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23.3C : Chromalveolata : Straménopiles - Biologie

23.3C : Chromalveolata : Straménopiles - Biologie



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Les strménophiles comprennent les algues marines photosynthétiques et les protistes hétérotrophes tels que les diatomées, les algues brunes et dorées et les oomycètes.

Objectifs d'apprentissage

  • Décrire les caractéristiques des stramenophiles suivants : diatomées, algues brunes, algues dorées et oomycètes

Points clés

  • Les stramenophiles, également appelés hétérokontes, sont une sous-classe des chromalvéoles et sont identifiés par la présence d'un flagelle « velu ».
  • Les diatomées, présentes à la fois dans le plancton d'eau douce et marin, sont des protistes photosynthétiques unicellulaires qui se caractérisent par la présence d'une paroi cellulaire composée de dioxyde de silicium qui présente des motifs complexes.
  • Les algues dorées, présentes dans les communautés planctoniques d'eau douce et marine, sont des protistes photosynthétiques unicellulaires caractérisées par la présence de caroténoïdes (pigments photosynthétiques jaune orangé).
  • Les oomycètes, communément appelés moisissures aquatiques, se caractérisent par leur morphologie de type champignon, une paroi cellulaire à base de cellulose et un réseau filamenteux utilisé pour l'absorption des nutriments.
  • Les oomycètes, communément appelés moisissures aquatiques, se caractérisent par leur morphologie fongique, une paroi cellulaire à base de cellulose et un réseau filamenteux utilisé pour l'absorption des nutriments.

Mots clés

  • pied: la tige d'un varech
  • raphé: une crête ou une couture sur un organe, un tissu corporel ou une autre structure, en particulier à la jonction entre deux moitiés ou sections
  • saprobe: un organisme qui vit de matière organique morte ou en décomposition

Chromalvéolates

Les preuves actuelles suggèrent que les chromalvéolates ont un ancêtre résultant d'un événement endosymbiotique secondaire. Les espèces qui relèvent de la classification des chromalvéolates ont évolué à partir d'un ancêtre commun qui a englouti une cellule d'algue rouge photosynthétique. Cette cellule d'algue rouge avait précédemment développé des chloroplastes à partir d'une relation endosymbiotique avec un procaryote photosynthétique. Les chromalvéolates comprennent des organismes photosynthétiques très importants, tels que les diatomées, les algues brunes et d'importants agents pathogènes chez les animaux et les plantes. Les chromalvéolates peuvent être subdivisés en alvéolés et straménopiles.

Straménopiles

Un sous-groupe de chromalvéolates, les straménopiles, également appelés hétérocontes, comprend les algues marines photosynthétiques et les protistes hétérotrophes. La caractéristique unificatrice de ce groupe est la présence d'un flagelle texturé ou « velu ». De nombreux straménopiles ont également un flagelle supplémentaire qui manque de projections ressemblant à des cheveux. Les membres de ce sous-groupe varient en taille des diatomées unicellulaires au varech massif et multicellulaire.

Diatomées

Les diatomées sont des protistes photosynthétiques unicellulaires qui s'enferment dans des parois cellulaires vitreuses à motifs complexes composées de dioxyde de silicium dans une matrice de particules organiques. Ces protistes sont une composante du plancton d'eau douce et marin. La plupart des espèces de diatomées se reproduisent de manière asexuée, bien que certains cas de reproduction sexuée et de sporulation existent également. Certaines diatomées présentent une fente dans leur coquille de silice appelée raphé. En expulsant un flux de mucopolysaccharides du raphé, la diatomée peut se fixer aux surfaces ou se propulser dans une direction.

Pendant les périodes de disponibilité des éléments nutritifs, les populations de diatomées s'épanouissent en nombre supérieur à ce qui peut être consommé par les organismes aquatiques. Les diatomées en excès meurent et coulent au fond de la mer où elles ne sont pas facilement atteintes par les saprobes qui se nourrissent d'organismes morts. De ce fait, le dioxyde de carbone que les diatomées avaient consommé et incorporé dans leurs cellules lors de la photosynthèse n'est pas renvoyé dans l'atmosphère. En général, ce processus par lequel le carbone est transporté profondément dans l'océan est décrit comme la pompe à carbone biologique, car le carbone est « pompé » vers les profondeurs océaniques où il est inaccessible à l'atmosphère sous forme de dioxyde de carbone. La pompe à carbone biologique est un élément crucial du cycle du carbone qui aide à maintenir des niveaux de dioxyde de carbone atmosphériques plus bas.

Algues dorées

Comme les diatomées, les algues dorées sont en grande partie unicellulaires, bien que certaines espèces puissent former de grandes colonies. Leur couleur dorée caractéristique résulte de leur utilisation intensive de caroténoïdes, un groupe de pigments photosynthétiques généralement de couleur jaune ou orange. Les algues dorées se trouvent à la fois dans les environnements d'eau douce et marins, où elles forment une partie importante de la communauté planctonique.

Algues brunes

Les algues brunes sont principalement des organismes multicellulaires marins que l'on appelle familièrement les algues. Les varechs géants sont un type d'algues brunes. Certaines algues brunes ont développé des tissus spécialisés qui ressemblent à des plantes terrestres, avec des attaches ressemblant à des racines, des stipes ressemblant à des tiges et des limbes ressemblant à des feuilles capables de photosynthèse. Les stipes des varechs géants sont énormes, s'étendant dans certains cas sur 60 mètres. Il existe une variété de cycles de vie des algues, mais le plus complexe est l'alternance de générations dans lesquelles les stades haploïdes et diploïdes impliquent la multicellularité. Par exemple, comparez ce cycle de vie à celui des humains. Chez l'homme, les gamètes haploïdes produits par la méiose (sperme et ovule) se combinent dans la fécondation pour générer un zygote diploïde qui subit de nombreux cycles de mitose pour produire un embryon multicellulaire puis un fœtus. Cependant, les spermatozoïdes et les ovules eux-mêmes ne deviennent jamais des êtres multicellulaires. Dans le genre des algues brunes Laminaire, les spores haploïdes se transforment en gamétophytes multicellulaires, qui produisent des gamètes haploïdes qui se combinent pour produire des organismes diploïdes qui deviennent ensuite des organismes multicellulaires avec une structure différente de la forme haploïde. Les plantes terrestres ont également évolué en alternance de générations.

Oomycètes

Les moisissures aquatiques, les oomycètes (« champignon de l'œuf »), ont été ainsi nommées en raison de leur morphologie de type champignon, mais les données moléculaires ont montré que les moisissures aquatiques ne sont pas étroitement liées aux champignons. Les oomycètes sont caractérisés par une paroi cellulaire à base de cellulose et un vaste réseau de filaments qui permettent l'absorption des nutriments. En tant que spores diploïdes, de nombreux oomycètes ont deux flagelles dirigés de manière opposée (un poilu et un lisse) pour se déplacer. Les oomycètes ne sont pas photosynthétiques et comprennent de nombreux saprobes et parasites. Les saprobes apparaissent comme des excroissances duveteuses blanches sur les organismes morts. La plupart des oomycètes sont aquatiques, mais certains parasitent les plantes terrestres. Un agent phytopathogène est Phytophthora infestans, l'agent causal du mildiou de la pomme de terre, tel qu'il s'est produit lors de la famine irlandaise de la pomme de terre au XIXe siècle.


V systému protistů z r. 2005 parla Chromalveolata považována za jednu ze esti hlavních větví eukaryot. [1] Chromalveolata zahrnovala čtyři hlavní skupiny :

První tři (Heterokontophyta, Haptophyta a Cryptophyta) byly v některých systémech řazeny do společné skupiny Chromista (v užším slova smyslu), která se však ve ne fylogenetickýchákáýzala zen .

Dlouho existovaly pochybnosti, zda jsou Chromalveolata monofyletická a představují tak přirozenou větev fylogenetického stromu eucaryot. Ukázalo se totiž, e Rhizaria, další ze šesti hlavních větví eucaryot, fylogeneticky nejsou sesterskou skupinou chromalveolát, ale odvětvují se uvnitř nich. [2] [3] [4] [5]

Označení Chromalveolata se začalo používat v širším slova smyslu, se zahrnutými rhizarii, jako synonymum pro eukaryotickou říši Chromista (v širším slova smyslu), rehabilitovanou v-systému C V jejich rámci pak fylogenetické analýzy prokázaly se silnou podporu monofyletičnost superskupiny "SAR". [6] [7] Fylogenetické analýzy také podpořily zařazení zbylých skupin, tedy skrytěnek un haptofyt faire druhé superskupiny Chromalveolát (tehdy považované za potenciálně přirozenou) nazvané hacrobia [8], s nadějí, že par mohla zahrnout i některé další "problematické" skupiny Eukaryot Jako centrohelidní slunivky, Kathablepharidae, Picobiliphyta un Télonema.

"Říše" Chromalveolata tedy zahrnovala následující hlavní skupiny :

Přirozenost takto rozšířené "říše" Chromalveolata resp. Chromista (v širším slova smyslu) byla zdůvodňována hypotézou o společném fotosyntetizujícím předku, který získal plastid sekundární endosymbiózou ruduchy. Je tato tzv. chromalveolátní hypotéza byla však s největší pravděpodobností vyvrácena, když se ukázalo, e plastidy různých podskupin chromalveolát byly získány v sérii několika endobiotique. [9] Také přirozenost skupiny Hacrobia se ukázala jako sporná. [pozn. 1]

V současnosti (od r. 2010) se taxon Chromalveolata (v širším smyslu) používá spíše pod původnějším synonymem Chromiste [12] s vědomím o jeho nepřirozenosti (možné polyfyletičnosti) pouze v systémech nerespektujících plně fylogenetické vztahy, např. z důvodů jednodušší a přehlednější klasifikace, pro pedagogické účely apod. [13]


Article de recherche original

Vladimir V. Aleoshin 1,2,3* , Alexandre P. Mylnikov 4 , Gulnara S. Mirzaeva 5,6 , Kirill V. Mikhailov 1,2 et Sergueï A. Karpov 7,8*
  • 1 Institut Belozersky de biologie physico-chimique, Université d'État Lomonossov de Moscou, Moscou, Russie
  • 2 Institut Kharkevich pour les problèmes de transmission de l'information, Académie des sciences de Russie, Moscou, Russie
  • 3 Institut de physiologie animale, de biochimie et de nutrition, Kaluga, Russie
  • 4 Institut de biologie des eaux intérieures, Académie des sciences de Russie, Borok, Russie
  • 5 Institut du pool génétique des plantes et des animaux, Académie des sciences ouzbek, Tachkent, Ouzbékistan
  • 6 Université nationale d'Ouzbékistan, Tachkent, Ouzbékistan
  • 7 Institut zoologique, Académie des sciences de Russie, Saint-Pétersbourg, Russie
  • 8 Université d'État de Saint-Pétersbourg, Saint-Pétersbourg, Russie

Les lignées hétérotrophes d'Heterokonta (ou straménopiles), contrairement à un seul groupe monophylétique d'autotrophes, Ochrophyta, forment plusieurs clades qui se ramifient indépendamment de la lignée de tiges d'hétérocontes. Les plus proches voisins d'Ochrophyta dans l'arbre phylogénétique semblent être presque exclusivement bactérivores, alors que l'hypothèse d'une acquisition de plastes par les ancêtres de la lignée ochrophyte suggère une capacité à engloutir des algues eucaryotes. En accord avec cette hypothèse, le prédateur hétérotrophe à la base de la lignée ochrophyte peut être considéré comme un modèle pour l'ancêtre ochrophyte. Ici, nous présentons un nouveau genre et une nouvelle espèce d'hétéroconte hétérotrophe marin libre Develorapax marinus, qui tombe dans un groupe d'hétérocontes isolé, avec le flagellé marin Developayella elegans, et est capable d'engloutir des cellules eucaryotes. Avec des séquences environnementales D. marinus et D. elegans forment un clade de classe Developea nom. nov. représenté par des espèces adaptées à différentes conditions environnementales et avec une large répartition géographique. La position de Developea parmi les Heterokonta dans un arbre phylogénétique à grande échelle est discutée. Nous proposons que les membres du clade Developea représentent un modèle de transition d'un mode d'alimentation bactérivore à un mode d'alimentation prédateur par sélection de proies plus grosses. Vraisemblablement, une telle transition dans la stratégie de pâturage est possible en présence de biofilms bactériens ou d'agrégats attendus dans un environnement eutrophe, et s'est probablement produite dans l'ancêtre ochrophyte.


