont les perceptions et attitudes normatives des scientifiques influencent leurs comportements de réutilisation des données. Par conséquent, cette étude propose une théorie qui peut éclairer les études futures sur les facteurs susceptibles d'encourager ou d'empêcher les scientifiques de réutiliser les données collectées par d'autres.

Nous pouvons tirer quelques implications pratiques de nos données pour suggérer ce qui pourrait être fait pour encourager les scientifiques à réutiliser les volumes croissants de données partagées. Premièrement, étant donné l'importance de l'efficacité perçue et, dans une moindre mesure, de l'efficacité de la réutilisation des données, nous suggérons que ces valeurs soient largement démontrées pour les rendre plus apparentes à davantage de chercheurs. Par exemple, un projet comme DataONE peut fournir des démonstrations concrètes de la façon dont la réutilisation des données peut permettre aux chercheurs de répondre efficacement et efficacement à leurs questions actuelles ou nouvelles. De telles démonstrations peuvent prendre plusieurs formes, telles que des études de cas vidéo YouTube sur la réutilisation des données, des cahiers Jupyter démontrant le processus de réutilisation des données, des exemples de papiers de réutilisation des données ou une combinaison de ce qui précède. De tels matériaux pourraient aider à réduire l'obstacle initial à la réutilisation des données en démontrant de manière plus pratique et palpable sa valeur. Des supports supplémentaires pourraient fournir une formation plus spécifique sur les éléments de la réutilisation des données, tels que la découverte de données ou l'utilisation de métadonnées pour aider à comprendre un ensemble de données et sa provenance. Un autre sujet qui semble nécessiter une meilleure attention est la citation de données. L'élaboration et le maintien de politiques, de lignes directrices et de services pour une attribution appropriée et une citation formelle des ensembles de données sont essentiels pour tirer parti du partage des données et légitimer la réutilisation de ces artefacts de recherche.

Alors que la littérature met l'accent sur la confiance comme un facteur important dans la réutilisation des données (ou pour décourager la réutilisation des données en cas de manque de confiance), ce facteur n'a pas été jugé significatif dans notre étude. Il se peut que les efforts des référentiels de données pour établir la fiabilité des données candidates à la réutilisation et pour encourager de bonnes métadonnées pour les données partagées portent leurs fruits dans les attitudes de l'échantillon de scientifiques qui ont répondu à l'enquête.

Enfin, nos résultats suggèrent la nécessité d'aborder les normes de réutilisation des données qui encouragent ou découragent cette pratique. Cependant, il faut reconnaître que les normes sont par nature difficiles à changer. Les voies d'influence possibles incluent le fait d'avoir des membres visibles et établis d'un domaine, publiquement et aussi en privé (par exemple par le biais d'examens ou de lettres de titularisation) plaidant pour la valeur et l'acceptation de la réutilisation des données comme une pratique de recherche valable. L'acceptabilité pourrait être davantage façonnée par la reconnaissance d'une bonne réutilisation des données, comme des récompenses pour des articles exemplaires sur la réutilisation des données ou d'autres mécanismes de compensation pour ceux qui gèrent l'expansion des découvertes scientifiques grâce à la réutilisation. Les actions concernant les attitudes et les normes subjectives pour augmenter la réutilisation des données seront essentielles pour réaliser pleinement le potentiel des données de recherche et légitimer les investissements et les politiques en faveur du partage des données.

Le centre de synthèse est un endroit où le partage et la réutilisation des données sont actuellement une pratique courante. Les centres de synthèse financent des équipes de personnes pour s'attaquer à des questions scientifiques complexes sur les écosystèmes en utilisant exclusivement des données existantes, et peuvent donc servir de modèle pour la promotion du partage et de la réutilisation des données dans d'autres domaines scientifiques Cela remplace le modèle du flux de travail de recherche traditionnel qui s'articule autour de la collection de nouvelles données, avec une science d'équipe, donnant « une nouvelle vie aux données anciennes et sombres » [19, 22, 34, 61, 62]. Cela a entraîné une productivité élevée en termes de résultats de recherche. En fait, le Centre de synthèse NCEAS est l'une des unités de recherche les plus citées aux États-Unis d'Amérique, avec plus de 2 500 articles [63] au cours de ses plus de 20 ans d'existence. , 12% dans des revues à fort impact.

Il existe des preuves prometteuses à la fois ici et dans des recherches antérieures que les arguments en faveur de la réutilisation des données sont entendus. L'incitation et la normalisation de ce modèle émergent de pratique de recherche restent des domaines d'enquête fructueux, ainsi que la nécessité de combler le fossé apparent entre les comportements de partage et de réutilisation.

Étant donné que cette recherche était basée sur un ensemble de données publié, une prochaine étape pour avancer vers une compréhension plus complète de la réutilisation des données serait d'identifier d'autres dimensions et facteurs qui peuvent empêcher et/ou inciter les scientifiques à adopter des comportements de réutilisation des données. Cette étude encourage les recherches futures à envisager non seulement de réutiliser le modèle théorique et les mesures proposées par cette étude, mais de les développer, en ajoutant des concepts tels que l'intention de réutiliser et des facettes que cette recherche aurait pu négliger ou qui n'ont pas pu être évaluées en raison de les limites des données disponibles. Enfin, les recherches futures devraient examiner l'antécédent des attitudes et des normes subjectives suggérées par la TRA afin de déterminer lesquelles sont les plus influentes, d'élaborer des recommandations qui abordent ces facteurs et ainsi de promouvoir la réutilisation des données.


Cette technique fonctionne mieux lorsque le contenu de la conférence est lourd et que vous devez l'organiser sous une forme structurée et simple. Il peut également être utilisé lorsque vous n'avez aucune idée du contenu de la conférence à présenter.

  • Appel visuel
  • Peut être utilisé pour noter des informations détaillées mais sous une forme concise
  • Permet une édition facile des notes
  • Lors de la cartographie de vos notes, vous risquez de manquer d'espace sur une seule page
  • Peut être déroutant si les informations sont mal placées lors de la prise de notes