Morphologie

Les chromalvéolates, contrairement à d'autres groupes avec des représentants multicellulaires, n'ont pas beaucoup de caractéristiques morphologiques communes. Chaque sous-groupe principal présente certaines caractéristiques uniques, notamment les alvéoles des alvéoles, l'haptonème des haptophytes, l'éjectisome des crytophytes et les deux flagelles différents des hétérokontophytes. Cependant, aucune de ces caractéristiques n'est présente dans tous les groupes.

Les seules caractéristiques communes du chromalvéolate sont les suivantes :

Comme il s'agit d'un groupe si diversifié, il est difficile de résumer les caractéristiques communes des chromalvéolates.


Biologie des Organismes

Sexuellement immature et morphologiquement distinct de l'adulte.

La larve subit une métamorphose, la réorganisation des tissus larvaires en un juvénile.

Seuls les animaux en ont (la plupart du temps).

  • Régule le développement de la forme corporelle. Des régulateurs maîtres qui donnent une orientation à l'embryon. Les gènes sont ordonnés dans le
  • ordre où ils sont exprimés d'avant en arrière

Le stade diploïde est dominant.

L'explosion cambrienne (535-525mya) marque le début du rayonnement des espèces.

  • Facteurs contributifs:
  • · Évolution de la relation prédateur/proie
  • · Evolution des structures défensives et offensives
  • · Évolution des gènes Hox
  • · Changements dans la composition de l'atmosphère

La diversité continue d'augmenter.

Plusieurs événements d'extinction de masse

Transition vers les habitats terrestres (460mya)

Transition des vertébrés vers la terre

Les dinosaures dominaient les habitats terrestres

Les angiospermes et les insectes se diversifient

  • Le clivage est en spirale et déterminé (le destin ultime des cellules est établi très tôt).
  • La scission des masses solides du mésoderme forme un véritable coelome.
  • Le blastophore se forme pendant la gastrulation et relie l'archentron à l'extérieur de la gastrula.
  • Le blastophore deviendra la bouche.
  • Le clivage est radial et indéterminé
  • Le mésoderme bourgeonne de la paroi de l'archentron pour former le coelome.
  • Le blastophore deviendra l'anus.
  • Métazoaires de groupe
  • Éponges
  • Hétérotrophe
  • Sédentaire
  • L'eau est aspirée à travers les pores dans une cavité appelée spongocèle et à travers l'osculum.
  • La plupart sont hermaphrodites
  • L'un des plus anciens phylums
  • Formes sessisle poly p et motile (méduse en nage libre)
  • Plan du corps radial diploblastique simple
  • Cavité gastro-vasculaire
  • Classes : Hydrozoaires, Scyphozoaires, Cubozoaires, Anthozoaires
  • Carnivores qui utilisent des tentacules pour capturer des proies armées de cnidocytes avec un "harpon" nématocytaire
  • Un clade
  • Comprend des gelées de peigne
  • diploblastique
  • symétrie radiale
  • utiliser des cils pour la locomotion
  • Classe
  • Certains ont des structures d'alimentation appelées lophophores
  • d'autres ont un stade de développement distinct appelé larve du trophophore
  • d'autres ont perdu l'un ou l'autre au cours de l'évolution
  • Embranchements : Platyhelminthes, Rotifera, Ectoprocta, Braciopoda, Mollusca, Annelida
  • Phylum
  • Vers plats
  • Acoélomates triploblastiques
  • Sont aplatis dorso-ventralement et ont une cavité gastro-vasculaire avec 1 ouverture
  • l'échange de gaz se produit à travers la surface du corps
  • Cours : Catenulida (vers chaînes) & Rhabditophans
  • Embranchement : Plathelminthes
  • Vie libre et parasitaire
  • Planaires : vivent en eau douce et se nourrissent de petits animaux. Avoir des taches oculaires sensibles à la lumière (pas de vrais yeux)
  • Sous-groupes : Trématodes et ténias
  • phylum
  • Petits animaux qui habitent l'eau douce et l'océan, et le sol humide.
  • Avoir un tube digestif avec une bouche et un anus séparés qui se trouvent dans un pseudocoelome rempli de liquide
  • Triploblastique
  • phylum
  • Comme les palourdes mais avec une orientation différente de la coquille
  • avoir un lophophore
  • coelomates
  • phylum
  • Filtres d'alimentation
  • tamiser les aliments hors de l'eau à l'aide d'un lophophore tapissé de cils
  • espèce marie
  • colonial
  • phylum
  • Comprend les escargots, les limaces, les huîtres, les palourdes, les calmars, les poulpes, etc.
  • la plupart sont marins, certains terrestres
  • coelomates
  • Contenir un pied musclé, une masse viscérale et un manteau
  • nourrir avec une râpe comme la radula
  • sexes séparés
  • Classes : Polyplacophora, Gastropoda, Bivalvia, Cephalopoda
  • embranchement : Mollusca
  • Les chitines sont des animaux marins de forme ovale enfermés dans une armure de 8 plaques dorsales. Utilisez un pied comme une ventouse pour tenir la roche et une radula pour gratter les algues.
  • embranchement : Mollusca
  • Majorité
  • Escargots et limaces
  • Torsion qui fait que l'anus de l'animal se retrouve au-dessus de sa tête
  • embranchement : Mollusca
  • Marin
  • palourdes, huîtres, moules et pétoncles
  • Une coquille divisée en 2 moitiés rapprochées par des muscles abducteurs.
  • Certains ont des yeux et des tentacules sensoriels le long du bord de leur manteau
  • embranchement : Mollusca
  • Carnivores avec des mâchoires en forme de bec entourées de tentacules
  • système circulatoire fermé, organes des sens bien développés et cerveaux complexes.
  • Calmars, poulpes et nautiles
  • Phylum Annelida
  • "beaucoup de poils"
  • Avoir des parapodes en forme de pad qui fonctionnent comme des branchies et aident à la locomotion
  • classe
  • recouvert d'une couche dure appelée cuticule qui tombe ou est moulée par le processus appelé ecdysis
  • Embranchements : Anthropodes et Nématodes
  • grade Ecdysozoa
  • Les vers ronds trouvés partout
  • Avoir un tube digestif, un pseudocoelome, pas de système circulatoire, pas de corps segmenté
  • C. Elgans
  • grade Ecdysozoa
  • 2/3 des espèces existantes
  • exosquelette dur segmenté et appendices articulés peu de variation entre les segments
  • Généralement 3 sections : tête, thorax et abdomen
  • Avoir des yeux, des récepteurs olfactifs et des antennes qui fonctionnent au toucher et à l'odorat
  • Système circulatoire ouvert avec hémolymphe
  • Évolution caractérisée par une diminution du nombre de segments et une augmentation de la spécialisation
  • Sous embranchements : Chielicereta, Myriapoda, Hexapoda, Crustacea
  • Phylum majeur Anthoropoda
  • Nommé pour les appendices d'alimentation en forme de griffe appelés chélicères.
  • Limules, arachnides, tiques, acariens et scorpions
  • Céphalothorax avec 6 paires d'appendices (chélicères, pédipalpes, 4 ensembles de pattes motrices)
  • Les échanges gazeux se produisent via les poumons du livre
  • Phylum majeur Anthoropoda
  • Mille-pattes : mange les feuilles, 2 paires de pattes par segment
  • mille-pattes : mange des animaux en décomposition, 1 paire de pattes par segment
  • Phylum majeur Anthoropoda
  • six pattes
  • Comprend les insectes et les parents
  • Les tubes trachéaux sont utilisés pour les échanges gazeux
  • beaucoup subissent une métamorphose
  • certains subissent une métamorphose incomplète
  • Innovations clés pour le succès : Vol, adaptation gymnosperme, adaptation angiosperme
  • Plus de 30 commandes !
  • phylum Heapodes
  • Coléoptères
  • 2 paires d'ailes (1 épaisse et solide, 1 pour voler)
  • Métamorphose complète
  • phylum Heapodes
  • Mouches et moustiques
  • 1 paire d'ailes et de licols (deuxième paire réduite pour l'équilibre)
  • Métamorphose complète
  • phylum Heapodes
  • Abeilles, fourmis et guêpes
  • Social
  • 2 paires d'ailes
  • Métamorphose complète
  • phylum Heapodes
  • Mites et papillons
  • 2 paires d'ailes couvertes d'écailles
  • Métamorphose complète
  • phylum Heapodes
  • Bugs d'assassin, bugs de baiser (vrais bugs)
  • 2 paires d'ailes (1 coriace)
  • Métamorphose incomplète
  • phylum Heapodes
  • sauterelles et grillons
  • 2 paires d'ailes (1 coriace)
  • grandes pattes postérieures (trémies)
  • Métamorphose incomplète
  • Phylum
  • Ont généralement des appendices ramifiés largement spécialisés pour l'alimentation et la locomotion
  • plus petit échange de gaz à travers la cuticule, d'autres ont des branchies
  • Marin
  • Classes : Isopodes (6 pattes), Décapodes (5 paires d'appendices), Balanes (principalement sessiles), Copépodes (source de nourriture pour de nombreux filtreurs)
  • Hétérotrophes
  • les structures sont des filaments muticellulaires et des cellules individuelles
  • Se composent de mycellia, d'hyphes et de septa
  • Champignons
  • Une collection d'hyphes dans une structure en forme de filet.
  • La majeure partie du cycle de vie d'un champignon se déroule dans cette structure.
  • Avoir une relation mutaliste avec les plantes
  • Ont des hyphes spécialisés appelés haustoria qui leur permettent de pénétrer dans les tissus (parois cellulaires et non membranes) de leur hôte. résultant en une augmentation de la surface à la surface avec laquelle ils interagissent et échangent des nutriments.

  • Champignons
  • L'union du cytoplasme de deux mycéliums parentaux.
  • Fusion de deux cellules haploïdes pour former une cellule hétérocaryote (n+n)
  • Champignons
  • Fusion de noyaux haplois pour former un zygote (2n).
  • Cette étape peut prendre un certain temps à se produire
  • Champignons
  • Une cellule où les noyaux haploïdes de chaque parent ne fusionnent pas tout de suite ils coexistent dans le mycellium
  • L'organisme est techniquement diploïde (n+n)
  • Chez certains champignons, les noyaux haplois s'apparient par deux à une cellule.
  • 1 cellule avec 2 noyaux haploïdes encore non fusionnés

  • Royaume des champignons
  • Eau douce et habitats terrestres
  • Unique parmi les champignons à avoir des spores flagellées appelées zoospores
  • Royaume des champignons
  • Inclure les moisissures, les parasites, etc.
  • Nommé pour leurs zygosporanges sexuellement produites (site de caryogamie et de méiose).
  • Résistant au séchage et au gel et peut survivre à des conditions défavorables
  • Royaume des champignons
  • Tous les habitats
  • Produire des spores dans un sac comme des asques contenus dans des organes de fructification appelés ascocarpes - parfois appelés champignons du sac
  • Des levures unicellulaires aux champignons de coupe élaborés et aux morilles
  • Se reproduire de manière asexuée par un nombre énorme de spores asexuées appelées condia qui ne se forment pas à l'intérieur des sporanges
  • Royaume des champignons
  • Champignons, boules feuilletées, champignons des étagères, mycorhizes et parasites des plantes
  • beaucoup sont des décomposeurs
  • Défini par une structure en forme de cube appelée la baside, un stade diploïde transitoire.
  • Se reproduit sexuellement en produisant des organes de fructification élaborés appelés basidiocarpes (champignons)
  • Vertébrés, Deutérostomie
  • Animaux marins sessiles à mouvement lent
  • Avoir un épiderme mince qui est calcifié
  • Système vasculaire de l'eau (réseau de canaux hydroliques se ramifiant en pieds tubulaires qui fonctionnent dans la locomotion et l'alimentation)
  • Sexes séparés, fécondation externe
  • Radial comme symétrie avec des multiples de 5 (étoile de mer)
  • Les larves ont une symétrie bilatérale
  • Classes : Asteroidea, Ohiuroidea, Echinoidea, Crinoidea, Holothuroidea
  • Embranchement : Échinodermes
  • Étoiles de mer
  • Bras multiples rayonnant à partir d'un disque central
  • Se nourrir de bivalves en les ouvrant avec leurs pieds tubulaires
  • Embranchement : Échinodermes
  • Étoiles fragiles
  • Disque distinct avec de longs bras flexibles qu'ils utilisent pour le mouvement
  • Certains sont des suspensivores, d'autres des prédateurs
  • Embranchement : Échinodermes
  • Oursins et dollars des sables
  • N'ont pas de bras mais 5 rangées de pieds tubulaires
  • Les épines sont utilisées pour la locomotion et la protection
  • Se nourrissent principalement d'algues
  • Embranchement : Échinodermes
  • Lys de mer et étoiles à plumes
  • Les mangeurs de suspesion peuvent vivre attachés à la tige du substrat.
  • Les étoiles à plumes peuvent ramper à l'aide de longs bras flexibles
  • Embranchement : Échinodermes
  • Concombres de mer
  • manque d'épines, endosquelette réduit
  • ont 5 rangées de pieds tubulaires, certains sont des tubes d'alimentation modifiés
  • Embranchement majeur
  • 2 clades d'invertébrés, les autres sont des vertébrés
  • Plan du corps : Notochorde, cordon nerveux creux dorsal, fentes ou fentes pharyngées et queue musculaire post anale
  • trouvé dans les accords
  • une tige flexible longitudinale entre le tube digestif et le cordon nerveux. Fournit un soutien squelettique pendant la majeure partie de l'accord.
  • Dans la plupart des cas, un exosquelette plus complexe se développe
  • Fentes : dans la plupart des cordés, des sillons du pharynx appelés fentes pharyngées se développent en clitoris qui s'ouvrent vers l'extérieur du corps
  • Fentes :
  • structures d'alimentation en suspension dans de nombreux cordés d'invertébrés,
  • échanges gazeux chez les vertébrés (pas les tétrapodes)
  • se développer en parties de l'oreille, de la tête et du cou chez les tétrapodes
  • Accords
  • Inclure les lancettes
  • Sont des suspensions marines qui conservent les caractéristiques du plan corporel des chordés à l'âge adulte
  • Invertébrés
  • l'accord le plus basique
  • Accords
  • Tuniciers
  • ressemblent à des cordés au stade larvaire
  • ascidies
  • Grouper
  • Avoir un cerveau, des yeux et d'autres organes sensoriels
  • Avoir une crête neurale : donne naissance à des os, un cartlidge ou un crâne
  • ont un métabolisme plus élevé et sont plus musclés que les invertébrés, les lancelets et les tuniciers
  • Avoir : Cœur avec au moins 2 cavités, globules rouges, reins
  • Les crânes les plus basiques
  • Poissons sorcières
  • manque de mâchoires et de vertèbres
  • charognards marins, de fond
  • Grouper
  • Caractéristiques:
  • Vertèbres entourant une moelle épinière
  • Un crâne élaboré
  • Rayons de nageoires dans les formes aquatiques
  • Vertébrés
  • Lamproies
  • Plus ancienne lignée vivante de vertébrés
  • maring sans mâchoire et eau douce
  • se nourrir en serrant sa bouche sur le côté d'un poisson
  • ont des segments cartilagineux entourant la notocorde et se cambrant en partie sur le cordon nerveux
  • grouper
  • Evolution des mâchoires et du squelette minéralisé
  • Comprend les requins, les poissons à nageoires rayonnées jusqu'aux mammifères
  • On pense que les mâchoires dérivent des supports squelettiques des fentes pharyngées
  • gros cerveau antérieur
  • Il reste 3 lignées aujourd'hui :
  • Chondrichtyes
  • Poissons à nageoires rayonnées
  • nageoires lobées (nous)
  • phylum le plus basal des vertébrés
  • Avoir un squelette composé principalement de cartlidge
  • requins, raies et raies
  • Développement d'embryons à partir d'œufs
  • L'embryon se développe dans l'utérus et se nourrit du jaune d'œuf
  • Développement d'embryons à partir d'œufs
  • L'embryon se développe dans l'utérus et est nourri par le placenta du sac vitellin à partir du sang de la mère
  • grouper
  • Évolution des poumons
  • presque tous ont un endosquelette
  • comprend des poissons osseux et des tétrapodes
  • définit les embranchements Actinistia, Diponi et Actinpterygii
  • Contrôlez la flottabilité avec un sac d'air connu sous le nom de vessie natatoire (un poumon modifié)
  • la plupart sont ovipoaires
  • groupe Ostérichthyes
  • Poissons rayés ou osseux
  • Originaire de la période silurienne
  • Avoir des nageoires soutenues par de longs rayons flexibles utilisés pour la locomotion et la défense
  • Inclure les hippocampes
  • grouper
  • nous inclus dans les nageoires lobées
  • ont des os en forme de tige entourés de muscles dans leurs nageoires pelviennes et pectorales
  • groupes
  • Avoir des adaptations spécifiques
  • 1) Quatre membres et pieds avec chiffres
  • 2) avoir un cou qui permet un mouvement séparé de la tête
  • 3) fusion de l'os pelvien et de la ceinture à la colonne vertébrale
  • 4) l'absence de branchies
  • 5) des oreilles pour détecter les sons aériens
  • Clade
  • Plan corporel : se métamorphoser d'une larve aquatique en un adulte terrestre
  • la plupart ont une peau humide qui complète les poumons dans les échanges gazeux
  • La fécondation est externe et nécessite un environnement humide
  • contient :
  • 1) Urodèle, c'est-à-dire salamandres
  • 2) Anura, grenouilles et crapauds
  • 3) Apoda, salamandres sans pattes
  • grouper
  • Tous les reptiles, oiseaux et mammifères
  • le principal caractère dérivé est l'œuf amniotique
  • peau relativement imperméable et capacité à utiliser la cage thoracique pour ventiler les poumons
  • scission d'un ancêtre commun
  • contient 4 membranes extra-embryonnaires
  • 1) Amnios (protection)
  • 2) Allatois (déchets et échanges gazeux)
  • 3) Chorion (échange gazeux)
  • 4) Sac vitellin (stockage des nutriments pour l'embryon)
  • Comprend : Tuataras, lézards, serpents, tortues, aves, crocodilia et dinosaures éteints
  • Avoir des écailles qui créent une barrière étanche. Déposer des œufs écalés sur terre
  • la plupart sont ectothermes - les aves sont endothermiques
  • Tortues
  • avoir une coque en forme de boîte composée de boucliers supérieur et inférieur fusionnés aux vertèbres, aux clavicules et aux côtes
  • Placement phylogénétique pas encore déterminé
  • Oiseaux ou archosaures adaptés au vol
  • Ont:
  • 1) Ailes avec plumes de kératine
  • 2) manque de vessie
  • 3) femelles avec 1 ovaire
  • 4) petites gonades
  • 5) perte de dents
  • Peut avoir évolué à partir de théropodes
  • Les premières plumes ont peut-être aidé les dinosaures à prendre de la hauteur lorsqu'ils ont sauté, à gagner en traction en montant des collines ou à glisser des arbres
  • "Du lait"
  • +/- 5000 espèces
  • Ont:
  • 1) Glandes mammaires
  • 2) Cheveux
  • 3) Un métabolisme élevé dû à l'endothermie
  • 4) cerveau plus gros que les vertébrés de taille équivalente
  • 5) dents différenciées
  • Évolué à partir de synapdides (dont une caractéristique est la fenêtre - une prise derrière l'œil en forme de chaussette pour soutenir les muscles).
  • Par
  • Mammifères
  • Un petit groupe de mammifères pondeurs d'œufs se compose d'échidnés et d'ornithorynques.
  • Aucun mamelon n'a plutôt une zone de peau qui transpire du lait
  • Mammifères
  • Opossums, kangourous et kooalas.
  • L'embryon se développe dans un placenta dans l'utérus de la mère. Né très tôt et finit son développement dans la poche de la mère appelée marsupium
  • Mammifères
  • Placenta plus complexe
  • Développement embryonnaire complet à l'intérieur d'un utérus relié à la mère par le placenta
  • Une séquence de comportements innés et non appris qui est immuable.
  • Une fois lancé, il est généralement mené à terme
  • Déclenché par un signal externe, connu sous le nom de stimulus
  • Exemple : Les épinoches mâles voient le dessous rouge d'un intrus et attaquent
  • La migration est un changement de lieu régulier et à longue distance
  • Les indices environnementaux peuvent déclencher un mouvement dans une direction particulière
  • Il voit la femelle et oriente son corps vers elle
  • (étape 1 dans la parade nuptiale de drosophila melanogaster)
  • Il confirme chimiquement l'identité de la femelle
  • (étape 2 dans la parade nuptiale de drosophila melanogaster)
  • Le mâle produit un chant de parade nuptiale pour informer la femelle de son espèce
  • (étape 3 dans la parade nuptiale de drosophila melanogaster)

Les abeilles montrent une communication complexe avec le langage symbolique

Une abeille revenant du champ exécute une danse pour communiquer des informations sur la distance et la direction d'une source de nourriture

  • Le comportement inné est fixé sur le plan du développement et ne varie pas d'un individu à l'autre
  • Certains comportements sont influencés par l'environnement
  • Une étude de placement croisé place les jeunes d'une espèce sous la garde d'adultes d'une autre espèce
  • – par exemple les souris de Californie et les souris à pattes blanches
  • L'empreinte est un comportement qui comprend l'apprentissage et des composants innés et est généralement irréversible.
  • Il se distingue des autres apprentissages par une période sensible.
  • Une période sensible est une phase de développement limitée qui est le seul moment où certains comportements peuvent être appris
  • Apprentissage spatial basé sur l'expérience de la structure spatiale de l'environnement.
  • Les animaux construisent des cartes cognitives - une représentation des relations spatiales entre les objets de leur environnement.
  • Dans l'apprentissage associatif, les animaux associent une caractéristique de leur environnement à une autre.
  • - conditionnement opérant
  • - conditionnement classique
  • Une femelle avec un mâle
  • Les espèces monogames ont tendance à être moins sexuellement dimorphes
  • Si la progéniture a besoin de beaucoup de ressources Un mâle maximise son succès reproducteur en restant avec sa compagne et en prenant soin de ses contrôles (monogamie).
  • individu d'un sexe s'accouple avec plusieurs individus de l'autre sexe
  • Les espèces polygames ont tendance à être plus sexuellement dimorphes.
  • polygyne : mâle plus voyant, un mâle s'accouple avec plusieurs femelles
  • polyandre : femelle plus voyante, une femelle s'accouple avec plusieurs mâles
  • Si la progéniture nécessitait peu de ressources Un mâle maximise son succès reproducteur en cherchant des partenaires supplémentaires (polygynie).
  • La certitude de paternité influence les soins paternels et le comportement d'accouplement.
  • La certitude paternelle est relativement faible chez les espèces à fécondation interne. – plus de soins paternels
  • La certitude paternelle est élevée chez les espèces à fécondation externe. – peu de soins paternels
  • Le dimorphisme sexuel résulte de la sélection sexuelle, une forme de sélection naturelle.
  • Dans la sélection intersexuelle, les membres d'un sexe choisissent des partenaires sur la base de certains traits.
  • La sélection intrasexuelle implique une compétition entre les membres du même sexe pour les partenaires.

Parfois, les animaux se comportent de manière à réduire leur forme physique individuelle mais à augmenter celle des autres

Trois variables clés impliquées dans un acte altruiste – Bénéfice pour le bénéficiaire (B) – Coût pour l'altruiste (C) – Coefficient de parenté (r)


3. RÉSULTATS

3.1. Abondance de lecture de séquence et richesse MOTU

Un nombre total de 18 745 326 lectures a été obtenu à partir des cinq emplacements d'échantillonnage. Après l'attribution des échantillons, le filtrage de la qualité et de la séquence de longueur, l'élimination des singletons et l'élimination des MOTU attribués aux bactéries ou à la racine de l'arbre de vie, 2 391 157 lectures ont été laissées sur 68 échantillons. Entre 14 884 et 55 608 lectures filtrées ont été générées par échantillon. Les différences dans le nombre de lectures obtenues par site d'échantillonnage, entre les emplacements, ont été testées à l'aide de l'ANOVA (F =ਃ.36, df =਄, p = .02) et associez‐wise le HSD de Tukey. Des comparaisons par paires ont montré que le nombre moyen de lectures variait de manière significative uniquement entre la Jamaïque et les Bahamas (diff =ꀐ,390,55, p.adj = .03). L'attribution taxonomique a abouti à un total de 14 665 MOTU eucaryotes non simples, dont 6 357 (43,3%) pourraient être attribués au niveau du phylum ou inférieur et 8 308 MOTU (56,7%) sont restés non attribués.

De plus, LULU a détecté un total de 1 896 MOTU provenant de pseudogènes, sur un total de 14 665 MOTU. Ainsi, le nombre de MOTU corrigées dans l'ensemble de données final est de 12 769 (41,8 % attribués au niveau du phylum ou inférieur et 58,2 % sont restés non attribués). Les graphiques de raréfaction pour les échantillons individuels des cinq zones différentes (figure S1) montrent que la saturation du nombre total de MOTU n'est pas atteinte avec cette profondeur de séquençage pour la plupart des échantillons, ce qui indique que la véritable étendue de la richesse des MOTU évaluée à l'aide de cette méthode peut être plus élevée. que les valeurs obtenues dans cette étude.

Les contrôles négatifs contenaient un nombre négligeable de lectures, qui étaient toutes classées comme ADN humain, et ont donc été exclues des analyses ultérieures. Tableau ​ Tableau1 1 affiche un résumé des statistiques de lecture par emplacement.

Tableau 1

Résumé des statistiques de lecture pour chaque emplacement

EmplacementNombre d'échantillonsLe total m litLectures non attribuées (%)Lectures de métazoaires (%)Lectures d'accords (%)Lectures de poissons (%)Le total m MOTUMOTU des métazoaires (%)MOTU d'accords (%)MOTU poissons (%)
Belize8241,20760.49.061.290.032,51117.21.60.8
Bahamas14430,02455.87.350.230.094,12019.61.00.6
Jamaïque12493,27047.311.40.110.0044,35918.20.70.2
Turcs & Caïques21724,16470.813.90.830.066,77423.00.70.4
BVI13502,49252.314.90.070.0085,20323.01.00.4
Moyenne13.6478,23157.311.320.510.0384,59320.21.00.48

“Les lectures non affectées” sont classées comme “ aucune affectation taxonomique (à n'importe quel niveau) disponible”. Les pourcentages de lectures de métazoaires, de chordata et de poissons non attribués sont basés sur le nombre total de lectures pour chaque emplacement. Les pourcentages de MOTU Metazoa, Chordata et Fish sont basés sur le nombre total de MOTU pour chaque emplacement.

Les MOTU attribués aux principaux groupes eucaryotes, pour tous les échantillons de chaque emplacement, sont présentés dans la figure ​ Figure2a. 2 a. Les grands modèles de richesse relative du MOTU dans les cinq sites des Caraïbes sont étonnamment similaires. Le groupe Eukarya” non attribué représente de loin la plus grande richesse relative MOTU dans chaque échantillon, indiquant la présence d'une quantité importante de biodiversité eucaryote, qui n'est pas encore décrite ou n'est pas présente dans les bases de données de référence COI. Les séquences attribuées aux protistes constituent le deuxième groupe le plus diversifié. Les bacillariophytes (diatomées) et les dinoflagellés présentent une diversité relative relativement élevée dans tous les échantillons, tout comme les embranchements regroupés dans la catégorie des « protistes des autres » (barres orange au bas de la figure ? ? , Apicomplexa, Excavata, Hacrobia, Rhizaria, ainsi que les Alveolata, Stramenopiles et Opisthokonta qui n'ont pas pu être attribués à des embranchements spécifiques. Les métazoaires macroscopiques, tels que Arthropoda et Annelida, contiennent en outre une richesse MOTU relativement élevée. Des séquences de Chordata sont détectées dans la plupart des échantillons dans quatre des cinq emplacements (à l'exception de la Jamaïque, où seuls trois échantillons contiennent des lectures de chordés), mais le nombre de MOTU attribués à ce phylum est relativement faible.

(a) Richesse relative des MOTU le nombre relatif de MOTU attribués aux différents phylums par échantillon, par emplacement, et (b) nombre relatif de lectures de chacun des différents phylums, par échantillon, par emplacement

Les abondances relatives de lectures attribuées aux différents phylums dans chaque échantillon sont illustrées à la figure ​ Figure2b. 2 b. Alors que les Eukarya non attribués restent la composante dominante, les abondances de lecture montrent une plus grande différenciation entre les échantillons et les emplacements par rapport aux modèles de richesse relative de MOTU dans la figure ​ Figure2 2 a.

En comparant la richesse relative de MOTU et les abondances de lectures relatives de différents phylums, il est évident que, par exemple, les Bacillariophyta (diatomées) ont une diversité relativement élevée dans la plupart des échantillons, mais les lectures attribuées à ce phylum sont moins abondantes. Une exception sont les échantillons des îles Vierges britanniques (BVI), et dans une certaine mesure de la Jamaïque, où les lectures de Bacillariophyta sont plutôt abondantes (plus de 10 % de toutes les lectures), principalement en raison de l'abondance prépondérante de Rhizosolénie (près de 7 % de toutes les lectures), un taxon qui n'est détecté que très peu dans les quatre autres emplacements (voir https://doi.org/10.5061/dryad.hqbzkh1bj pour toutes les lectures par MOTU, par échantillon).

La richesse MOTU et les abondances de lecture pour les Oomycètes, parasites communs sur les algues marines (Li, Zhang, Tang, & Wang, 2010), suivent un schéma similaire. Bien qu'une grande partie des lectures d'Oomycètes soit attribuée à des MOTU qui n'apparaissent que dans les échantillons de BVI, ceux-ci ne pourraient être attribués taxonomiquement à aucune espèce, genre ou famille. De plus, la majeure partie des lectures d'algues brunes non identifiées (Phéophycées) a été détectée à cet endroit. D'autres MOTU protistes qui caractérisent les échantillons de BVI sont le cercozoaire Bigelowiella natans (98%ID) et quatre diatomées marines centriques : Thalassiosira pseudonana (100% ID), Dityle (89% ID), Grammonème (87 % ID), et Squelette menzellii (100% ID).

Les algues vertes (Viridiplantae) présentent généralement une diversité plus faible par rapport aux autres groupes de protistes. Cependant, les abondances de lectures de ce groupe sont particulièrement élevées dans la plupart des échantillons de la Jamaïque et des Bahamas, et dans une moindre mesure dans les BVI, avec (dans les trois emplacements) la plupart des lectures étant attribuées soit à Commoda Micromonas (99 % ID) ou M. pusilla (78% ID). Une autre partie importante des lectures d'algues vertes est attribuée à Mantoniella squamata (93%ID) et/ou Dolichomastix tenuilepis (92 % ID). Les lectures de Viridiplantae sont absentes de la plupart des échantillons des îles Turks et Caicos, où les lectures de Dinoflagelata sont plus dominantes. Dans l'ensemble, il semble y avoir une tendance générale, à la fois par emplacement et par échantillon, selon laquelle une abondance élevée de Dinoflagellés correspond généralement à une faible abondance d'algues vertes ou de diatomées, et vice versa. La plupart des lectures de dinoflagellés n'ont pas pu être attribuées au-delà de la classe Dinophyceae. Mais les lectures attribuées à Gymnodinium catenatum (98%ID) ont été détectés dans tous les échantillons sauf six. Dans de nombreux échantillons, les lectures du genre des dinoflagellés Symbiodinium (100% ID), qui englobe le groupe le plus important et le plus répandu de dinoflagellés endosymbiotiques (associés aux coraux) (zooxanthelles), sont également présents. Le BVI est le seul endroit qui a un nombre relativement important de lectures attribuées à Ochrophyta, la majeure partie des lectures provenant d'algues brunes (Phaeophyceae), dont certaines pourraient être attribuées au niveau de l'espèce, comme le récif sessile associé Canistrocarpus cerviconis (100%ID) et planctonique Chattonella sous-salsa (99 % ID).

Parmi les métazoaires, les annélides et les arthropodes se trouvent les embranchements avec la plus grande richesse relative de MOTU dans la plupart des endroits (à l'exception du Belize, figure ​ figure2a), 2 a), et ont également tendance à être les plus abondants en termes de lectures (voir segments verts et rouges dans les parcelles Krona de la figure S2), avec des mollusques (c. une composante importante (figure S2). Les espèces de mollusques les plus abondantes (toutes les séquences récupérées de T&# x00026C) étaient la limace de mer aglajid, Chelidonura hirundinina (98%ID), et la pervenche de mangrove, Littoraria angulifera (100% ID). La majorité des lectures de cnidaires dans la colonne d'eau (échantillon 7 aux îles Turques et Caïques) ne proviennent pas d'espèces de corail, mais sont constituées de lectures de l'hydrozoaire Cunina fowleri (80 % ID), bien que certaines espèces de coraux scléractinés, telles que Radians de sidérastrea (100% ID), Porites astreoides (100% ID), et Stéphanocoenia michelinii (99 % ID), ont également été détectés. L'échinoderme lit dans l'échantillon 19 des îles Turques et Caïques sont tous attribués à l'étoile fragile Ophiocoma echinata (100% ID). Les lectures d'échinodermes dans les échantillons jamaïcains sont, en plus des Ophiocoma echinata, assigné à Lytechinus variegatus (100% ID oursin vert), Holothurie impatiens (100% ID concombre de mer goulot d'étranglement), et Actinopyga agassizi (100% ID concombre de mer à cinq dents).

La plupart des lectures d'annélides n'ont pu être attribuées qu'à des vers polychètes non identifiés. Enfin, la plupart des lectures attribuées à Chordata sont dérivées d'ascidies. Certains d'entre eux pourraient être attribués au niveau de l'espèce, comme Botrylloïdes nigrum (100% ID). Le grand nombre de lectures de chordés dans les échantillons 3 et 7 du Belize et les îles Turks et Caicos 4 et 9 est entièrement composé d'espèces non identifiées de l'ordre des tuniciers Enterogona. La plupart des autres lectures de chordés ont été attribuées à Actinopterygii (780 lectures) et à Chondrichthyes (294 lectures), dont la plupart pourraient être attribuées taxonomiquement au niveau d'espèce 54 téléostéens et 6 espèces d'élasmobranches ont été détectées (https://doi.org/ 10.5061/dryad.hqbzkh1bj).

3.2. Structure communautaire

L'ordination des emplacements d'échantillonnage est visualisée par un tracé de mise à l'échelle multidimensionnelle non métrique (nMDS) (Figure ​ (Figure 3). 3). Les comparaisons par paires indiquent que des différences significatives dans la diversité MOTU existent entre les cinq emplacements (F =ਇ.08, df =਄, p < .001). Les îles Turks et Caicos ne se chevauchent partiellement qu'avec les Bahamas. Le Belize et la Jamaïque présentent une plage de variation plus étroite et ne se chevauchent pas, mais les deux se chevauchent partiellement avec certains des échantillons des Bahamas. Les échantillons des îles Vierges britanniques sont complètement séparés des quatre autres emplacements. L'analyse SIMPER (pourcentage de similitude) a été appliquée pour identifier les taxons discriminants entre les îles Vierges britanniques et les quatre autres emplacements. Le MOTU contribuant le plus à cette différenciation est attribué à un taxon eucaryote non identifié (numéro MOTU 703 responsable de 18,6 % de la différenciation) qui est abondant dans les quatre emplacements qui se chevauchent mais qui est très rare dans les îles Vierges britanniques. Les résultats de l'analyse SIMPER, consistant en une liste des 30 phylums les plus discriminants entre les îles Vierges britanniques et les quatre autres emplacements, peuvent être trouvés dans le tableau ​ Tableau2 2 .

Graphique de mise à l'échelle multidimensionnelle non métrique (nMDS) (Bray𠄼urtis, basé sur les abondances de lecture MOTU relatives) montrant le modèle d'ordination pour les cinq emplacements d'échantillonnage. Les comparaisons par paires indiquent des différences significatives dans la diversité MOTU entre tous les emplacements (F =ਇ.08, df =਄, p < .001)

Tableau 2

Résultats de l'analyse SIMPER identifiant les 30 taxons les plus discriminants qui, combinés, contribuent à 51,841% de la différenciation entre les îles Vierges britanniques et les quatre autres emplacements

 RangNom scientifiqueSuper royaumeRoyaumePhylumMoyenne Bah, Bel, Confiture & TɬMoyenne des IVBSomme cumulée
1SuperroyaumeEucaryote (703)   31.820.94418.601
2Espèce Rhizosolenia setigeraChromalveolataStraménopilesBacillariophyta06.2722.361
3Espèce Commoda MicromonasArchaeplastidaViridiplantaeChlorophyte5.3662.20825.838
4ClasserDinophycéesChromalveolataAlvéolataDinoflagellés6.1461.57728.624
5Superroyaumeeucaryote   2.0935.04831.044
6RoyaumeStraménopilesChromalveolataStraménopiles 0.0073.44333.105
7Superroyaumeeucaryote   3.018034.915
8ClasserOomycètesChromalveolataStraménopilesOomycota0.8163.15636.506
9Pas de rang Micromonas pusillaArchaeplastidaViridiplantaeChlorophyte0.8772.86338.012
10RoyaumeStraménopilesChromalveolataStraménopiles 0.6052.54639.242
11Superroyaumeeucaryote   1.732.29240.192
12CommanderSpionidaOpisthokontaMétazoairesAnnélide01.56141.29
13RoyaumeStraménopilesChromalveolataStraménopiles 0.031.46841.991
14RoyaumeMétazoairesOpisthokontaMétazoaires 0.0461.44942.834
15RoyaumeMétazoairesOpisthokontaMétazoaires 0.1031.40543.615
16Superroyaumeeucaryote   0.371.54944.388
17CommanderSpionidaOpisthokontaMétazoairesAnnélide01.04645.015
18Superroyaumeeucaryote   0.0411.03745.617
19Pas de rangEumétazoaOpisthokontaMétazoaires 00.98946.21
20Superroyaumeeucaryote   0.0941.05146.792
21RoyaumeStraménopilesChromalveolataStraménopiles 1.1150.82447.37
22Espèce Hématodinium sp.ChromalveolataAlvéolataDinoflagellés0.0290.95547.925
23PhylumBacillariophytaChromalveolataStraménopilesBacillariophyta0.1220.92648.463
24RoyaumeStraménopilesChromalveolataStraménopiles 0.9740.11748.99
25Superroyaumeeucaryote   0.8530.00549.499
26Superroyaumeeucaryote   0.0860.91649.998
27Superroyaumeeucaryote   0.8330.04250.479
28Superroyaumeeucaryote   0.768050.94
29PhylumArthropodesOpisthokontaMétazoairesArthropodes0.1520.75551.397
30RoyaumeMétazoairesOpisthokontaMétazoaires 0.0130.75451.841

Le MOTU contribuant le plus à la différenciation est attribué à un taxon eucaryote non identifié, le numéro MOTU 703, représentant 18,601% de la différenciation. Ce MOTU est abondant dans les quatre emplacements qui se chevauchent, alors qu'il est rare dans les îles Vierges britanniques.

Afin de tester si la diversité MOTU dans les îles Vierges britanniques resterait significativement différente des autres emplacements sans l'abondante MOTU eucaryote 703, nous avons vérifié que l'ellipse des îles Vierges britanniques restait complètement séparée des autres emplacements du MDS (non illustré). et les comparaisons par paires sont restées significatives entre tous les emplacements (F =ਇ.02, df =਄, p < .001).

Pour chacun des cinq emplacements d'échantillonnage, des parcelles nMDS individuelles sont affichées dans la figure ​ Figure4, 4, montrant les modèles d'ordination dans les zones. Aux Bahamas (Figure ​ (Figure4a), 4 a), les deux échantillons avec le plus grand nombre de lectures de dinoflagellés (voir aussi Figure ​ Figure2b) 2 b) sont clairement séparés du reste (F =ਅ.22, df =ਁ, p < .01). Il s'agit des échantillons numéro 01 et 09, qui ont été collectés dans des zones de mangrove, tandis que les douze autres échantillons provenaient de sites récifaux. L'analyse SIMPER des séquences des sites d'échantillonnage des Bahamas (Données S1), indique en effet qu'un MOTU de dinoflagellé non identifié est un contributeur majeur à la différenciation entre les échantillons de mangrove et de récif, tandis que les deux autres MOTU les plus différenciantes sont un MOTU eucaryote non identifié et également le même eucaryote MOTU 703 qui est en grande partie responsable de la séparation entre les îles Vierges britanniques et les autres emplacements. Avec les algues vertes Commoda Micromonas (99 % DI), plus abondant dans les échantillons récifaux, ces quatre MOTU représentent près de 37 % de la différenciation entre les échantillons provenant des sites récifaux et ceux provenant des sites de mangrove.

Graphiques de mise à l'échelle multidimensionnelle non métrique (nMDS) montrant les modèles d'ordination dans chacun des cinq emplacements d'échantillonnage

Au Belize, des échantillons ont été collectés sur les sites de l'arrière et de l'avant-récif, ce qui est reflété dans son graphique d'ordination (Figure ​ (Figure 4b). 4 b). Ici, les échantillons sont convergés dans des ellipses avant et arrière séparées (F =ਃ.54, df =ਁ, p < .05). Les échantillons de l'arrière-récif sont caractérisés par un nombre plus élevé de lectures de dinoflagellés, de Bacillariophyta, de Viridiplantae et de chordés (tuniciers), tandis que les échantillons de l'avant-récif contiennent plus de lectures d'Eucarya, d'Oomycètes et de Cnidaria non attribués (Figure ‛ (Figure 2b) 2b). L'analyse SIMPER (Données S1) indique que l'eucaryote inconnu MOTU 703 est responsable de près de 23% de la différenciation entre les échantillons de l'arrière et de l'avant-récif, étant plus abondant dans les sites de l'avant-récif. De plus, les mêmes séquences inconnues de dinoflagellés (numéro de séquence 152) qu'aux Bahamas sont le deuxième MOTU le plus important, se produisant plus abondamment dans les échantillons de l'arrière-récif. La différenciation supplémentaire au sein de l'ellipse de l'arrière-récif peut s'expliquer par le fait que ces échantillons ont été collectés sur deux sites différents de l'arrière-récif (tableau S1).

Les sites d'échantillonnage dans les BVI sont séparés en quatre groupes différents (Figure ​ (Figure4c). 4 c). Les échantillons qui ont été prélevés directement sur le rivage (sans l'utilisation d'un bateau, m =਄) sont les plus différents des échantillons qui ont été collectés sur les sites de récifs (F =ਁ.56, df =ਃ, p < .01). L'analyse SIMPER indique que les MOTU d'eucaryotes inconnus 703 et de dinoflagellés contribuent le plus à la dissemblance de la diversité des MOTU entre le rivage et les sites récifaux. Avec un MOTU de mollusque non identifié, ils contribuent à près de 34 % de la dissimilarité totale (Données S1).

En Jamaïque, des échantillons ont été collectés sur deux sites distincts, Discovery Bay et Montego Bay, qui sont regroupés séparément sur la figure ​ Figure4d. 4 jours. L'eucaryote non attribué MOTU 703 (plus abondant à Montego Bay), ainsi que Commoda Micromonas (99 % ID) et un autre MOTU eucaryote non attribué contribuent à près de 22 % de la dissemblance (F =ਂ.26, df =ਁ, p < .005) entre les deux sites.

Dans les échantillons de Turks et Caicos, les deux environnements d'échantillonnage (mangroves et récifs) peuvent être distingués dans le nMDS (Figure ​ (Figure4e). 4 e). Comme pour ceux des Bahamas, les échantillons collectés dans les zones de mangrove sont regroupés séparément des échantillons collectés sur les sites récifaux (F =਄.79, df =ਂ, p < .001). L'eucaryote non attribué 703 est le MOTU le plus dominant dans les échantillons de récifs et est responsable de près de 28 % de la dissemblance entre les échantillons des deux types d'environnement (Données S1). Le dinoflagellé non assigné, étant plus abondant dans les sites de mangrove, représente le deuxième MOTU le plus important. De plus, la figure ​ Figure3 3 révèle que les deux échantillons de mangrove des Bahamas (échantillons 01 et 09), qui divergent de l'ellipse de l'échantillon des Bahamas, ont tendance à converger avec les échantillons de mangrove (02, 05 et 06) des Turcs. et Caïques. Au sein de l'emplacement, les résultats de comparaison par paire restent significatifs pour les cinq emplacements après la suppression du MOTU 703, Bahamas (F =ਅ.15, df =ਁ, p < .01), Belize (F =ਃ.56, df =ਁ, p < .05), BVI (F =ਁ.56, df =ਃ, p < .01), Jamaïque (F =ਂ.25, df =ਁ, p < .005) et Tɬ (F =਄.73, df =ਂ, p < .001).


Biologie II Chapitre 28

Contrairement aux cellules des procaryotes, les cellules eucaryotes ont un noyau et d'autres organites liés au membéane, tels que les mitochondries et l'appareil de Golgi.

Ceci malgré le fait que la plupart des protistes sont unicellulaires. Les protistes unicellulaires sont à juste titre considérés comme les eucaryotes les plus simples, mais au niveau cellulaire, de nombreux protistes sont très complexes.

Les protistes unicellulaires remplissent les mêmes fonctions essentielles, mais ils le font en utilisant des organites subcellulaires et non des organes multicellulaires.

Organisme capable à la fois de photosynthèse et d'hétérotrophie.

Certains protistes présentent cette caractéristique.

Les chlorarachniophytes ont probablement évolué lorsqu'un eucaryote hétérotrophe a englouti une algue verte, qui effectuait toujours la photosynthèse avec ses plastes et contenait son propre noyau vestigial.

Conformément à l'hypothèse selon laquelle les chlorarachinophytes ont évolué à partir d'un eucaryote qui a englouti un autre eucaryote, leurs plastes sont entourés de quatre membranes. Les deux membranes internes sont à l'origine les membranes interne et externe de l'ancienne cyanobactérie. La troisième membrane est dérivée de la membrane plasmique de l'algue engloutie, et la membrane la plus externe est dérivée de la vacuole alimentaire de l'eucaryote hétérotyophe. Chez d'autres protistes, les plastes acquis par endosymbiose secondaire sont entourés de trois membranes, indiquant que l'une des quatre membranes d'origine a été perdue au cours de l'évolution.

Un groupe dépourvu de mitochondries conventionnelles et ayant moins d'organites membranaires que les autres protistes.

Beaucoup de "protistes amitochondries" ont en fait des mitochondries - bien que réduites.

Parce que la racine de l'arbre eucaryote n'est pas connue, les cinq supergroupes sont montrés comme divergeant simultanément d'un ancêtre commun - ce qui n'est pas correct mais on ne sait pas quels organismes ont d'abord divergé des autres.

  • Rouge, Vert, endosymbiose secondaire

Les champignons et les animaux font partie du supergroupe Unikonta.

Les fouilles comprennent des parasites tels que Giardia, ainsi que de nombreuses espèces prédatrices et photosynthétiques.

  • Certains membres de ce supergroupe ont une rainure creusée sur un côté du corps cellulaire. Deux clades majeurs (les parabasalides et les diplomates) ont modifié les mitochondries, d'autres (les euglénozoaires) ont des flagelles qui diffèrent par leur structure de ceux des autres organismes.

Les CChromalvéolates comprennent certains des organismes photosynthétiques les plus importants sur Terre. Ce groupe comprend les algues brunes qui forment des « forêts » de varech sous-marine ainsi que d'importants agents pathogènes tels que Plasmodium, qui cause le paludisme, et Phytophtora, qui a causé la famine dévastatrice de la pomme de terre en Irlande du 19ème siècle.

  • Ce groupe peut provenir d'un ancien événement d'endosymbiose secondaire.

Ce groupe se compose d'espèces d'amibes, dont la plupart ont des pseudopodes de forme filiforme.

  • Les pseudopodes sont des extensions qui peuvent gonfler à partir de n'importe quelle partie de la cellule, ils sont utilisés dans le mouvement et dans la capture de proies.

Ce groupe d'eucaryotes comprend les algues rouges et les algues vertes, ainsi que les plantes terrestres. Les algues rouges et les algues vertes comprennent les espèces unicellulaires, les espèces coloniales (telles que l'algue verte Volvox) et les espèces multicellulaires. La plupart des grandes algues connues officieusement sous le nom d'« algues » sont des algues rouges ou vertes multicellulaires. Les protistes d'Archaeplastida comprennent des espèces photosynthétiques clés qui forment la base du réseau trophique dans certaines communautés aquatiques.

Les algues vertes et rouges sont incluses dans le supergroupe Archaeplastida.

Les algues dorées et brunes sont incluses dans le supergroupe Chromalveolata.

Ce groupe d'eucaryotes comprend des amibes qui ont des pseudopodes en forme de lobe ou de tube, ainsi que des animaux, des champignons et des protistes qui sont étroitement liés aux animaux ou aux champignons.

Selon une hypothèse actuelle, ces unikontes pourraient avoir été les premiers groupes d'eucaryotes à diverger des autres eucaryotes, mais l'hypothèse n'a pas encore été largement acceptée.

(V/F) La plupart des diplomonades et des parabasalides du supergroupe Excavata se trouvent dans des environnements anaérobies.

(V/F) Ces deux groupes manquent également de plastes et ont des mitochondries modifiées (jusqu'à récemment, on pensait qu'ils manquaient complètement de mitochondries).
Vrai faux

Les diplomates manquent de chaînes de transport d'électrons fonctionnelles et ne peuvent donc pas utiliser l'oxygène pour aider à extraire l'énergie des glucides et autres molécules organiques. Au lieu de cela, les diplomates doivent obtenir l'énergie dont ils ont besoin à partir des voies biochimiques anaérobies.

Les parabasalides génèrent de l'énergie de manière anaérobie, libérant de l'hydrogène gazeux comme sous-produit.

Les protistes qui ont une seule grande mitochondrie qui contient une masse organisée d'ADN appelée kinétoplaste.

Ils appartiennent au supergroupe Excavata et au groupe des euglénozoaires. Ces organismes ont une tige en spirale ou cristalline de fonction inconnue dans leurs flagelles.

Ces protistes comprennent des espèces qui se nourrissent de procaryotes dans les écosystèmes d'eau douce, marins et terrestres humides, ainsi que des espèces qui parasitent des animaux, des plantes et d'autres protistes. Tel que Trypanosome qui provoque la maladie du sommeil chez l'homme.

Protistes qui a une poche à une extrémité de la cellule d'où émergent un ou deux flagelles. De nombreuses espèces d'euglène Euglena sont des mixotrophes : à la lumière du soleil, ils sont autotrophes, mais lorsque la lumière du soleil n'est pas disponible, ils peuvent devenir hétérotrophes, absorbant les nutriments organiques de leur environnement.

De nombreux autres euglènes engloutissent leurs proies par phagocytose.

Leurs mitochondries n'ont pas de chaîne de transport d'électrons et ne peuvent donc pas fonctionner dans la respiration aérobie.

Un supergroupe très large et diversifié de protistes extrêmement divers et a récemment été proposé sur la base de deux sources de données.

1) Certaines données de séquence d'ADN (mais pas toutes) suggèrent que les chromaveolates forment un groupe monophylétique.

2) Certaines données soutiennent l'hypothèse selon laquelle les chromalvéolates sont apparus il y a plus d'un milliard d'années, lorsqu'un ancêtre commun du groupe a englouti une algue rouge photosynthétique à cellules signle. Parce que les ailes rouges sont supposés provenir d'une endosymbiose primaire, une telle origine pour les chromalvéolates est appelée endosymbiose secondaire.

Un groupe de protistes au sein du supergroupe Chromalveolates (l'autre groupe est straménopiles) dont la monophylie est bien étayée par la systématique moléculaire (formant un clade). Structurellement, les espèces de ce groupe ont des sacs liés à la membrane (alvéoles) juste sous la membrane plasmique. La fonction des alvéoles est inconnue, mais il est supposé qu'elles peuvent aider à stabiliser la surface cellulaire ou à réguler la teneur en eau et en ions de la cellule.

Les alvéolés comprennent trois sous-groupes : un groupe de flagellés (les dinoflagellés), un groupe de parasites (les apicomplexes) et un groupe de protistes qui se déplacent à l'aide de cils (les ciliés).

Protistes au sein du supergroupe Chromalveolates et du groupe alvéolates.

Celles-ci sont caractérisées par des alvéoles renforcées par des plaques de cellulose. Deux flagelles situés dans des rainures perpendiculaires dans cette "armure" font sprinter les dinoflagellés lorsqu'ils se déplacent dans l'eau. Les dinoflagellés sont des composants abondants du plancton marin et d'eau douce, des communautés de micro-organismes qui vivent près de la surface de l'eau.

  • Ces dinoflagellés comprennent certaines des espèces photosynthétiques les plus importantes. Cependant, de nombreux dinoflagellés photosynthétiques sont mixotrophes, et environ la moitié des dinoflagellés sont purement hétérotrophes.
  • Les efflorescences de dinoflagellés - épisodes de croissance démographique explosive - provoquent parfois un phénomène appelé "marée rouge" dans les eaux côtières.

Les efflorescences de dinoflagellés peuvent provenir d'une endosymbiose secondaire d'une algue rouge. On pense que l'algue rouge est issue d'une endosymbiose primaire.

Les efflorescences de dinoflagellés sont des épisodes de croissance démographique explosive qui apparaissent rouge brunâtre ou rose en raison de la présence de caroténoïdes, les pigments les plus courants dans les plastes des dinoflagellés.

Les toxines produites par certains dinoflagellés ont causé la mort massive d'invertébrés et de poissons. Les humains qui mangent des mollusques qui ont accumulé les toxines sont également touchés, parfois mortellement.

Protistes au sein du supergroupe Chromalveolates et du groupe alvéolates.

Presque tous les apicomplexes sont des parasites des animaux et certains provoquent de graves maladies humaines. Les parasites se propagent à travers leur hôte sous forme de minuscules cellules infectieuses appelées sporozoïtes.

Les apicomplexes sont ainsi nommés parce qu'une extrémité (la sommet) de la cellule du sporozoïte contient un complexe d'organites spécialisés pour pénétrer dans les cellules et les tissus hôtes.

Bien que les apicomplexes ne soient pas photosynthétiques, des données récentes ont montré qu'ils conservent un plaste modifié (apicoplaste), probablement d'origine algale rouge.

La plupart des apicomplexes ont des cycles de vie complexes avec les deux stades sexuels et asexués.

Protistes au sein du supergroupe Chromalveolates et du groupe alvéolates.

Les ciliés sont un groupe important et varié de protistes nommés pour leur utilisation des cils pour se déplacer et se nourrir. Les cils peuvent recouvrir complètement la surface cellulaire ou peuvent être regroupés en quelques rangées ou touffes. Chez certaines espèces, des rangées de cils serrés fonctionnent collectivement dans la locomotion. D'autres ciliés se précipitent sur des structures ressemblant à des pattes construites à partir de nombreux cils collés ensemble.

Une caractéristique distinctive des ciliés est la présence de deux types de noyaux : de minuscules micronoyaux et de gros macronoyaux. Une cellule possède un ou plusieurs noyaux de chaque type.

La variation génétique résulte de la conjugaison, un processus sexuel dans lequel deux individus échangent des micronoyaux haploïdes. Les ciliés se reproduisent généralement de manière asexuée par fission binaire, au cours de laquelle le macronoyau existant se désintègre et un nouveau se forme à partir des micronoyaux de la cellule. Chaque macronoyau contient généralement plusieurs copies du génome du cilié.

Les gènes du macronoyau contrôlent les fonctions quotidiennes de la cellule, telles que l'alimentation, l'élimination des déchets et le maintien de l'équilibre hydrique.

La variation génétique résulte de la conjugaison, un processus sexuel dans lequel deux individus échangent des micronoyaux haploïdes. Les ciliés se reproduisent généralement de manière asexuée par fission binaire, au cours de laquelle le macronoyau existant se désintègre et un nouveau se forme à partir des micronoyaux de la cellule. Chaque macronoyau contient généralement plusieurs copies du génome du cilié.

Un groupe de protistes au sein du supergroupe Chromalveolates (l'autre groupe est Alveolates). Les straménopiles sont un groupe d'algues marines qui comprennent certains des organismes photosynthétiques les plus importants de la planète, ainsi que des clades d'hétérotrophes.

Leur nom (étamine - paille pile - cheveux) fait référence à leur flagelle caractéristique, qui a de nombreuses projections fines et poilues. Dans la plupart des straménopiles, ce flagelle « poilu » est associé à un flagelle « lisse » (non poilu) plus court.

Le groupe se compose de diatomées, d'algues dorées, d'algues brunes et d'oomycètes.

Protistes au sein du supergroupe Chromalveolates et du groupe straménopiles.

  • Les diatomées sont des algues unicellulaires qui ont une paroi vitreuse unique en silice hydratée (dioxyde de silicium) incrustée dans une matrice organique. Le mur se compose de deux parties qui se chevauchent comme une boîte à chaussures et son couvercle. Les parois offrent une protection efficace contre les mâchoires écrasantes des prédateurs.
  • Une grande partie de la force de la diatomée vient de la délicate dentelle des trous et des rainures dans leurs murs. Si les murs étaient lisses, il faudrait 60% de force en moins pour les écraser.

Les diatomées se reproduisent de manière asexuée par mitose, chaque cellule fille recevant la moitié de la paroi cellulaire parentale et en générant une nouvelle moitié qui s'insère à l'intérieur. Certaines espèces forment des kystes en tant que stades résistants. La reproduction sexuée se produit mais n'est pas courante chez les diatomées.

La première phrase est vraie mais la deuxième phrase est fausse. Les efflorescences de diatomées contribuent à réduire le réchauffement climatique, car leurs corps incorporent du carbone dans leur corps à partir du dioxyde de carbone présent dans l'air pendant la photosynthèse. Les corps coulent au fond de l'océan et sont moins susceptibles d'être décomposés par les bactéries et autres décomposeurs que ceux qui sont mangés.

Protistes au sein du supergroupe Chromalveolates et du groupe straménopiles.

Les algues dorées sont généralement biflagellées, les deux flagelles étant attachés près d'une extrémité de la cellule. La couleur caractéristique résulte des caroténoïdes jaunes et bruns.

De nombreuses algues dorées sont des composants du plancton d'eau douce et marin. Alors que toutes les algues dorées sont photosynthétiques, certaines espèces sont mixotrophes. Ces mixotrophes peuvent absorber des composés organiques dissous ou ingérer des particules alimentaires, notamment des cellules vivantes (eucaryotes et procaryotes) par phagocytose.

La plupart des espèces sont unicellulaires, mais certaines sont coloniales.

Protistes au sein du supergroupe Chromalveolates et du groupe straménopiles.

Les algues brunes sont les algues les plus complexes et les plus grandes. Tous sont multicellulaires et la plupart sont marins.

Les algues brunes comprennent des espèces ayant des tissus et des organes spécialisés qui ressemblent à ceux des plantes. Mais les preuves morphologiques et ADN indiquent que les similitudes ont évolué indépendamment dans les lignées d'algues et de plantes, et sont donc analogues, non homologues.

Une algue brune qui ressemble à une plante est connue sous le nom de thalle ( thalle, thalle - germer). Contrairement au corps d'une plante, un thalle typique se compose d'un crampon en forme de racine, qui ancre l'algue, et d'un stipe en forme de tige, qui soutient les limbes en forme de feuille.

Les algues brunes se reproduisent par alternance de générations - alternance de formes multicellulaires haploïdes et diploïdes.

Les algues brunes appartiennent au supergroupe des Chromalveolata tandis que les plantes terrestres appartiennent au supergroupe des Archaeplastida.

Les algues brunes comprennent des espèces ayant des tissus et des organes spécialisés qui ressemblent à ceux des plantes. Mais les preuves morphologiques et ADN indiquent que les similitudes ont évolué indépendamment dans les lignées d'algues et de plantes, et sont donc analogues, non homologues.

L'individu diploïde est appelé sporophyte car il produit des spores. Les spores sont haploïdes et se déplacent au moyen de flagelles. Les spores flagellées sont appelées zoospores. Les zoospores se développent en gamétophytes mâles et femelles haploïdes, qui produisent des gamètes. L'union de deux gamètes (fécondation ou syngamie) donne un zygote diploïde, qui mûrit et donne naissance à un nouveau sporophyte.

Dans les deux générations, pour les hétéromorphes, les sporophytes et les gamétophytes sont structurellement différents.

Pour les générations ismorphes, les sporophytes et les gamétophytes se ressemblent mais ils diffèrent par le nombre de chromosomes.

Protistes au sein du supergroupe Chromalveolates et du groupe straménopiles.

Les oomycètes comprennent les moisissures aquatiques, les rouilles blanches et le mildiou. Sur la base de la morphologie, ils étaient auparavant classés comme champignons, mais ils ne sont pas liés aux champignons et sont probablement dus à une évolution convergente. Chez les oomycètes et les champignons, le rapport surface/volume élevé des structures filamenteuses améliore l'absorption des nutriments de l'environnement.

L'une des différences est que les oomycètes ont généralement des parois cellulaires en cellulose, alors que les parois des champignons sont principalement constituées d'un autre polysaccharide, la chitine.

Bien que les oomycètes descendent d'ancêtres qui battent les plastes, ils n'ont plus de plastes et n'effectuent pas de photosynthèse. Au lieu de cela, ils acquièrent généralement des nutriments en tant que décomposeurs ou parasites.

La plupart des moisissures aquatiques sont des décomposeurs. Les rouilles blanches et les mildiou vivent généralement sur terre en tant que parasites des plantes.

Les algues et les plantes à alternance de générations ont un stade haploïde multicellulaire et un stade diploïde multicellulaire.

Dans les deux autres cycles de vie, le stade haploïde ou le stade diploïde est unicellulaire.

Le supergroupe Rhizaria qui comprend les groupes chlorarachniophytes, foraminifères et radiolaires.

De nombreuses espèces de Rhizaria font partie des organismes appelés amibes. Les amibes étaient autrefois définies comme des protistes qui se déplacent et fléchissent au moyen de pseudopodes, des extensions qui peuvent se gonfler de presque n'importe où sur la surface cellulaire.

Une amibe se déplace en prolongeant un pseudopode et en ancrant la pointe. Les amibes ne sont pas seulement confinées dans le supergroupe Rhizaria et sont dispersées dans de nombreux taxons eucaryotes éloignés. La plupart des membres du clade Rhizaria se distinguent morphologiquement des autres amibes par leurs pseudopodes filiformes.

Protistes au sein du supergroupe Rhizarians. Ceux-ci sont également connus sous le nom foram - nommés pour leurs coquilles poreuses, appelées tests.

Les tests Foram consistent en une seule pièce de matière organique durcie avec du carbonate de calcium. Les pseudopodes qui s'étendent à travers les pores fonctionnent en nageant, en testant la formation et en se nourrissant. De nombreux forams tirent également leur nourriture de la photosynthèse des algues symbiotiques qui vivent dans les tests.

90% de toutes les espèces identifiées de forams sont connues à partir de fossiles.

Protistes au sein du supergroupe Rhizarians.

Ces protistes ont des squelettes internes délicats et à symétrie complexe qui sont généralement faits de silice. Les pseudopodes de ces protistes rayonnent à partir du corps central et sont renforcés par des faisceaux de microtubules. Les microtubules sont recouverts d'une fine couche de cytoplasme, qui engloutit des micro-organismes plus petits qui s'attachent aux pseudopodes.

Les humains et les champignons sont plus étroitement liés que les humains et les plantes ou les champignons et les plantes.

Un supergroupe monophylétique qui descend de l'ancien protiste qui a englouti un cyanobaterium.

Le groupe se compose d'algues rouges, d'algues vertes et de plantes terrestres.

Il y a plus d'un milliard d'années, un protiste hétérotrophe a acquis un endosymbionte cyanobaterial, et les descendants photosynthétiques de cet ancien protiste ont évolué en algues rouges et en algues vertes. La lignée qui a produit les algues vertes, a donné naissance aux plantes terrestres.

Prostis au sein du supergroupe Archaeplastida.

Les algues rouges sont les grandes algues les plus abondantes dans les eaux côtières chaudes des océans tropicaux. Leurs pigments accessoires leur permettent d'absorber la lumière bleue et verte, qui pénètrent relativement loin dans l'eau.

La plupart des algues rouges sont multicellulaires, même si aucune n'est aussi grosse que les varechs bruns géants.

Les thalles de nombreuses algues rouges sont filamenteux, souvent ramifiés et entrelacés en motifs de dentelle. La base du thalle est généralement différenciée comme un simple crampon.

Les algues rouges ont des cycles de vie particulièrement divers et l'alternance des générations est courante. Contrairement à d'autres algues, elles n'ont pas d'étapes flagellées dans leur cycle de vie et dépendent des courants d'eau pour rassembler les gamètes en vue de la fertilisation.

Protistes au sein du supergroupe Archaeplastida.

Les algues vertes ont une ultrastructure et une composition pigmentaire tout comme les chloroplastes des plantes terrestres.

Certains systématiciens préconisent d'inclure les algues vertes dans un royaume « végétal » élargi, les Viridiplantae. Du point de vue phylogénétique, ce changement a du sens, car sinon les algues vertes sont un groupe paraphylétique.

Les algues vertes se divisent en deux groupes principaux : les chlorophytes et les charophycés.

Une plus grande taille et une plus grande complexité ont évolué dans les chlorophytes par trois mécanismes différents :

1) La formation de colonies de cellules individuelles, comme on le voit dans Volvox et sous des formes filamenteuses qui contribuent aux masses filandreuses connues sous le nom d'écume d'étang.

2) La formation de véritables corps multicellulaires par division et différenciation cellulaires, comme on le voit chez les algues Ulva

3) La division répétée des noyaux sans division cytoplasmique, comme on le voit dans les filaments multinucléés de Caulerpa.

1) La formation de colonies de cellules individuelles, comme on le voit chez Volvox et sous des formes filamenteuses qui contribuent aux masses filandreuses connues sous le nom d'écume d'étang.

2) La formation de véritables corps multicellulaires par division et différenciation cellulaires, comme on le voit chez l'algue Ulva

3) La division répétée des noyaux sans division cytoplasmique, comme on le voit dans les filaments multinucléés de Caulerpa.

Presque toutes les espèces de chlorophytes se reproduisent sexuellement au moyen de gamètes biflagellés qui ont des chloroplastes en forme de coupe.

L'alternance des générations a évolué dans les cycles de vie des chlorophytes, y compris Ulva, dans lequel les générations alternées sont isomorphes.

celui d'Ulva le thalle contient de nombreuses cellules et se différencie en une lame réaliste et un crampon semblable à un roo. de Caulerpa Le thalle est composé de filaments multinucléés sans parois transversales, il s'agit donc essentiellement d'une grande cellule.

1) La formation de colonies de cellules individuelles, comme on le voit chez Volvox et sous des formes filamenteuses qui contribuent aux masses filandreuses connues sous le nom d'écume d'étang.

2) La formation de véritables corps multicellulaires par division et différenciation cellulaires, comme on le voit chez l'algue Ulva

3) La division répétée des noyaux sans division cytoplasmique, comme on le voit dans les filaments multinucléés de Caulerpa.

Un supergroupe d'eucaryotes récemment proposé et extrêmement diversifié qui comprend des animaux, des champignons et certains protistes.

Il existe des clades majeurs d'unikonts, les amibozoaires et le opisthokontes (animaux, champignons et groupes protistes étroitement apparentés).

La racine de l'arbre phylogénétique des eucaryotes est inconnue, mais il a été proposé que les unikontes aient été les premiers eucaryotes à diverger des eucaryotes. Stechmann et Smith ont proposé que le supergroupe Unikonta n'ait pas de fusion de gènes DHFR-TS alors que tous d'autres supergroupes ont connu la fusion.

Un groupe de protistes au sein du supergroupe Unikonta et du clade amoebozoan.

Les moisissures visqueuses, ou mycétozoaires, étaient autrefois considérées comme des champignons car elles produisent des organes de fructification qui aident à la dispersion des spores. Cependant, la ressemblance entre les moisissures visqueuses et les champignons semble être un exemple de convergence évolutive.

Les moisissures visqueuses ont divergé en deux branches principales, les moisissures visqueuses plasmodiales et les moisissures visqueuses cellulaires - qui se distinguent en partie par leurs cycles de vie uniques.

Les moisissures visqueuses plasmodiales, la condition diploïde est la partie prédominante du cycle de vie, tandis que les moisissures visqueuses cellulaires sont des organismes haploïdes. (seul le zygote est diploïde).

Les deux sont classés dans le supergroupe Unikonata sous amibozoaire.

Dans la plupart des moisissures visqueuses plasmodiales, la condition diploïde est la partie prédominante du cycle de vie. À un stade de leur cycle de vie, ils forment une masse appelée plasmodium, qui est une masse unique de cytoplasme non divisée par des membranes plasmiques et contenant de nombreux noyaux diploïdes.

Dans les moisissures visqueuses cellulaires, ce sont des organismes haploïdes (seul le zygote est diploïde). Bien que la masse de cellules ressemble à une moisissure visqueuse plasmodiale, les cellules restent séparées par leurs membranes plasmiques individuelles.

Ils ont également des organes de fructification qui fonctionnent dans la reproduction asexuée plutôt que sexuelle.

Protistes au sein du supergroupe Unikonta et clade amibozoaires qui ne sont pas libres (contrairement aux autres), qui appartiennent au genre Entamoeba servant de parasites. Ils infectent toutes les classes de vertébrés ainsi que certains invertébrés.

Les humains sont l'hôte d'au moins six espèces de Entamoeba, mais un seul, E. histolytica est connu pour être pathogène.

Le clade au sein d'Unikonta qui comprend un groupe extrêmement diversifié d'eucaryotes tels que des animaux, des champignons et plusieurs groupes de protistes.

Deux groupes à mentionner sont choanoflagellés qui sont plus étroitement liés aux animaux qu'aux autres protistes et nucléides qui sont plus étroitement liés aux champignons que les autres protistes.

Excavation - comprend les protistes avec des mitochondries modifiées et les protistes avec des flagelles uniques.

Chromalvéolates - peuvent provenir d'une endosymbiose secondaire

Rhizarians - un grand groupe diversifié de protistes définis par des similitudes d'ADN

Archaeplastida - Les algues rouges et les algues vertes sont les plus proches parents des plantes terrestres

Unikonts - comprend les protistes qui sont étroitement liés aux champignons et aux animaux.

Diplomonades et parabasalides - mitochondries modifiées.

Euglenozoans - spirale ou cristallin monté à l'intérieur des flagelles

Alvéoles - Sacs membranaires (alvéoles) sous la membrane plasmique

Stramenopiles - Flagelles poilus et lisses

Forams - Amibes avec des pseudopodes filiformes et une coquille poreuse

Radiolaires - Amibes avec pseudopodes filiformes rayonnant du corps central

Algues rouges - Phycoérythrine (pigment accessoire)

Algues vertes - Chloroplastes de type végétal

Amoebozoans - Amibes avec pseudopodes en forme de lobe

Opisthokonts - Tonnes. (y compris les champignons et les animaux.)

Les plastes qui sont entourés de plus de deux membranes sont la preuve de

a) évolution à partir des mitochondries
b) fusion des plastes
c) origine des plastes des archées
d) endosymbiose secondaire
e) bourgeonnement des plastes à partir de l'enveloppe nucléaire.

Les biologistes soupçonnent que l'endosymbiose a donné lieu à des mitochondries avant les plastes en partie parce que

A) l'ADN mitochondrial est moins similaire à l'ADN procaryote que l'ADN plastidial
B) les produits de la photosynthèse ne pourraient pas être métabolisés sans enzymes mitochondriales
C) les protéines mitochondriales sont synthétisées sur les ribosomes cytosoliques, tandis que les plastes utilisent leurs propres ribosomes.
D) sans production de CO2 mitochondrial, la photosynthèse ne pourrait pas avoir lieu.
E) tous les eucaryotes ont des mitochondries (ou leurs restes) alors que de nombreux eucaryotes n'ont pas de plastes

Quel groupe est incorrectement associé à sa description ?

A) apicomplexans - parasites avec des cycles de vie complexes
B) diatomées - producteurs importants dans les communautés aquatiques
C) rhizarians - groupe morphologiquement diversifié défini par des similitudes d'ADN
D) diplomonades - protistes avec mitochondries modifiées
E) algues rouges - plastes acquis par endosymbiose secondaire

Sur la base de l'arbre phylogénétique de la figure ci-dessous, laquelle des affirmations suivantes est correcte ?

A) L'ancêtre commun le plus récent est plus ancien que celui de Chromalveolata
B) Le supergroupe eucaryote le plus basal (le premier à diverger) ne peut pas être déterminé
C) Excavata est le supergroupe eucaryote le plus basal.
D) L'ancêtre le plus récent de Chromalveolata est plus ancien que celui de Rhizaria
E) L'ancêtre commun le plus récent des algues rouges et des plantes terrestres est plus ancien que celui des nucléides et des champignons.

Quels protistes appartiennent au même supergroupe eucaryote que les plantes terrestres ?

A) algues vertes
B) les dinoflagellés
C) algues rouges
D) algues brunes
E) à la fois a et c

Dans les cycles de vie avec alternance de générations, les formes haploïdes multicellulaires alternent avec

A) formes diploïdes multicellulaires.
B) formes diploïdes unicellulaires.
C) formes polypoïdes multicellulaires.
D) formes haploïdes multicellulaires
E) formes haploïdes unicellulaires.